[發明專利]一種重復片段介導的植物定點重組方法有效
| 申請號: | 201810368574.2 | 申請日: | 2018-04-23 |
| 公開(公告)號: | CN110396523B | 公開(公告)日: | 2023-06-09 |
| 發明(設計)人: | 朱健康;陸鈺明;田益夫;沈潤東;王木桂 | 申請(專利權)人: | 中國科學院分子植物科學卓越創新中心 |
| 主分類號: | C12N15/82 | 分類號: | C12N15/82;C12N9/22;A01H5/00;A01H6/46;C12N5/10 |
| 代理公司: | 上海一平知識產權代理有限公司 31266 | 代理人: | 王正君;徐迅 |
| 地址: | 200031 上*** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 重復 片段 植物 定點 重組 方法 | ||
1.一種核酸構建物,其特征在于,所述核酸構建物具有從5’-3’的式I所示的結構:
Y1-Z1-Z2-Z3-Z4-Z5-Y2????(I)
其中,Y1為無或核苷酸序列;
Z1為第一DSB序列;
Z2為第一同源序列;
Z3為目的DNA序列;
Z4為第二同源序列;
Z5為第二DSB序列;
Y2為無或核苷酸序列;
并且,各“-”獨立地為鍵或核苷酸連接序列,所述各DSB序列各自獨立地:(a)自身含有切割位點,或(b)含有當所述核酸構建物通過NHEJ方式整合入靶位點后形成的切割位點,所述第一DSB序列為10-50bp,所述第二DSB序列為10-50bp。
2.如權利要求1所述的核酸構建物,其特征在于,所述第一和第二DSB序列在gRNA的參與下被定位并切割。
3.如權利要求1所述的核酸構建物,其特征在于,所述各DSB序列能夠被定點切割核酸酶識別并切割。
4.如權利要求3所述的核酸構建物,其特征在于,所述定點切割核酸酶選自下組:ZFN、Talen和CRISPR/Cas9、或其組合。
5.如權利要求1所述的核酸構建物,其特征在于,所述第一DSB序列、第二DSB序列能夠被選自下組的酶識別并切割:Cas9、Cpf1、C2C1、C2C2、C2C3等CRISPR相關酶。
6.?如權利要求1所述的核酸構建物,其特征在于,所述第一DSB序列、第二DSB序列能夠被選自下組的酶識別并切割:Fok?I。
7.如權利要求1所述的核酸構建物,其特征在于,所述第一DSB序列為15-30bp。
8.如權利要求1所述的核酸構建物,其特征在于,所述第二DSB序列為15-30bp。
9.如權利要求1所述的核酸構建物,其特征在于,所述第一同源序列為20bp-10kb。
10.如權利要求9所述的核酸構建物,其特征在于,所述第一同源序列為30bp-5kb。
11.如權利要求1所述的核酸構建物,其特征在于,所述第二同源序列為20bp-10kb。
12.如權利要求11所述的核酸構建物,其特征在于,所述第二同源序列為30bp-5kb。
13.如權利要求1所述的核酸構建物,其特征在于,所述目的DNA序列為待敲入和/或替換的序列。
14.如權利要求1所述的核酸構建物,其特征在于,所述目的DNA序列為1bp-10kb。
15.如權利要求14所述的核酸構建物,其特征在于,所述目的DNA序列為5bp-5kb。
16.如權利要求1所述的核酸構建物,其特征在于,所述核酸構建物為單鏈DNA序列或雙鏈DNA序列。
17.如權利要求16所述的核酸構建物,其特征在于,所述核酸構建物為雙鏈DNA序列。
18.如權利要求1所述的核酸構建物,其特征在于,所述核酸構建物的一條和/或兩條DNA單鏈的5’末端進行磷酸化修飾。
19.如權利要求1所述的核酸構建物,其特征在于,所述核酸構建物的5’和/或3’端的最末端的一個或多個堿基間的磷酸二酯鍵進行硫代修飾。
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