[發明專利]一種用于檢測卵巢癌基因多態性位點的引物及其檢測方法在審
| 申請號: | 201810530234.5 | 申請日: | 2018-05-29 |
| 公開(公告)號: | CN108504741A | 公開(公告)日: | 2018-09-07 |
| 發明(設計)人: | 陳思翔;張蓉;黃曉霞;孫正周 | 申請(專利權)人: | 成都中創清科醫學檢驗所有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6886 | 分類號: | C12Q1/6886;C12Q1/6869;C12N15/11 |
| 代理公司: | 成都正華專利代理事務所(普通合伙) 51229 | 代理人: | 李林合 |
| 地址: | 610041 四川省成都市中國(四川)自*** | 國省代碼: | 四川;51 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 卵巢癌 引物 檢測 基因多態性位點 擴增產物 全基因組DNA 多態性位點 序列分析儀 引物特異性 檢測結果 濃度測定 易感基因 重大意義 預測 回收 預防 分析 | ||
1.一種用于檢測卵巢癌基因多態性位點的引物,其特征在于,所述引物包括rs2276109位點的引物、rs2252070位點的引物、rs11782652位點的引物以及rs757210位點的引物,各引物的具體序列如下:
rs2276109-上游引物:5′-TGTCCATACTTACTTCACCA-3′;
rs2276109-下游引物:5′-TCTCCTTCTCTTTTAGTTGC-3′;
rs2252070-上游引物:5′-TGGCAAGATACTCTACCTCT-3′;
rs2252070-下游引物:5′-CTTCAGGTAGACACAAGACA-3′;
rs11782652-上游引物:5′-ATGAAAGGCACCACATT-3′;
rs11782652-下游引物:5′-GATCATTCTTACCCATTCC-3′;
rs757210-上游引物:5′-TGTGAACAGACACAATAACG-3′;
rs757210-下游引物:5′-CTGAAGGGAAGTAGAGAAGA-3′。
2.一種檢測卵巢癌基因多態性位點的方法,其特征在于,包括以下步驟:
(1)提取受檢者全基因組DNA;
(2)以步驟(1)中所得DNA為模板,采用權利要求1中所述引物對其進行PCR擴增;
(3)回收擴增產物,并進行濃度測定,計算模板量,再次進行PCR擴增并對擴增產物進行純化,最后通過序列分析儀對SNP分型進行分析確定。
3.根據權利要求2所述的檢測卵巢癌基因多態性位點的方法,其特征在于,步驟(2)中所述PCR擴增的擴增體系為:Primer STAR MAX 12.5μL、Primer F1.5μL、Primer R 1.5μL、DNA 2μL,最后用H2O補足至25μL。
4.根據權利要求2所述的檢測卵巢癌基因多態性位點的方法,其特征在于,步驟(2)中所述PCR擴增的反應條件為:95℃預變性5min,95℃變性10s,55℃退火10s,72℃延伸30s,35個循環,最后72℃延伸2min后于4℃保存。
5.根據權利要求2所述的檢測卵巢癌基因多態性位點的方法,其特征在于,步驟(3)中所述PCR擴增的擴增體系為:DTCS Master Mix 2.5μL、Primer R 1.0μL、模板DNA 3μL,最后用滅菌超純水補足至10μL。
6.根據權利要求2所述的檢測卵巢癌基因多態性位點的方法,其特征在于,步驟(3)中所述PCR擴增的反應條件為:94℃預變性30s,94℃變性25s,55℃退火25s,60℃延伸3min,30個循環,最后60℃延伸20min。
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