[發明專利]一種雜交鵝掌楸親緣關系的鑒定方法有效
| 申請號: | 201810543423.6 | 申請日: | 2018-05-29 |
| 公開(公告)號: | CN108660196B | 公開(公告)日: | 2019-09-10 |
| 發明(設計)人: | 陳金慧;龍曉飛;施季森;成鐵龍;肖保榮;劉思芹;翁禹豪;胡凌峰;劉陽 | 申請(專利權)人: | 南京林業大學 |
| 主分類號: | C12Q1/686 | 分類號: | C12Q1/686;C12Q1/6895 |
| 代理公司: | 南京申云知識產權代理事務所(普通合伙) 32274 | 代理人: | 邱興天 |
| 地址: | 210037 *** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 母本 雜交鵝掌楸 特異性擴增 引物 親緣關系 種源 專用試劑盒 特異擴增 幼苗階段 葉片DNA | ||
1.一種雜交鵝掌楸親緣關系鑒定方法,其特征在于,包括以下步驟:
1)提取后代樹種的葉片DNA;
2)進行PCR檢測;
3)用引物18.2能特異性擴增出400bp的產物的母本為中國鵝掌楸,能特異性擴增出382bp的產物母本為北美鵝掌楸;
4)再用引物700對已鑒別為母本為中國鵝掌楸的進行PCR擴增,能特異性擴增出700bp產物的母本為中國鵝掌楸西部種源,能特異擴增出242bp產物的母本則為中國鵝掌楸東部種源;對已鑒別為母本為北美鵝掌楸的用引物700進行PCR擴增,均特異獲得700bp的產物。
2.根據權利要求1所述的雜交鵝掌楸親緣關系的鑒定方法,其特征在于,步驟1)中,葉片為剛展開的嫩葉,液氮處理后放置-80℃備用。
3.根據權利要求1所述的雜交鵝掌楸親緣關系鑒定方法,其特征在于,步驟2)中,DNA提取采用CTAB法進行。
4.根據權利要求1所述的雜交鵝掌楸親緣關系鑒定方法,其特征在于,步驟3)中,PCR擴增的10μL體系為:75ng基因組DNA,1.0μL 10×PCR Buffer,1.2μL 2.5mM·L-1MgCl,0.2μL10mM·L-1dNTP,0.5μL 10μM·L-1引物18.2左端引物,0.5μL 10μM·L-1引物18.2右端引物和0.5個單位Taq酶,ddH2O補足10μL,其中,引物18.2左端引物序列為:AATTCTCTCAATTTCACTTTGCCT;引物18.2右端引物序列為:TGGTCGATGCATTCTGTTTCT。
5.根據權利要求1所述的雜交鵝掌楸親緣關系鑒定方法,其特征在于,步驟3)中,采用Touch-downPCR擴增程序:95℃預變性4min,94℃變性15s,60℃(△=-1℃)復性30s,72℃延伸30s,6個循環;94℃變性15s,55℃復性30s,72℃延伸30s,24個循環,72℃延伸10min,4℃保存。
6.根據權利要求1所述的雜交鵝掌楸親緣關系鑒定方法,其特征在于,步驟4)中,10μLPCR擴增的體系為:75ng基因組DNA,1.0μL 10×PCR Buffer,1.2μL 2.5mM·L-1MgCl,0.2μL10mM·L-1dNTP,0.5μL 10μM·L-1引物700左端引物,0.5μL 10μM·L-1引物700右端引物和0.5個單位Taq酶,ddH2O補足10μL,其中,引物700左端序列為:TATGGTATATTCTATTCGGTT;引物700右端序列為:TCATTCCAATTCTACCGAT。
7.根據權利要求1所述的雜交鵝掌楸親緣關系鑒定方法,其特征在于,步驟4)中,采用Touch-downPCR擴增程序為:95℃預變性4min,94℃變性15s,58℃(△=-1℃)復性30s,72℃延伸45s,6個循環;94℃變性15s,55℃復性30s,72℃延伸45s,24個循環,72℃延伸10min,4℃保存。
8.權利要求1所述的雜交鵝掌楸親緣關系鑒定方法的專用試劑盒,其特征在于,至少包括用量為1次以上的引物試劑,所述的引物試劑的引物序列為:引物18.2左端引物序列為:AATTCTCTCAATTTCACTTTGCCT;引物18.2右端引物序列為:TGGTCGATGCATTCTGTTTCT;引物700左端序列為:TATGGTATATTCTATTCGGTT;引物700右端序列為:TCATTCCAATTCTACCGAT。
9.根據權利要求8所述的專用試劑盒,其特征在于,還包括DNA標樣試劑、DNA提取試劑、電泳試劑中的一種以上;所述的DNA標樣至少包含242bp、382bp、400bp以及700bp四個條帶。
10.權利要求8或9所述的專用試劑盒在雜交鵝掌楸親緣關系鑒定中的應用。
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