[發(fā)明專利]一種用于檢測卵巢癌基因多態(tài)性位點的引物及其檢測方法

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• 申請?zhí)枺?/td>: 201810530234.5
• 申請日: 2018-05-29
• 公開（公告）號: CN108504741A
• 公開（公告）日: 2018-09-07
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 陳思翔;張蓉;黃曉霞;孫正周
• 申請（專利權(quán)）人: 成都中創(chuàng)清科醫(yī)學(xué)檢驗所有限公司
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;C12Q1/6869;C12N15/11
• 代理公司: 成都正華專利代理事務(wù)所(普通合伙) 51229
• 代理人: 李林合

本發(fā)明公開了一種用于檢測卵巢癌基因多態(tài)性位點的引物及其檢測方法。該引物的具體序列見SEQ ID NO.1～8，其方法包括以下步驟：(1)提取受檢者全基因組DNA；(2)以步驟(1)中所得DNA為模板，采用上述引物對其進(jìn)行PCR擴(kuò)增；(3)回收擴(kuò)增產(chǎn)物，并進(jìn)行濃度測定，計算模板量，再次進(jìn)行PCR擴(kuò)增并對擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行純化，最后通過序列分析儀對SNP分型進(jìn)行分析確定。本發(fā)明提供了一種用于檢測卵巢癌易感基因多態(tài)性位點的引物，設(shè)計的引物特異性高、準(zhǔn)確性好，能通過檢測結(jié)果預(yù)測受檢者患卵巢癌的風(fēng)險幾率，對卵巢癌的預(yù)測和預(yù)防具有重大意義。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明屬于基因工程技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及一種用于檢測卵巢癌基因多態(tài)性位點的引物及其檢測方法。

背景技術(shù)

卵巢癌(ovarian cancer,LCI)是女性生殖器官常見的惡性腫瘤之一，發(fā)病率僅次于子宮頸癌和子宮體癌而列居第三位。但卵巢上皮癌死亡率卻占各類婦科腫瘤的首位，對婦女生命造成嚴(yán)重威脅。由于卵巢的胚胎發(fā)育、組織解剖及內(nèi)分泌功能較復(fù)雜，早期癥狀不典型，術(shù)前鑒別卵巢腫瘤的組織類型及良惡性相當(dāng)困難。卵巢惡性腫瘤中以上皮癌最多見，其次是惡性生殖細(xì)胞腫瘤。卵巢上皮癌受檢者手術(shù)中發(fā)現(xiàn)腫瘤局限于卵巢的僅占30％，大多數(shù)已擴(kuò)散到子宮，雙側(cè)附件，大網(wǎng)膜及盆腔各器官，所以在早期診斷上是一大難題。因此，卵巢癌早期的預(yù)測預(yù)防和早期診斷對卵巢癌的防治有著重大意義。

約20％的卵巢惡性腫瘤病人有家族史。有三種遺傳性卵巢癌綜合征，主要是上皮性的，可使有些婦女有極高的患病危險。沒有卵巢癌家族史的婦女，其一生的患病危險為1/70，若有1名一級親屬患病，危險增加至5％；若有2名一級親屬患病，危險為7％；若有遺傳性卵巢癌綜合征的一級親屬，則危險高達(dá)50％，并隨年齡增長而危險增加。疾病的遺傳易感基因檢測是當(dāng)前國內(nèi)外的熱點。而在遺傳因素的易感基因檢測中，采用單核苷酸多態(tài)性(Single Nucleotide Polymorphsm,SNP)作為基因組標(biāo)志的關(guān)聯(lián)分析方法較為有效和常用。SNP是指基因組水平上由單個核苷酸變異引起的DNA序列多態(tài)性，在人群中的發(fā)生頻率大于千分之一。它是人類可遺傳的變異中最常見的一種，占所有已知多態(tài)性的90％以上。SNP遺傳穩(wěn)定性強，易于檢測。位于基因內(nèi)部的SNP能直接影響到蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)或表達(dá)水平，進(jìn)而影響到組織、器官乃至生理功能。在卵巢癌人群和正常對照人群中進(jìn)行SNP對比分析，可以確定相關(guān)基因多態(tài)性與疾病患病風(fēng)險的關(guān)系。通過受檢者的血液對卵巢癌易感基因中的關(guān)鍵性基因的遺傳位點進(jìn)行檢測，能有效地為卵巢癌的預(yù)測、預(yù)防提供依據(jù)和指導(dǎo)。

發(fā)明內(nèi)容

針對現(xiàn)有技術(shù)中的上述不足，本發(fā)明提供一種用于檢測卵巢癌基因多態(tài)性位點的引物及其檢測方法，通過受檢者的血液對卵巢癌易感基因中的關(guān)鍵性基因的遺傳位點進(jìn)行檢測，能有效地為卵巢癌的預(yù)測、預(yù)防提供依據(jù)和指導(dǎo)。

為實現(xiàn)上述目的，本發(fā)明解決其技術(shù)問題所采用的技術(shù)方案是：

一種用于檢測卵巢癌基因多態(tài)性位點的引物，引物包括rs2276109位點的引物、rs2252070位點的引物、rs11782652位點的引物以及rs757210位點的引物，各引物的具體序列如下：

rs2276109-上游引物：5′-TGTCCATACTTACTTCACCA-3′；(SEQ ID NO.1)

rs2276109-下游引物：5′-TCTCCTTCTCTTTTAGTTGC-3′；(SEQ ID NO.2)

rs2252070-上游引物：5′-TGGCAAGATACTCTACCTCT-3′；(SEQ ID NO.3)

rs2252070-下游引物：5′-CTTCAGGTAGACACAAGACA-3′；(SEQ ID NO.4)

rs11782652-上游引物：5′-ATGAAAGGCACCACATT-3′；(SEQ ID NO.5)