[發明專利]一種用于新疆蔥蒜野生近緣種遺傳多樣性分析的TRAP標記引物組合及其應用

有效

• 申請號: 201810505784.1
• 申請日: 2018-05-24
• 公開（公告）號: CN108796109B
• 公開（公告）日: 2022-03-29
• 發明（設計）人: 林辰壹;王丹丹
• 申請（專利權）人: 新疆農業大學
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

本發明屬于分子生物學DNA標記技術與應用領域。公開了一種用于新疆蔥蒜野生近緣種遺傳多樣性分析的TRAP標記引物組合及其應用。本發明提供引物組合的核苷酸序列如SEQ ID No.1至SEQ ID No.6所示。本發明提供TRAP?PCR反應體系中dNTPs濃度為0.250 mmol/L、引物濃度為0.250μmol/L、Taq酶用量為0.750 U和模板DNA用量為75.000 ng，所得到的條帶清晰、重復性好、多態性高的引物組合，能夠準確可靠地進行遺傳分析，本發明提供的引物組合的高效性及實用性彌補了TRAP標記在新疆蔥蒜野生近緣種研究上的應用。

技術領域

本發明屬于分子生物學DNA標記技術與應用領域，具體涉及一種用于新疆蔥蒜野生近緣種遺傳多樣性分析的TRAP引物組合及其應用。

背景技術

蔥蒜植物按照APG IV劃分屬于石蒜科（Amaryllidaceae）蔥屬（Allium L.）多年生草本植物。新疆境內的天山山脈以北、阿爾泰山脈以南、昆侖山脈以北的山地森林草原、山麓荒地、干旱荒漠和干旱草原灌叢等地蘊藏著大蒜、韭菜、大蔥和洋蔥等的野生近緣種，由于特殊的地理環境，有些蔥蒜植物的野生近緣種國內僅分布于新疆，不僅是重要的觀賞、食用、藥用、蔬菜和飼養植物資源，而且是國內蔥屬植物種質創新的寶貴的基因材料，例如，實葶蔥（A. galanthum）、新疆蒜（A. roborowskianum）、多籽蒜（A. fetisowii）、健蒜（A. robustum）、棱葉韭（A. caeruleum）、小山蒜（A. pallasii）等，具有較高的經濟開發和利用價值。

開展新疆蔥蒜野生近緣種的遺傳多樣性和親緣關系分析，為揭示野生近緣種物種演化和系統關系、種質資源保護和生態安全尤為重要，目前對新疆野生蔥蒜植物的種植資源遺傳多樣性和親緣關系分析是基于生態適應性、形態特征、細胞學鑒定、ISSR標記等方面展開，隨著遺傳多樣性分析技術的進步，種質資源的分類學鑒定和親緣關系鑒定還需要開展更廣泛、更深層次的分子生物學評價，需要新的分子標記引物組合的應用。表達序列標簽（EST序列）是從隨機選擇的互補DNA（或cDNA）分子所獲得的DNA（或cDNA）部分基因表達序列，代表著在特定的環境條件下，特定的組織細胞基因表達的序列。本發明提供了一種TRAP分子標記，且所述的TRAP標記是基于蔥屬植物的EST序列設計的引物，基于TRAP標記開展的蔥蒜野生近緣種遺傳多樣性進行分析，為蔥屬野生種質資源驗證基因在特定組織中的表達，推導全長基因序列，或作為標簽標志基因組中的特殊位點以確定基因的位置等具有重要的指導意義。