[發明專利]一種基于基因分型鑒定灘羊與非灘羊的方法

有效

• 申請號: 201810409670.7
• 申請日: 2018-05-02
• 公開（公告）號: CN110438234B
• 公開（公告）日: 2023-05-26
• 發明（設計）人: 馬青;蔣琳;李穎康;馬月輝;馬麗娜;劉繼強
• 申請（專利權）人: 寧夏農林科學院動物科學研究所;中國農業科學院北京畜牧獸醫研究所;北京康普森生物技術有限公司
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245
• 代理人: 關暢;張立娜

本發明公開了一種基于基因分型鑒定灘羊與非灘羊的方法。本發明方法包括：檢測待測羊的基因組中11組SNP位點組合中各SNP位點處的核苷酸，確定所述待測羊對應于所述11組SNP位點組合的11個基因型；然后按照如下確定所述待測羊是否為灘羊：如果所述待測羊對應于所述11組SNP位點組合的11個基因型均符合相應組SNP位點組合的灘羊標準基因型，則所述待測羊為或候選為灘羊；如果所述待測羊對應于所述11組SNP位點組合的11個基因型均符合相應組SNP位點組合的非灘羊標準基因型，則所述待測羊為或候選為非灘羊。本發明成功獲得用于鑒定灘羊與非灘羊的SNP位點組合，為今后灘羊的鑒定、保種、以及遺傳育種提供支撐。

技術領域

本發明涉及生物技術領域，具體涉及一種基于基因分型鑒定灘羊與非灘羊的方法。

背景技術

灘羊是寧夏重要的畜牧資源，年出欄量達600萬頭，因其特有的風味和肉質深受市場推崇，是寧夏的重要優勢品牌。然而，由于最近出現的灘羊和其他羊類品種的雜交后代冒充灘羊銷售，對灘羊品牌造成了巨大損害。為穩定灘羊品質，重樹灘羊品牌形象，將灘羊打造成為全國馳名品牌，我們通過對灘羊與非灘羊的鑒定，為今后灘羊的鑒保種以及遺傳育種奠定基礎。

近年來隨著分子生物學的發展，基因檢測技術在生物物種鑒定中也取得了長足的進展。基因檢測技術以其幾乎可以對所有的生物類材料進行鑒定而被廣泛應用于動植物物種鑒定。基因檢測技術鑒定動植物物種是物種識別中發展最快、準確率最高的技術手段。

全基因組重測序是對基因組序列已知的個體進行全基因組范圍的測序，隨著測序成本降低和已知基因組序列的物種增多，重測序已經成為動植物育種研究中最為有效的方法之一。Sequenom?SNP分型技術通過引物延伸反應原理進行，將靈敏的PCR擴增和可靠的MALDI-TOF質譜技術相結合，實現基因分型檢測，此技術特別適合對全基因組研究發現的結果進行驗證。

發明內容

本發明的目的是提供一種基于基因分型鑒定灘羊與非灘羊的方法。

第一方面，本發明要求保護一種基于基因分型鑒定灘羊與非灘羊的方法。

本發明所提供的基于基因分型鑒定灘羊與非灘羊的方法，可為如下任一種：

第一種，基于11組SNP位點組合進行鑒定的方法。該方法具體可包括如下步驟：檢測待測羊的基因組中11組SNP位點組合中各SNP位點處的核苷酸，確定所述待測羊對應于所述11組SNP位點組合的11個基因型；然后按照如下確定所述待測羊是否為灘羊：如果所述待測羊對應于所述11組SNP位點組合的11個基因型均符合相應組SNP位點組合的灘羊標準基因型，則所述待測羊為或候選為灘羊；如果所述待測羊對應于所述11組SNP位點組合的11個基因型均符合相應組SNP位點組合的非灘羊標準基因型，則所述待測羊為或候選為非灘羊。

所述11組SNP位點組合為如下(a1)-(a11)；(a1)-(a11)所示的11組SNP位點組合所對應的非灘羊標準基因型和灘羊標準基因型依次分別為(b1)-(b11)。即(a1)所示的SNP位點組合所對應的非灘羊標準基因型和灘羊標準基因型為(b1)；(a2)所示的SNP位點組合所對應的非灘羊標準基因型和灘羊標準基因型為(b2)；……(a11)所示的SNP位點組合所對應的非灘羊標準基因型和灘羊標準基因型為(b11)。

(a1)含有5個SNP位點，分別為CM001598.2:69009397、CM001602.2:49927473、CM001603.2:38707088、CM001603.2:46619514和CM001606.2:34435705；

(a2)含有5個SNP位點，分別為CM001582.2:86006851、CM001598.2:69009397、CM001600.2:45516740、CM001601.2:47737780和CM001603.2:46619514；