[發(fā)明專利]聯(lián)合Aβ和D-gal構(gòu)建的AD模型鼠海馬區(qū)基因表達(dá)差異譜及其測定方法和應(yīng)用在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201810410013.4 | 申請日: | 2018-05-02 |
| 公開(公告)號: | CN108588214A | 公開(公告)日: | 2018-09-28 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 黃飛娟;吳正治;秦鑒 | 申請(專利權(quán))人: | 中山大學(xué)附屬第一醫(yī)院 |
| 主分類號: | C12Q1/6883 | 分類號: | C12Q1/6883;G06F19/18;A01K67/027 |
| 代理公司: | 北京品源專利代理有限公司 11332 | 代理人: | 鞏克棟 |
| 地址: | 510080 *** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 模型鼠 海馬 構(gòu)建 基因芯片數(shù)據(jù) 差異表達(dá) 區(qū)基因 差異表達(dá)基因 差異基因表達(dá) 基因表達(dá)譜 表達(dá)差異 分析軟件 分子基礎(chǔ) 功能注釋 記憶損傷 生物通路 外源基因 基因譜 模型組 水迷宮 大鼠 圖譜 樣本 誘導(dǎo) 測量 測試 聯(lián)合 篩選 分類 基因 應(yīng)用 分析 成功 研究 | ||
本發(fā)明涉及一種聯(lián)合Aβ和D?gal構(gòu)建的AD模型鼠海馬區(qū)差異基因表達(dá)圖譜的構(gòu)建方法,包括:1)用Aβ和D?gal處理大鼠,以建立AD模型鼠;2)用Morris水迷宮測量AD模型鼠的記憶損傷,以確定AD模型鼠的成功構(gòu)建;3)獲取AD模型組與正常對照組的海馬區(qū)樣本,對各所述測試海馬區(qū)基因表達(dá)分別獲取基因芯片數(shù)據(jù);4)各基因芯片數(shù)據(jù)上傳到基因芯片數(shù)據(jù)分析軟件,獲取差異表達(dá)基因,篩選AD模型鼠差異表達(dá)的基因譜;5)對差異表達(dá)的基因進(jìn)行功能注釋分類和生物通路分析,以揭示與AD發(fā)生的相關(guān)分子基礎(chǔ)。本發(fā)明將Aβ和D?gal作為整體AD模型來研究其基因表達(dá)譜,有效避免了由外源基因誘導(dǎo)的其他改變表達(dá)的錯(cuò)誤。
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明屬于生物技術(shù)領(lǐng)域,涉及一種AD模型鼠海馬區(qū)基因表達(dá)差異譜的測定方法,具體涉及聯(lián)合Aβ和D-gal構(gòu)建的AD模型鼠海馬區(qū)基因表達(dá)差異譜及其測定方法和應(yīng)用。
背景技術(shù)
阿爾茨海默病(AD)是以認(rèn)知能力下降和記憶力缺陷為特征的最為普遍的與年齡相關(guān)進(jìn)行性神經(jīng)退行性疾病,約占所有老年認(rèn)知功能障礙患者的2/3。雖然AD對患者的行為造成破壞性影響并最終對其生命構(gòu)成嚴(yán)重威脅,但基于大腦皮質(zhì)中存在細(xì)胞內(nèi)神經(jīng)原纖維纏結(jié)(NFT)以及在海馬區(qū)細(xì)胞外淀粉樣斑塊(APs)的臨床病理學(xué)診斷僅適用于AD中度和終末階段。目前,AD病例在初期很少被診斷出來。最近,利用代謝組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)和基因組學(xué)技術(shù)監(jiān)測整個(gè)AD發(fā)展過程中的分子擾動,以篩選診斷治療靶標(biāo)的生物標(biāo)志物。
據(jù)報(bào)道,長期給予D-半乳糖(D-gal)可以誘發(fā)行為和神經(jīng)化學(xué)變化,這些變化被應(yīng)用于模擬腦老化自然過程。同時(shí),β淀粉樣蛋白(Aβ)是阿爾茨海默病(AD)的關(guān)鍵病理標(biāo)志,并且在該疾病的進(jìn)展過程中起關(guān)鍵作用。因此,D-gal和Aβ被廣泛用于誘導(dǎo)AD、AD樣模型研究、AD的作用機(jī)制和篩選抗AD藥物。先前的研究表明,D-gal和Aβ聯(lián)合誘導(dǎo)大鼠可更接近AD患者的行為與神經(jīng)化學(xué)變化。
基因芯片是同時(shí)測量數(shù)千個(gè)mRNA表達(dá)的方便且強(qiáng)大的工具。已有研究報(bào)道利用基因芯片分析的方法,探索和識別與疾病或異常疾病相關(guān)的新型分子靶點(diǎn)。
“逍遙散對阿爾茨海默病模型大鼠海馬mRNA表達(dá)的影響,李高申等,中國老年學(xué)雜志2015年8月第35卷,4199-4201”公開了一種用AD模型鼠探討逍遙散對阿爾茨海默病的海馬mRNA表達(dá)的影響,涉及D-gal腹腔注射和Aβ1-42雙側(cè)海馬注射聯(lián)合造模,實(shí)驗(yàn)鼠經(jīng)給藥處理后剝離其海馬,提取RNA并進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,運(yùn)用實(shí)時(shí)定量PCR的方法檢測mRNA表達(dá)變化,該方法構(gòu)建的大鼠模型與阿爾茨海默病的行為變化相似,但實(shí)時(shí)定量PCR在檢測mRNA表達(dá)差異時(shí)費(fèi)時(shí)費(fèi)力,樣本量小,不利于挖掘基因差異表達(dá)譜。
“應(yīng)用基因芯片篩選β淀粉樣蛋白誘導(dǎo)的阿爾茨海默病細(xì)胞模型差異表達(dá)基因,郭秋野,第一軍醫(yī)大學(xué),2006”公開了一種利用基因芯片研究阿爾茨海默病相關(guān)基因表達(dá)差異的方法,涉及用Aβ25-35誘導(dǎo)構(gòu)建AD細(xì)胞模型,運(yùn)用基因芯片篩選該模型與未經(jīng)誘導(dǎo)的對照細(xì)胞間的差異表達(dá)基因,分析差異基因的功能,實(shí)現(xiàn)高通量檢測。但所用模型為細(xì)胞模型,體外實(shí)驗(yàn)不能精準(zhǔn)代表體內(nèi)變化,且單一使用Aβ25-35誘導(dǎo)效果不穩(wěn)定。
因此,建立一種高度模擬阿爾茨海默病行為變化的實(shí)驗(yàn)?zāi)P停ΡM可能多的基因進(jìn)行差異表達(dá)分析,得到差異表達(dá)分析譜,在生物技術(shù)領(lǐng)域具有重要意義和廣闊運(yùn)用前景。
發(fā)明內(nèi)容
針對現(xiàn)有技術(shù)的不足及實(shí)際的需求,本發(fā)明提供聯(lián)合Aβ和D-gal構(gòu)建的AD模型鼠海馬區(qū)基因表達(dá)差異譜及其測定方法和應(yīng)用,將Aβ和D-gal作為整體AD模型來研究其基因表達(dá)譜,有效避免了由外源基因誘導(dǎo)的其他改變表達(dá)的錯(cuò)誤。
為達(dá)此目的,本發(fā)明采用以下技術(shù)方案:
第一方面,本發(fā)明提供一種聯(lián)合Aβ和D-gal構(gòu)建的AD模型鼠海馬區(qū)基因表達(dá)差異譜的測定方法,所述方法包括以下步驟:
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