[發明專利]一種環介導等溫擴增技術檢測奶粉中志賀氏菌的方法在審
| 申請號: | 201810778035.6 | 申請日: | 2018-07-16 |
| 公開(公告)號: | CN108866163A | 公開(公告)日: | 2018-11-23 |
| 發明(設計)人: | 吳冰;邱霞;蕭綺倩;張任廣;鄭傳發;吉宇恒 | 申請(專利權)人: | 中山出入境檢驗檢疫局檢驗檢疫技術中心 |
| 主分類號: | C12Q1/6844 | 分類號: | C12Q1/6844;C12Q1/689;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/01 |
| 代理公司: | 廣州新諾專利商標事務所有限公司 44100 | 代理人: | 羅毅萍 |
| 地址: | 528400 廣東省中*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 環介導等溫擴增技術 志賀氏菌 檢測 準確度 制備 奶粉 瓊脂糖凝膠電泳法 內引物FIP/BIP 細菌基因組 反應條件 擴增產物 判斷結果 人工污染 特異性強 脫脂奶粉 環引物 檢出限 靈敏度 目測法 外引物 菌液 擴增 熱裂 引物 合成 | ||
1.一種環介導等溫擴增技術檢測奶粉中志賀氏菌的方法,其特征在于,包括以下步驟:
S1、環介導等溫擴增技術(LAMP)引物的設計與合成:
根據志賀氏菌ipaH基因(GenBank登錄號:HE616529.1),并用生物學在線軟件分析該基因的保守核苷酸序列,針對ipaH基因的保守區域,結合環介導等溫擴增方法的引物設計原則,利用Primer Explorer V4在線引物設計軟件篩選并合成LAMP引物:內引物FIP/BIP、外引物F3/B3、環引物LF/LB;
S2、DNA模板的制備:
制備志賀氏菌菌液,人工污染脫脂奶粉樣品,將污染樣品梯度稀釋,采用熱裂解法提取細菌基因組,得到不同濃度的DNA模板溶液;
S3、樣品的LAMP檢測:
取步驟S2所得不同濃度的DNA模板分別加入步驟S1所得內引物FIP/BIP、外引物F3/B3、環引物LF/LB在LAMP反應體系及反應條件下進行擴增,分別取擴增產物通過直接目測法或瓊脂糖凝膠電泳法,判斷結果。
2.根據權利要求1所述的環介導等溫擴增技術檢測奶粉中志賀氏菌的方法,其特征在于,步驟S1所得LAMP引物包括:內引物FIP為TCCGCGACACGTTCCCTCTATTGTCAGTACGCTTCGCC,內引物BIP為TGCCGATTTGAAGGCCGGTACACCGTGGTCCGTTCTGAA,外引物F3為ACTCTCCCAGTGTGCTTTGAT,外引物B3為CTTTTCGTGAAAAATTGAAA,環引物LF為TGGCATGCTTTGAACAGATAA,環引物LB為TATTGAGTTCGTTCTAATCAACT。
3.根據權利要求1所述的環介導等溫擴增技術檢測奶粉中志賀氏菌的方法,其特征在于,步驟S2包括:將志賀氏菌接種于R&F志賀氏菌屬顯色培養基,37℃培養16-24h,再挑取單菌落于LB培養液中,37℃、200r/min條件下,振蕩培養16-48h,得到所述志賀氏菌菌液。
4.根據權利要求3所述的環介導等溫擴增技術檢測奶粉中志賀氏菌的方法,其特征在于,步驟S2包括:將所得志賀氏菌菌液接種到脫脂奶粉樣品中,10倍梯度稀釋所述污染樣品,使所述污染樣品中志賀氏菌的濃度依次為100、101、102、103、104、105、106、107、108CFU/mL,再分別取1.0mL所述污染樣品,10000-12000r/min離心2-5min,滅菌蒸餾水洗滌兩次,再用300μL TE緩沖液懸浮,隔水煮沸10-20min,8000-10000r/min離心10-20min,取上清液,得到不同濃度的所述DNA模板溶液。
5.根據權利要求1所述的環介導等溫擴增技術檢測奶粉中志賀氏菌的方法,其特征在于,步驟S3包括:所述LAMP反應體系(25μL)為:2.5μL 10×ThermoPol緩沖液,1.5μL MgSO4,3μL引物,3.5μL dNTPs,2.5μL甜菜堿,1μL Bst 2.0DNA聚合酶,2μL DNA模板,1μL鈣黃綠素,8μL ddH2O。
6.根據權利要求5所述的環介導等溫擴增技術檢測奶粉中志賀氏菌的方法,其特征在于:3μL所述引物包括1μL的20μmol/L內引物FIP/BIP、1μL的10μmol/L外引物F3/B3、1μL的15μmol/L環引物LF/LB。
7.根據權利要求5所述的環介導等溫擴增技術檢測奶粉中志賀氏菌的方法,其特征在于,步驟S3包括:所述LAMP反應條件為:將配備好的所述LAMP反應體系于60-65℃恒溫水浴擴增30-60min,再75-85℃使所述Bst 2.0DNA聚合酶失活。
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