[發明專利]一種用于新疆蔥蒜野生近緣種遺傳多樣性分析的TRAP標記引物組合及其應用

有效

• 申請號: 201810505784.1
• 申請日: 2018-05-24
• 公開（公告）號: CN108796109B
• 公開（公告）日: 2022-03-29
• 發明（設計）人: 林辰壹;王丹丹
• 申請（專利權）人: 新疆農業大學
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

1.一種TRAP分子標記，其特征在于，所述的分子標記用于新疆蔥蒜野生近緣種遺傳多樣性分析；所述分子標記的引物組合為FS-F1+FS-R2或FS-F2+FS-R2；

所述FS-F1的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示；所述FS-F2的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示；所述FS-R2的核苷酸序列如SEQ ID No.6所示。

2.根據權利要求1所述的TRAP分子標記，其特征在于，所述的新疆蔥蒜野生近緣種為阿爾泰蒜、奇臺蒜、多籽蒜、健蒜、新疆蒜、喀納斯蒜、烏魯木齊蒜、棱葉蒜、小山蒜及實葶蔥。

3.一種權利要求1所述的TRAP分子標記用于新疆蔥蒜野生近緣種遺傳多樣性分析的方法，其特征在于，所述方法包括：

(1)提取新疆蔥蒜野生近緣種基因組DNA；

(2)以所述的基因組DNA為模板，使用權利要求1所述的引物組合進行PCR擴增；

(3)根據PCR擴增產物，基于UPGMA法對新疆蔥蒜野生近緣種進行聚類分析。

4.根據權利要求3所述的方法，其特征在于，步驟(2)中所述PCR擴增的反應體系為：dNTPs濃度為0.250mmol/L、引物濃度為0.250μmol/L、Taq酶用量為0.750U和模板DNA用量為75.000ng；所述反應體系的總體積為20μL。

5.根據權利要求3所述的方法，其特征在于，進行所述PCR擴增反應時，其PCR反應程序具體為：

94℃預變性3min；94℃變性45s，37℃退火45s，72℃延伸1min，循環5次；94℃變性45s，53.2℃退火45s，72℃延伸1min，循環35次；72℃延伸5min。