[發明專利]柑橘鱗皮病毒的RT-LAMP檢測試劑盒和方法在審
| 申請號: | 201810596969.8 | 申請日: | 2018-06-11 |
| 公開(公告)號: | CN108441582A | 公開(公告)日: | 2018-08-24 |
| 發明(設計)人: | 曹孟籍;李敏;李中安 | 申請(專利權)人: | 西南大學 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12R1/94 |
| 代理公司: | 重慶市前沿專利事務所(普通合伙) 50211 | 代理人: | 鄒曉艷 |
| 地址: | 400715*** | 國省代碼: | 重慶;50 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 鱗皮 柑橘 試劑盒 病毒 總RNA 擴增 引物 | ||
本發明公開了一種柑橘鱗皮病毒的RT?LAMP檢測試劑盒,包括引物對F3?5/B3?5和FIP3?5/BIP3?5,序列為:F3?5:5’?CTTTGAGTCCATCAACTGTT?3’,B3?5:5’?TCACTCTGAAGCTGACAT?3’,FIP?5:5’?GGTGAAGGACCAACTAGGACGTTGCTGAAATCTGCCTC?3’,BIP?5:5’?GAAACCCCTTGTTCTTGTCGGGTGCTATAATTTACAGCCTCA?3’。還公開了柑橘鱗皮病毒的RT?LAMP檢測方法,提取樣品總RNA,利用前述試劑盒進行RT?LAMP擴增,58~68℃擴增40~80min。
技術領域
本發明屬于分子生物學技術領域,具體涉及一種柑橘鱗皮病毒的RT-LAMP檢測試劑盒和方法。
背景技術
柑橘鱗皮病毒(Citrus psorosis virus,CPsV)是一種對柑橘具有毀滅性的病害,該病自20世紀90年代在美國佛羅里達州和加利福尼亞州被首次發現以來,相繼在阿根廷、西班牙、埃及、意大利等國家廣泛發生(Roistacher,1993)。柑橘鱗皮病主要危害甜橙、葡萄柚和寬皮柑橘,可引起寄主主干和大枝典型的樹皮鱗片狀開裂癥狀,并伴隨木質部導管充膠變色,感染該病毒的樹木產量只有健康樹木產量的28%(Achachi et al.,2014)。柑橘鱗皮病主要通過嫁接進行傳播(Martín et al.,2002),卵菌亞綱的油壺菌也可以傳播CPsV(Palle et al.,2005;Vaira et al.,2007,2009)。柑橘鱗皮病有鱗皮病A(PsA)和鱗皮病B(PsB)兩種類型,其中以PsA最為常見。PsA可引起植株主干樹皮鱗片化開裂,木質部導管充膠變色。PsB的危害比PsA嚴重,主要引起嫰枝充膠,樹皮大面積開裂,老葉上形成變色環斑,有時沿葉脈可見褪綠斑紋(Velázque et al.,2012),10-20樹齡的樹木較易出現樹皮鱗皮狀開裂(Achachi et al.,2014)。
在田間樣品大規模檢測過程中發現我國田間有該病毒的分布,而目前關于CPsV的檢測主要是通過ELISA、分子雜交,RT-PCR和免疫電鏡等方法(Martín et al.,2004;Achachi et al.,2015),其中RT-PCR的方法需要昂貴的檢測儀器,且靈敏度需要進一步的提高;ELISA、分子雜交和免疫電鏡的方法操作費事,且靈敏度低。環介導等溫核酸擴增(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技術是采用4條特異引物和DNA鏈置換聚合酶(Bst DNApolymerase)在恒溫條件下建立的一種新型的分子檢測技術(Notomi etal.,2000),現已廣泛的應用于各種病原微生物的檢測(Okuda et al.,2015;Rudolph etal.,2015;Warghane et al.,2017;Lu et al.,2018)。
發明內容
針對上述技術問題,本發明旨在提供一種簡單、方便、快捷、靈敏度高的柑橘鱗皮病毒的RT-LAMP檢測試劑盒和方法。
為此,本發明所采用的技術方案為:
一種柑橘鱗皮病毒的RT-LAMP檢測試劑盒,包括外引物對F3-5/B3-5和內引物對FIP3-5/BIP3-5,所述內、外引物對的序列為:
F3-5:5’-CTTTGAGTCCATCAACTGTT-3’,
B3-5:5’-TCACTCTGAAGCTGACAT-3’,
FIP-5:5’-GGTGAAGGACCAACTAGGACGTTGCTGAAATCTGCCTC-3’,
BIP-5:5’-GAAACCCCTTGTTCTTGTCGGGTGCTATAATTTACAGCCTCA-3’。
在上述技術方案中,還包括LAMP Kit。
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