[發明專利]檢測鼻腔脫落細胞中CLC基因表達量的方法及應用在審
| 申請號: | 201810719334.2 | 申請日: | 2018-07-03 |
| 公開(公告)號: | CN108977510A | 公開(公告)日: | 2018-12-11 |
| 發明(設計)人: | 張羅;王成碩;閆冰;劉暢 | 申請(專利權)人: | 張羅;王成碩;閆冰;北京市耳鼻咽喉科研究所;首都醫科大學附屬北京同仁醫院 |
| 主分類號: | C12Q1/6851 | 分類號: | C12Q1/6851;C12Q1/6883 |
| 代理公司: | 北京智匯東方知識產權代理事務所(普通合伙) 11391 | 代理人: | 康正德;陳智勇 |
| 地址: | 100730 北*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 基因表達量 脫落細胞 鼻腔 特異性引物 內參基因 基因 定量聚合酶鏈反應 實時熒光定量PCR 總RNA逆轉錄 生物標志物 檢測結果 擴增產物 有效獲取 有效篩選 提取RNA 種檢測 檢測 擴增 應用 診斷 | ||
1.一種檢測鼻腔脫落細胞中CLC基因表達量的方法,其特征在于:包括以下步驟:從鼻腔脫落細胞中提取RNA,將總RNA逆轉錄為cDNA,采用定量聚合酶鏈反應將cDNA中的CLC基因和內參基因分別采用CLC基因的特異性引物和內參基因的特異性引物進行實時熒光定量PCR擴增,基于擴增產物的檢測結果計算CLC基因表達量。
2.根據權利要求1所述的檢測鼻腔脫落細胞中CLC基因表達量的方法,其特征在于:CLC基因的上游引物如SEQ ID NO:2所示,CLC基因的下游引物如SEQ ID NO:3所示;
所述內參基因為GAPDH,所述內參基因的上游引物如SEQ ID NO:4所示,所述下游引物如SEQ ID NO:5所示。
3.根據權利要求1所述的檢測鼻腔脫落細胞中CLC基因表達量的方法,其特征在于:所述鼻腔脫落細胞采用毛刷于鼻息肉表面獲取,且將獲取鼻腔脫落細胞后的毛刷置于細胞裂解液中于4℃以下保存。
4.根據權利要求1所述的檢測鼻腔脫落細胞中CLC基因表達量的方法,其特征在于:從鼻腔脫落細胞中提取RNA的方法,包括以下步驟:
步驟1:將所述鼻腔脫落細胞溶解于100~2000μL細胞裂解液中,并加入等體積的乙醇,混合均勻后加入至RNA純化柱中,離心處理后,除去濾液,將所述RNA純化柱置于收集管中;
步驟2:向步驟1中獲取的所述RNA純化柱中加入300μL~700μL的第一緩沖液,離心處理后,除去第一濾液;繼續向所述RNA純化柱加入400μL~800μL第二緩沖液,離心處理后,除去第二濾液,取RNA純化柱經洗脫得到RNA。
5.根據權利要求4所述的檢測鼻腔脫落細胞中CLC基因表達量的方法,其特征在于:從鼻腔脫落細胞中提取RNA的方法,還包括以下步驟:向除去所述第二濾液后的RNA純化柱中添加10~100μLDNA酶反應液,經靜置處理后,加入300μL~700μL所述第二緩沖液,離心處理后,除去第三濾液,取RNA純化柱經洗脫后采用分光光度計測量RNA純度,得到RNA;
所述DNA酶反應液的制備方法包括以下步驟:取DNA酶緩沖液、重組DNA酶,去RNA酶的雙蒸水經混合得到DNA酶反應液。
6.根據權利要求4所述的檢測鼻腔脫落細胞中CLC基因表達量的方法,其特征在于:從鼻腔脫落細胞中提取RNA的方法,還包括以下步驟:所述步驟1中,所述鼻腔脫落細胞溶解于細胞裂解液中后先加入至基因組DNA吸附柱中取濾液,再向所述濾液中加入等體積的乙醇。
7.根據權利要求4~6任一項所述的檢測鼻腔脫落細胞中CLC基因表達量的方法,其特征在于:從鼻腔脫落細胞中提取RNA的方法,還包括以下步驟:取待洗脫的RNA純化柱加入去RNA水解酶的蒸餾水或焦碳酸二乙酯處理水,室溫靜置后,經離心處理、洗脫所述RNA純化柱,采用分光光度計測量RNA純度,得到RNA。
8.根據權利要求1所述的檢測鼻腔脫落細胞中CLC基因表達量的方法,其特征在于:從鼻腔脫落細胞中提取RNA的方法,包括以下步驟:向裝有鼻腔脫落細胞的離心管中加入0.1mL~20mLRNA抽提液進行溶解、振蕩后加入所述RNA抽提液體積的0.1~0.5倍的氯仿,震蕩混勻,室溫靜置,將所述離心管離心,取上清液,加入所述氯仿體積的0.5~3倍的異丙醇,混勻后靜置、離心,棄上清,保留第一沉淀,向所述第一沉淀中加入所述異丙醇體積的0.5~5倍的濃度65%~90%的乙醇,經洗滌后混勻、離心,棄上清,保留第二沉淀;蓋緊離心管,再次離心,除去上清液,繼續向所述離心管中加入0.01~5mL去RNA酶及去DNA酶的水溶解所述第二沉淀,采用分光光度計測量RNA純度,得到RNA;
所述RNA抽提液為Trizol、RNAiso Blood、RNAiso Plus或其它含有苯酚、異硫氰酸胍、8-羥基喹啉、異硫氰酸胍和β-巰基乙醇中的任一種或幾種的試劑。
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