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[發(fā)明專利]快速檢測骨關(guān)節(jié)感染常見細菌的PCR檢測試劑盒及方法在審

專利信息
申請?zhí)枺?/td> 201810514985.8 申請日: 2018-05-25
公開(公告)號: CN108411016A 公開(公告)日: 2018-08-17
發(fā)明(設(shè)計)人: 干馳;胡金鳳;莫茜;曹清;王志剛;李玉蟬;蔡海清;徐蘊嵐;陶悅;趙瑞珂;杜白露;沈楠 申請(專利權(quán))人: 上海交通大學醫(yī)學院附屬上海兒童醫(yī)學中心
主分類號: C12Q1/689 分類號: C12Q1/689;C12Q1/686;C12Q1/14;C12Q1/04
代理公司: 上海韌辰專利代理有限公司 31331 代理人: 劉秋蘭
地址: 200127 上*** 國省代碼: 上海;31
權(quán)利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關(guān)鍵詞: 骨關(guān)節(jié)感染 引物組 耐甲氧西林金黃色葡萄球菌 細菌 基因引物 快速檢測 試劑盒 引物 金黃色葡萄球菌 銅綠假單胞菌 化膿鏈球菌 細菌感染 骨關(guān)節(jié) 檢測 耗時
【權(quán)利要求書】:

1.一種快速檢測骨關(guān)節(jié)感染常見細菌的PCR檢測試劑盒,其特征在于所述試劑盒包括:

引物組,所述引物組包括:金黃色葡萄球菌或耐甲氧西林金黃色葡萄球菌nuc基因引物、耐甲氧西林金黃色葡萄球菌mecA基因引物、化膿鏈球菌spyM基因引物和銅綠假單胞菌oprI基因引物。

2.如權(quán)利要求1所述的快速檢測骨關(guān)節(jié)感染常見細菌的PCR檢測試劑盒,其特征在于,所述nuc基因引物包括如SEQ ID NO:1所示的上游引物序列和如SEQ ID NO:2所示的下游引物序列;

所述mecA基因引物包括如SEQ ID NO:3所示的上游引物序列和如SEQ ID NO:4所示的下游引物序列;

所述spyM基因引物包括如SEQ ID NO:5所示的上游引物序列和如SEQ ID NO:6所示的下游引物序列;

所述oprI基因引物包括如SEQ ID NO:7所示的上游引物序列和如SEQ ID NO:8所示的下游引物序列。

3.如權(quán)利要求1或2所述的快速檢測骨關(guān)節(jié)感染常見細菌的PCR檢測試劑盒,其特征在于,所述nuc基因引物、mecA基因引物、spyM基因引物和oprI基因引物的上游引物和下游引物的原始濃度分別為9~11μmol/L優(yōu)選10μmol/L。

4.如權(quán)利要求3所述的快速檢測骨關(guān)節(jié)感染常見細菌的PCR檢測試劑盒,其特征在于,在所述引物組中,所述nuc基因引物的上游引物和下游引物的體積各為0.3μL,所述spyM基因引物的上游引物和下游引物的體積各為0.15μL,所述mecA基因引物的上游引物和下游引物的體積各為0.4μL,所述oprI基因引物的上游引物和下游引物的體積各為0.3μL。

5.如權(quán)利要求1或2所述的快速檢測骨關(guān)節(jié)感染常見細菌的PCR檢測試劑盒,其特征在于,所述PCR檢測試劑盒還包括多重PCR緩沖液和多重PCR DNA聚合酶混合液,所述多重PCR緩沖液的體積為12.5μL,所述多重PCR DNA聚合酶混合液的體積為0.125μL。

6.如權(quán)利要求1或2所述的快速檢測骨關(guān)節(jié)感染常見細菌的PCR檢測試劑盒,其特征在于,所述PCR檢測試劑盒包括無菌水的陰性對照。

7.如權(quán)利要求1或2所述的快速檢測骨關(guān)節(jié)感染常見細菌的PCR檢測試劑盒,其特征在于,所述PCR檢測試劑盒還包括DNA標記。

8.如權(quán)利要求7所述的快速檢測骨關(guān)節(jié)感染常見細菌的PCR檢測試劑盒,其特征在于,所述DNA標記是以金黃色葡萄球菌、耐甲氧西林金黃色葡萄球菌、化膿鏈球菌、銅綠假單胞菌標準菌株基因組為模板分別采用PCR擴增純化后的等體積比混合物。

9.一種使用權(quán)利要求1或2所述的PCR檢測試劑盒快速檢測骨關(guān)節(jié)感染常見細菌的方法,其特征在于包括如下步驟:

步驟S1基于待檢測樣品上的細菌制備得到PCR模板;

步驟S2在引物組的特異性的結(jié)合下根據(jù)PCR模板在PCR反應(yīng)液中進行PCR擴增;

步驟S3對擴增產(chǎn)物進行電泳檢測,與DNA標記對比判斷是否感染了金黃色葡萄球菌、耐甲氧西林金黃色葡萄球菌、化膿鏈球菌和/或銅綠假單胞菌。

10.如權(quán)利要求9所述的方法,其特征在于:在步驟S2中,具體PCR反應(yīng)液包括:12.5μL多重PCR緩沖液,0.125μL多重PCR DNA聚合酶混合液,10μmol/L nuc基因引物的上游引物如SEQ ID NO:1所示和下游引物如SEQ ID NO:2所示體積各0.3μL,10μmol/L spyM基因引物的上游引物如SEQ ID NO:5所示和下游引物如SEQ ID NO:6所示體積各0.15μL,10μmol/LmecA基因引物的上游引物如SEQ ID NO:3所示和下游引物如SEQ ID NO:4所示體積各0.4μL,10μmol/L oprI基因引物的上游引物如SEQ ID NO:7所示和下游引物如SEQ ID NO:8所示體積各0.3μL,8.075μL無菌水和2μL模板;PCR反應(yīng)條件為94~95℃預(yù)變性3~5min;94~95℃下變性15~20s,60~61℃下退火15~20s,72℃下延伸20s,擴增35個循環(huán);72℃延伸5min。

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