[發明專利]一種與蘇淮豬肌內脂肪含量相關的SNP標記引物對及其應用

在審

• 申請號: 201810757692.2
• 申請日: 2018-07-11
• 公開（公告）號: CN108949907A
• 公開（公告）日: 2018-12-07
• 發明（設計）人: 黃瑞華;王彬彬;李平華;周五朵;蒲廣;王歡;蘭亭旭;張倩;高琛;牛培培;張總平;李強
• 申請（專利權）人: 南京農業大學
• 主分類號: C12Q1/6806
• 分類號: C12Q1/6806;C12Q1/6888;C12Q1/6869;C12N15/11
• 代理公司: 南京天華專利代理有限責任公司 32218
• 代理人: 傅婷婷;徐冬濤

1.一種開發與蘇淮豬肌內脂肪性狀相關的分子標記的方法，其特征在于以含有國際豬基因組11.1版本參考序列豬14號染色體rs80912566核苷酸位點的核苷酸序列為基礎序列，設計引物對，以蘇淮豬基因組DNA為模板進行PCR擴增，使國際豬基因組11.1版本參考序列豬14號染色體rs80912566核苷酸位點轉化為分子標記。

2.根據權利要求1所述的方法，其特征在于所述的引物對序列為上游引物：SEQ ID NO：2，下游引物：SEQ ID NO：3。

3.按照權利要求1或2所述的方法得到的分子標記。

4.根據權利要求3所述的分子標記，其特征在于所述的分子標記序列如SEQ ID NO：1所示，所述的國際豬基因組11.1版本參考序列豬14號染色體rs80912566核苷酸位點在SEQ IDNO：1中位于第288位，存在C/T多態性。

5.一種用于檢測與蘇淮豬肌內脂肪性狀相關的SNP標記的引物對，其特征在于上游引物為：SEQ ID NO：2，下游引物為：SEQ ID NO：3；所述的與蘇淮豬肌內脂肪性狀相關的SNP標記位于豬14號染色體上的SCD基因的核苷酸序列上，所述SNP標記的位點為國際豬基因組11.1版本參考序列豬14號染色體rs80912566核苷酸位點的分子標記,且具有C/T多態性，所述SNP標記與蘇淮豬肌內脂肪含量顯著相關。

6.一種檢測權利要求5中所述的與蘇淮豬肌內脂肪性狀相關的SNP標記的方法，其特征在于包含PCR擴增蘇淮豬國際豬基因組11.1版本參考序列豬14號染色體rs80912566核苷酸位點的一段序列，對擴增產物進行測序，判讀該位點的C/T多態性。

7.根據權利要求6所述的方法，其特征在于包括以下步驟：

(1)取蘇淮豬組織樣品提取總DNA；

(2)用已提取的蘇淮豬基因組DNA為模板，使用權利要求5所述的引物對進行PCR擴增；

(3)擴增產物進行測序，分析測序結果，判讀在SEQ ID NO：1第288位的C/T多態性。

8.權利要求3或4所述的分子標記、權利要求5所述的引物對在篩選高肌內脂肪蘇淮豬群體中的應用。

9.一種篩選高肌內脂肪蘇淮豬群體的方法，其特征在于包括檢測蘇淮豬國際豬基因組11.1版本參考序列豬14號染色體rs80912566核苷酸位點的基因型，選育rs80912566核苷酸位點的TT型個體優先作為種豬。