[發明專利]與癌癥相關的遺傳或分子畸變的檢測

有效

• 申請號: 201810817319.1
• 申請日: 2011-11-30
• 公開（公告）號: CN108899091B
• 公開（公告）日: 2022-04-15
• 發明（設計）人: 盧煜明;陳君賜;趙慧君;江培勇
• 申請（專利權）人: 香港中文大學
• 主分類號: G16H50/30
• 分類號: G16H50/30;G16B20/20;G16B20/30;G16B30/00;C12Q1/6886
• 代理公司: 北京英賽嘉華知識產權代理有限責任公司 11204
• 代理人: 王達佐;洪欣

本發明提供了用于測定來自有機體的生物樣品中的遺傳或分子畸變的系統、儀器和方法。對包括游離DNA片段的生物樣品進行分析，從而鑒別例如由于腫瘤染色體缺失和/或擴增導致的染色體區域中存在的失衡。多個基因座被用于各個染色體區域的分析。接著，此類失衡可以用于診斷(篩查)癌癥以及癌癥患者的預后，或者檢測患者惡化前的健康狀態或監測患者惡化前的健康狀態的變化。可以利用基因組失衡的嚴重性以及失衡區域的數量提供診斷，篩查，預后以及監測。非重疊染色體區段的系統性分析可以提供通用癌癥篩查手段。此外，可以在不同的時間點下對患者進行檢驗從而跟蹤一個或多個染色體區域以及眾多染色體區域中的每一個區域的嚴重性以及展現染色體畸變的染色體區域的數量，從而能夠進行癌癥的篩查、預后診斷以及監測病變進程(例如在治療后)。

相關申請的交叉引用

本申請要求2010年11月30日提交的題為“DETECTION OF GENETIC ABERRATIONSASSOCIATED WITH CANCER”的美國臨時申請No.61/418,391以及2011年8月31日提交的題為“DETECTION OF GENETIC OR MOLECULAR ABERRATIONS ASSOCIATED WITH CANCER”的美國臨時申請No.61/529,877的優先權，并且為它們的非臨時申請，就所有目的而言，這些申請的全部內容以引用方式并入本文。

本申請涉及2010年11月5日提交的題為“Size-Based Genomic Analysis”的共同擁有的美國專利申請No.12/940,992(美國公開2011/0276277)(Lo et al.)(代理人案卷號80015-794101/006610US)以及2010年11月5日提交的題為“Fetal Genomic Analysis FromA Maternal Biological Sample”的美國專利申請No.12/940,993(美國公開2011/0105353)(Lo et al.)(代理人案卷號80015-794103/006710US)，這些申請的公開內容以引用方式全部并入本文。

背景技術

癌癥是影響許多人的常見疾病。其通常直到嚴重癥狀出現時才會被發現。就常見類型的癌癥而言，目前雖然已存在一些癌癥篩查技術來判斷患者患有癌癥的可能性，但是此類癌癥篩查技術的可靠性和準確性通常是比較低，或者其需要讓患者接受較高劑量的輻射。就許多其他類型的癌癥而言，目前尚未存在有效的篩查技術。

在肺癌以及頭頸癌的患者的外周血DNA中，檢測到特定基因座的雜合性缺失(LOH)(Chen XQ,et al.Nat Med 1996；2:1033-5；Nawroz H,et al.Nat Med 1996；2:1035-7)。但是，可以檢測到的LOH相對量較少事實阻礙了此類技術用于檢測特定的基因座。即使在使用數字PCR，這些方法仍不能檢測到相對量較少的LOH。此外，此類技術仍局限于研究在特定癌癥類型中發生的已知的特定基因座。因此，不能或不能有效地將此類方法作為通用的手段去篩查各種癌癥。

除了篩查癌癥的存在與否存在局限性以外，目前的技術更不能有效地為癌癥患者提供預后診斷以及治療效果的監測(例如在手術、化療或免疫治療或靶向治療之后的恢復)。因為此類技術通常是價格昂貴(例如成像技術)、準確度低、效率低、敏感度低，并且如果應用成像技術，可能使患者受到輻射的影響。

因此，理想的發明是能夠有效地為癌癥患者提供篩查、預后和監測的新技術。

發明概述