[發明專利]用于鑒定銹赤扁谷盜的實時熒光PCR引物及探針在審
| 申請號： | 201810607685.4 | 申請日： | 2018-06-13 |
| 公開（公告）號： | CN110592229A | 公開（公告）日： | 2019-12-20 |
| 發明（設計）人： | 李志紅;陳冬旭 | 申請（專利權）人： | 中國農業大學 |
| 主分類號： | C12Q1/6888 | 分類號： | C12Q1/6888;C12Q1/686;C12N15/11 |
| 代理公司： | 11245 北京紀凱知識產權代理有限公司 | 代理人： | 關暢;張立娜 |
| 地址： | 100193 *** | 國省代碼： | 北京;11 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 引物 銹赤扁谷盜 探針 實時熒光PCR 特異性強 近緣種 靈敏度 扁谷 耗時 直觀 研究 | ||
1.用于鑒定銹赤扁谷盜的組合物，由一個引物對和一個探針組成的組合物；所述引物對由引物1和引物2組成，所述引物1的序列如SEQ ID No.1所示，所述引物2的序列如SEQ IDNo.2所示；所述探針的序列為SEQ ID No.3。
2.用于鑒定銹赤扁谷盜的探針，其特征在于：所述探針的序列為SEQ ID No.3。
3.根據權利要求1所述的組合物或權利要求2所述的探針，其特征在于：所述探針的5’端標記有報告熒光染料A，3’端標記有淬滅熒光染料B。
4.根據權利要求3所述的組合物或探針，其特征在于：所述報告熒光染料A為FAM；所述淬滅熒光染料B為BHQ。
5.用于鑒定銹赤扁谷盜的試劑，由權利要求1-4中任一所述的組合物或探針、TaqMan探針熒光PCR擴增緩沖液和水組成。
6.根據權利要求5所述的試劑，其特征在于：所述試劑中還含有參比染料；
具體的，所述參比染料為ROX參比染料。
7.用于鑒定銹赤扁谷盜的試劑盒，其特征在于：所述試劑盒含有權利要求1-4中任一所述的組合物或探針或權利要求5或6所述的試劑。
8.如下任一所示應用：
(a1)權利要求1-4中任一所述的組合物或探針在制備權利要求5或6所述的試劑或權利要求7所述的試劑盒中的應用；
(a2)權利要求1-4中任一所述的組合物或探針或權利要求5或6所述的試劑或權利要求7所述的試劑盒在鑒定銹赤扁谷盜中的應用。
9.一種鑒定或輔助鑒定待測扁谷盜是否為銹赤扁谷盜的方法，包括如下步驟：
(b1)以待測扁谷盜的基因組DNA為模板，用權利要求1-4中任一所述的組合物進行TaqMan探針熒光PCR反應；
(b2)根據所述TaqMan探針熒光PCR反應的擴增曲線，按照如下確定所述待測扁谷盜是否為銹赤扁谷盜：如果所述待測扁谷盜的Ct值小于等于30，則所述待測扁谷盜為或候選為銹赤扁谷盜；反之，則所述待測扁谷盜不為或候選不為銹赤扁谷盜；所述Ct值所對應的熒光閾值為0.2。
10.根據權利要求9所述的方法，其特征在于：進行所述TaqMan探針熒光PCR反應的退火溫度為60℃。
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