[發明專利]一種利用超分辨成像檢測端粒酶活性的方法在審
| 申請號: | 201810490109.6 | 申請日: | 2018-05-21 |
| 公開(公告)號: | CN108642139A | 公開(公告)日: | 2018-10-12 |
| 發明(設計)人: | 宗慎飛;宗君珠;王著元;崔一平 | 申請(專利權)人: | 東南大學 |
| 主分類號: | C12Q1/6834 | 分類號: | C12Q1/6834;C12Q1/48;C12N15/11 |
| 代理公司: | 南京眾聯專利代理有限公司 32206 | 代理人: | 葉涓涓 |
| 地址: | 211189 *** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 檢測 超分辨成像 端粒酶活性 端粒酶 信號探針 雜交反應 捕獲探針 高分辨率 高靈敏度 互補序列 檢測結果 微弱信號 信號擴增 延伸反應 檢測端 酶活性 染料 端粒 修飾 圖像 細胞 | ||
1.一種利用超分辨成像檢測端粒酶活性的方法,其特征在于,包括如下步驟:
第一步,利用CHAPS法提取待測細胞中的端粒酶;
第二步,利用捕獲探針和端粒酶進行延伸反應,反應產物與信號探針溶液進行雜交反應;所述的捕獲探針為摻雜染料的二氧化硅納米球表面修飾端粒酶底物;所述的信號探針為修飾了染料分子的端粒互補序列;
第三步,用超分辨成像技術對雜交反應產物進行檢測,根據獲得的兩個通道的圖像上點的重合情況以及DNA探針的熒光信號所獲得的圖像上點的大小判斷端粒酶的活性。
2.根據權利要求1所述的利用超分辨成像檢測端粒酶活性的方法,其特征在于,所述第二步中延伸反應步驟為:取200-300μL捕獲探針,與5μL 10mM dNTPs、1-2μL RNA酶抑制劑、5μL第一步中得到的端粒酶提取物混合,于30℃下振蕩1-2小時進行端粒延伸反應;所述反應產物與信號探針的雜交反應步驟包括:延伸反應產物以2500-3000轉,15分鐘離心提純1次;去除上清后,將沉淀分散至200-300μL的PBS溶液中,再加入0.3-0.9μL10μM的信號探針進行雜交反應;該混合液30℃振蕩2-3小時,以2500g,15min離心提純,去除上清液,將雜交產物的沉淀分散至500-800μLPBS中。
3.根據權利要求1所述的利用超分辨成像檢測端粒酶活性的方法,其特征在于,所述捕獲探針的制備方法包括如下步驟:
配制10mM EDC(1-(3-二甲氨基丙基)-3-乙基碳二亞胺鹽酸鹽)溶液和10mM NHS(N-羥基琥珀酰亞胺)溶液,取10-20μL 10μM TS Primer(端粒酶引物,序列為5'-COOH-TTTTTTTTTTAATCCGTCGAGCAGAGTT-3')溶于PBS溶液中,再分別加入10-20μL EDC溶液和10-20μLNHS溶液,加入50-60μL摻雜FITC(異硫氰酸熒光素)的二氧化硅納米球溶液,置于搖床中振蕩反應12-16小時;將反應物以2500-4000轉,15分鐘離心1-2次提純;去除上清,沉淀分散于2mLPBS溶液中,即得到捕獲探針。
4.根據權利要求1所述的利用超分辨成像檢測端粒酶活性的方法,其特征在于,所述摻雜FITC的二氧化硅納米球的制備方法包括如下步驟:
在1mL無水乙醇中加入0.5-1mg FITC粉末和50-100μL的APTMS(3-氨丙基三甲氧基硅烷),渦旋攪拌均勻后于搖床中振蕩反應6-8小時后獲得FITC-APTMS(偶聯了APTMS的FITC),該產物保存于4℃待用;之后,在50mL無水乙醇中加入1-1.5mL去離子水,1.5-2mL 98%TEOS(正硅酸四乙酯)和100-120μL的FITC-APTMS,在緩慢攪拌的條件下滴入3-3.5mL 25%氨水,反應3-3.5小時后加入1mL 98%TEOS,繼續反應三小時;將反應產物以3000-5000轉,15分鐘離心3-5次;每次離心后去除上清,將沉淀分散至3mL無水乙醇中,避光保存。
5.根據權利要求1所述的利用超分辨成像檢測端粒酶活性的方法,其特征在于:所述信號探針為5'-Cy5-CCCTAACCCTAA-3'。
6.根據權利要求1所述的利用超分辨成像檢測端粒酶活性的方法,其特征在于:所述信號探針的制備方法包括:將5'端修飾了Cy5染料的端粒互補序列的粉末離心后加入PBS溶液即獲得10μM的DNA探針溶液。
7.根據權利要求1所述的利用超分辨成像檢測端粒酶活性的方法,其特征在于:所述第一步具體包括如下過程:將1×106個對數生長期的細胞用冰PBS緩沖液離心清洗若干次后分散至100μL RNA酶抑制劑處理過的冰鎮CHAPS裂解液中,冰上孵育一段時間后,將裂解液以12000rpm,20min離心,取出上清即得端粒酶提取物。
8.根據權利要求1所述的利用超分辨成像檢測端粒酶活性的方法,其特征在于:所述端粒酶引物序列為5'-COOH-TTTTTTTTTTAATCCGTCGAGCAGAGTT-3'。
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