[發明專利]一種用于檢測可可球二孢的特異性引物及快速檢測方法有效
| 申請號: | 201810386044.0 | 申請日: | 2018-04-26 |
| 公開(公告)號: | CN108531639B | 公開(公告)日: | 2019-07-19 |
| 發明(設計)人: | 周游;黃俊生;楊臘英;汪軍;郭立佳;劉磊;梁昌聰 | 申請(專利權)人: | 中國熱帶農業科學院環境與植物保護研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/6895 | 分類號: | C12Q1/6895;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645 |
| 代理公司: | 廣州三環專利商標代理有限公司 44202 | 代理人: | 陳歡 |
| 地址: | 571101 *** | 國省代碼: | 海南;46 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 特異性引物 快速檢測 引物 植物病害 真菌 條帶 病原菌 翻譯延長因子 葡萄座腔菌 關鍵作用 區間序列 特異擴增 特異性強 靈敏度 檢測 可用 擴增 物種 基因 發現 | ||
1.一種用于檢測可可球二孢的特異性引物對,其特征在于,包括上游引物ZYLTF1和下游引物ZYLTR1,所述ZYLTF1和ZYLTR1的核苷酸序列分別為:
ZYLTF1:5'-acgcatgtcgttttttaa-3',
ZYLTR1:5'-tacatgagtggtcagagcat-3',
所述可可球二孢的拉丁名為Lasiodiplodia theobromae;
所述引物通過以下方式得到:利用一段翻譯延長因子序列的變異區間序列設計上游引物ZYLTF1,所述變異區間序列為:acgcatgtcgttttttaacccctctcga,并根據翻譯延長因子其它堿基序列設計下游引物ZYLTR1。
2.根據權利要求1所述的一種用于檢測可可球二孢的特異性引物對,其特征在于,所述引物ZYLTF1和ZYLTR1對可可球二孢特異性擴增出216bp的產物。
3.一種可可球二孢快速檢測方法,其特征在于,以待測樣品的DNA為模板,利用權利要求1所述的引物對進行PCR擴增,反應結束后對擴增產物進行瓊脂糖凝膠電泳分析,根據擴增產物的大小判定結果,如果能特異性地擴增出216bp的產物,即判定樣品中存在可可球二孢。
4.根據權利要求3所述的一種可可球二孢快速檢測方法,其特征在于,所述待測樣品為可可球二孢或者疑似感染了可可球二孢的植物組織。
5.根據權利要求3所述的一種可可球二孢快速檢測方法,其特征在于,引物擴增的反應體系為:10μmol/L上游引物和下游引物各1μL,2×Taq PCR Master Mix 12.5μL,模板DNA 1μL,無菌超純水9.5μL;所述2×Taq PCR Master Mix包括0.05U/μL的Taq DNA聚合酶、10×Buffer、4mmol/L的Mg2+和0.4mmol/L的dNTPs。
6.根據權利要求3所述的一種可可球二孢快速檢測方法,其特征在于,擴增的反應程序為:
94℃預變性3min;94℃變性45s,58℃退火45s,72℃延伸1min;循環35次;72℃終延伸10min。
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