[發(fā)明專利]基于illumina平臺的乳腺癌分型檢測試劑盒及應用在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201810895547.0 | 申請日: | 2018-08-08 |
| 公開(公告)號: | CN109097467A | 公開(公告)日: | 2018-12-28 |
| 發(fā)明(設計)人: | 張吉保;張明航;岳偉 | 申請(專利權(quán))人: | 江蘇蘇博生物醫(yī)學科技南京有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6886 | 分類號: | C12Q1/6886;C12Q1/6869 |
| 代理公司: | 南京縱橫知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 32224 | 代理人: | 薛海霞;董建林 |
| 地址: | 210000 江蘇省南京*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 引物 分型檢測試劑 乳腺癌 鏈霉素 磁珠 降解 樣本 基因表達定量 生物技術領域 表達譜分析 測序試劑 傳統(tǒng)應用 磁性珠粒 磁珠包被 定量試劑 末端測序 隨機引物 熒光定量 生物素 微陣列 轉(zhuǎn)錄組 包被 測序 建庫 上機 文庫 應用 分析 | ||
1.基于illumina平臺的乳腺癌分型檢測試劑盒,其特征在于,該分型檢測試劑盒包括a)降解mRNA建庫試劑、引物及磁珠模塊;b)文庫定量試劑模塊;c)上機測序試劑模塊;所述的引物包括seq ID NO.1所示的Bio-B-TVN引物、seq ID NO.2所示的Primer-A隨機引物、seq ID NO.3所示的Primer-A引物、seq ID NO.4-6任意一個所示的Primer-B引物,磁珠為包被有鏈霉素的磁性珠粒,Bio-B-TVN引物上的生物素可與磁珠包被的鏈霉素相結(jié)合,Primer-B引物為帶有8堿基index的接頭序列。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于illumina平臺的乳腺癌分型檢測試劑盒,其特征在于,文庫定量試劑模塊所用到的定量試劑盒為VAHTS Library Quantification Kit forIllumina。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于illumina平臺的乳腺癌分型檢測試劑盒,其特征在于,上機測序試劑模塊所使用的測序試劑盒為NextSeq 500/550 Mid Output Kit v2,所用到的試劑溶液為0.2N的NaOH、200mM PH7的Tris-Cl。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的基于illumina平臺的乳腺癌分型檢測試劑盒,其特征在于,上機測序試劑模塊所用的軟件包為python package HTSeq、GSNAP aligner和DAVID工具包。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于illumina平臺的乳腺癌分型檢測試劑盒,其特征在于,降解mRNA建庫試劑、引物及磁珠模塊具體組成為:
。
6.如權(quán)利要求1-5任意一項所述的乳腺癌分型檢測試劑盒作為乳腺癌基因的表達譜差異分析和乳腺癌分型的試劑的應用。
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