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[發明專利]一種基于DNA組裝的恒溫條件下同時檢測多種microRNA的探針和方法有效

專利信息
申請號: 201810819681.2 申請日: 2018-07-24
公開(公告)號: CN109055524B 公開(公告)日: 2022-03-15
發明(設計)人: 戴宗;陳俊;呂品田;鄒小勇 申請(專利權)人: 中山大學
主分類號: C12Q1/6883 分類號: C12Q1/6883;C12N15/11;C12Q1/6816
代理公司: 廣州嘉權專利商標事務所有限公司 44205 代理人: 胡輝;舒勝英
地址: 510275 廣東省廣州市*** 國省代碼: 廣東;44
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: 一種 基于 dna 組裝 恒溫 條件下 同時 檢測 多種 microrna 探針 方法
【權利要求書】:

1.一種檢測microRNA的探針組,所述探針組包括Y-1n、Y-2n和熒光探針LP;探針Y-1n、Y-2n、LP和目標microRNA能夠自組裝形成穩定的“工”字形結構;

探針Y-1n中間的部分堿基與Y-2n中間的部分堿基反向互補配對,形成“工”字形中間部分的莖部序列;

探針Y-1n、Y-2n的另一部分堿基序列與目標microRNA的兩端序列分別反向互補配對,形成“工”字形一端的“一”字形頭部;

探針Y-1n、Y-2n中還存在能與熒光探針LP兩端序列分別發生反向互補配對的堿基序列,形成“工”字形另一端的“一”字形頭部;

熒光探針LP與目標microRNA不能配對結合;

熒光探針LP能被切刻內切酶切割;

熒光探針LP兩端分別連有報告熒光基團、淬滅熒光基團;

所述莖部序列中含有切刻內切酶的識別位點;

所述莖部序列的長度為7~9bp;

熒光探針LP的序列長度為10~18nt;

熒光探針LP被切刻內切酶切割后能從“工”字形結構中脫落。

2.根據權利要去1所述的探針組,其特征在于,當所述microRNA為miR-373、let-7a和miR-27a時,設計、合成的探針組如SEQ ID NO:2~4、SEQ ID NO:10~12、SEQ ID NO:14~16所示。

3.根據權利要求1或2所述的探針組,其特征在于,所述切刻內切酶包括Nt.BstNBI、Nt.BsmAI、Nt.AlwI。

4.一種非疾病診斷目的的檢測microRNA的方法,其特征在于,根據所有待檢測目標microRNA的序列,對所有目標microRNA分別設計、合成權利要求1~3任一項所述的探針組,將設計、合成的所有探針組、切刻內切酶與待檢測樣品混合,于35~50℃反應,然后測定各探針組中所帶熒光基團的熒光強度,根據熒光強度值以及相應標準曲線,計算樣品中各目標microRNA濃度。

5.根據權利要求4所述的方法,其特征在于,于35~50℃反應的時間為30~70min。

6.根據權利要求4所述的方法,其特征在于,切刻內切酶在整個反應體系中的濃度為0.36~0.7U/μL。

7.根據權利要求4所述的方法,其特征在于,當目標microRNA為miR-373、let-7a和miR-27a時,設計、合成的探針組如SEQ ID NO:2~4、SEQ ID NO:10~12、SEQ ID NO:14~16所示。

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