[發明專利]一種與中華絨螯蟹性早熟性狀顯著相關的SNP位點及應用有效
| 申請號: | 201810794350.8 | 申請日: | 2018-07-19 |
| 公開(公告)號: | CN108753995B | 公開(公告)日: | 2021-07-02 |
| 發明(設計)人: | 徐宇;許志強;林海;鄧燕飛;李旭光;陸全平;潘建林 | 申請(專利權)人: | 江蘇省淡水水產研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/6888 | 分類號: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司: | 南京天華專利代理有限責任公司 32218 | 代理人: | 傅婷婷;瞿網蘭 |
| 地址: | 210017 *** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 中華 絨螯蟹 性早熟 性狀 顯著 相關 snp 應用 | ||
1.一種預測中華絨螯蟹性早熟風險的方法,其特征在于通過檢測與中華絨螯蟹性早熟性狀顯著相關的SNP位點,所述的SNP位點GG基因型中華絨螯蟹個體出現性早熟性狀的風險顯著低于TT基因型個體,從而預測中華絨螯蟹性早熟風險;所述的SNP位點位于SEQ IDNO.5所示中華絨螯蟹Vg基因片段的第46bp處。
2.根據權利要求1所述的方法,其特征在于提取不同中華絨螯蟹個體的基因組DNA,采用以PCR為基礎的限制性片段長度多態法PCR-RFLP對不同個體進行基因分型,所述的SNP位點GG基因型中華絨螯蟹個體出現性早熟性狀的風險顯著低于TT基因型個體,從而預測中華絨螯蟹性早熟風險。
3.根據權利要求2所述的方法,其特征在于所述的PCR-RFLP中使用的PCR上游引物為SEQ ID NO.1,下游引物為SEQ ID NO.2;使用的限制性內切酶為MboI限制性內切酶。
4.根據權利要求2所述的方法,其特征在于提取不同中華絨螯蟹個體的基因組DNA,PCR擴增含有所述SNP位點的基因片段,通過直接測序獲得所述SNP位點的序列,從而預測中華絨螯蟹性早熟風險;其中PCR擴增上游引物為SEQ ID NO.1,下游引物為SEQ ID NO.2。
5.用于檢測權利要求1中所述的SNP位點的PCR引物,其特征在于上游引物為SEQ IDNO.1,下游引物為SEQ ID NO.2。
6.權利要求5所述的PCR引物在預測中華絨螯蟹性早熟風險和/或中華絨螯蟹品種選育中的應用。
7.一種預測中華絨螯蟹性早熟風險的試劑盒,其特征在于包含權利要求5所述的PCR引物。
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