[發(fā)明專利]多批次靶向代謝組學(xué)數(shù)據(jù)的校正方法有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201810472993.0 | 申請日: | 2018-05-17 |
| 公開(公告)號: | CN108931590B | 公開(公告)日: | 2020-12-01 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 許麗;倪君君 | 申請(專利權(quán))人: | 北京和合醫(yī)學(xué)診斷技術(shù)股份有限公司 |
| 主分類號: | G01N30/02 | 分類號: | G01N30/02 |
| 代理公司: | 北京雙收知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11241 | 代理人: | 解政文 |
| 地址: | 101111 北京市大興區(qū)北京*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 批次 靶向 代謝 數(shù)據(jù) 校正 方法 | ||
本發(fā)明多批次靶向代謝組學(xué)數(shù)據(jù)的校正方法包括:收集多份與待測樣本相同的樣本基質(zhì)組成QC樣本;在待測樣本前添加1個QC樣本作為第一QC樣本,并且在后續(xù)的每8?15個待測樣本中插入1個QC樣本,記錄插入QC樣本的進樣序數(shù)n,然后按照完全相同條件對該批次所有樣本進行檢測分析,得到該批次的各樣本中靶向代謝物的濃度;檢測到的所有QC樣本中靶向代謝物濃度與第一批次檢測到的第一QC樣本中靶向代謝物濃度的比值Y作為縱坐標,以該批次所有QC樣本的進樣序數(shù)n作為橫坐標,構(gòu)建相關(guān)線性擬合方程Y=a*n+b;將每一批次每個樣本的進樣序數(shù)n代入方程,分別得到該批次的每個樣本的校正因子,對每個樣本進行系統(tǒng)誤差的校正。
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明涉及分析化學(xué)和代謝組學(xué)領(lǐng)域,是一種用于多批次代謝組學(xué)數(shù)據(jù)校正的方法。
背景技術(shù)
代謝組學(xué)是繼基因組學(xué)、蛋白組學(xué)后系統(tǒng)生物學(xué)的另一重要研究領(lǐng)域,它以組群指標分析為基礎(chǔ),以高通量檢測和數(shù)據(jù)處理為手段,以信息建模與系統(tǒng)整合為目標,通過定性鑒別和定量描述生物基質(zhì)中小分子代謝物的表達與修飾變化,反映外界刺激或遺傳修飾的細胞或組織的代謝應(yīng)答變化。靶向代謝組學(xué)是對目標明確的代謝物的檢測分析,常常要對大量樣本進行分析及驗證,通常需要將大量樣本分多批次進行測試,而各批次間儀器響應(yīng)的狀態(tài)可能有所不同,造成不同批次間代謝數(shù)據(jù)的誤差,為了使不同批次、不同人員、不同儀器的多批次數(shù)據(jù)可以整合分析,我們建立了一種多批次靶向代謝組學(xué)數(shù)據(jù)的校正方法,可滿足長期靶向代謝組學(xué)分析的需要。
本發(fā)明首先在各分析批中加入QC樣本,計算全部QC樣本與第1個QC樣本中靶向代謝物濃度的比值為Yn,再分別建立各批次的線性擬合模型,對數(shù)據(jù)集的系統(tǒng)誤差進行校正。通過對上述過程的數(shù)據(jù)處理,可以準確、高效、高通量的校正代謝組數(shù)據(jù)的系統(tǒng)誤差和隨機誤差,改善代謝組學(xué)數(shù)據(jù)的質(zhì)量,實現(xiàn)多批次靶向代謝組學(xué)數(shù)據(jù)的整合分析。
發(fā)明內(nèi)容
針對上述技術(shù)問題,本申請的發(fā)明目的是建立一種多批次靶向代謝組學(xué)數(shù)據(jù)校正的方法。該方法可校正系統(tǒng)誤差,并一定程度上降低隨機誤差對結(jié)果的影響,具有數(shù)據(jù)處理過程簡單、結(jié)果準確、可操作性強等特點,可廣泛用于代謝組學(xué)研究。
為了完成本申請的發(fā)明目的,本申請采用以下技術(shù)方案:
本發(fā)明的一種多批次靶向代謝組學(xué)數(shù)據(jù)的校正方法,它包括以下步驟:
(一)制作QC樣本:
收集多份與待測樣本相同的樣本基質(zhì),并均勻混合成一個大的樣本,即為QC樣本,對該QC樣本進行分裝保存;
(二)獲取代謝組學(xué)數(shù)據(jù):
在進行每一批次待測樣本檢測時,在待測樣本前添加1個上述步驟(一)所述的QC樣本作為第一QC樣本,并且在后續(xù)的每8-15個待測樣本中插入1個上述步驟(一)所述的QC樣本,記錄插入QC樣本的進樣序數(shù)n,然后按照完全相同條件對該批次所有樣本進行檢測分析,得到該批次的各樣本中靶向代謝物的濃度;
(三)獲得并構(gòu)建線性擬合模型數(shù)據(jù):
將步驟(二)檢測到的所有QC樣本中靶向代謝物濃度與第一批次檢測到的第一QC樣本中靶向代謝物濃度的比值Y作為縱坐標,以該批次所有QC樣本的進樣序數(shù)n作為橫坐標,構(gòu)建相關(guān)線性擬合方程Y=a*n+b,并且得到a和b;
(四)校正數(shù)據(jù)集的系統(tǒng)誤差:
將每一批次每個樣本的進樣序數(shù)n代入到步驟(三)得到的方程Y=a*n+b中,分別得到該批次的每個樣本的校正因子,用該批次的每個樣本的儀器檢測濃度除以每個樣本的校正因子,得到對每個樣本經(jīng)過系統(tǒng)誤差校正后的數(shù)據(jù);
(五)多批次靶向代謝組學(xué)數(shù)據(jù)的校正:
重復(fù)步驟(二)至步驟(四),得到每一批次每個樣本經(jīng)過系統(tǒng)誤差校正后的數(shù)據(jù);
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