[發明專利]苯丙氨酸羥化酶基因突變譜檢測的特異性引物在審
| 申請號: | 201810273204.0 | 申請日: | 2018-03-29 |
| 公開(公告)號: | CN108330190A | 公開(公告)日: | 2018-07-27 |
| 發明(設計)人: | 龐永紅;彭磊;于洋 | 申請(專利權)人: | 徐州市婦幼保健院 |
| 主分類號: | C12Q1/6883 | 分類號: | C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12Q1/6869;C12N15/11 |
| 代理公司: | 徐州市三聯專利事務所 32220 | 代理人: | 陳鵬 |
| 地址: | 221000 江*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 苯丙氨酸羥化酶基因 特異性引物 突變譜 擴增 分子生物學技術 二級結構 發夾結構 分子機制 基因引物 經濟實用 突變分析 側翼區 對引物 外顯子 檢測 分層 引物 病因 研究 | ||
1.一種苯丙氨酸羥化酶基因突變譜檢測的特異性引物,其特征在于,包括13對引物,擴增區域為13個外顯子及其側翼區,引物序列分別為:
所述苯丙氨酸羥化酶基因C1位點,擴增區域為474-533,擴增引物序列是F1:acgaggggcgttactgtg和R1:ccaggaagcaccagcag;
所述苯丙氨酸羥化酶基因C2位點,擴增區域為4614-4863,擴增引物序列是F2:agagttcatgcttgctttg和R2:tggaagtttgctacgacat;
所述苯丙氨酸羥化酶基因C3位點,擴增區域為22600-22909,擴增引物序列是F3:gttaggttttcctgttctggt和R3:gtggagttacttatgttgca;
所述苯丙氨酸羥化酶基因C4位點,擴增區域為39910-40214,擴增引物序列是F4:ttgaacgatagtaatttggg和R4:aggtaagaggaagggag;
所述苯丙氨酸羥化酶基因C5位點,擴增區域為50823-51072,擴增引物序列是F5:accaagggaaggagacat和R5:caagggagaagcaggctag;
所述苯丙氨酸羥化酶基因C6位點,擴增區域為62189-62527,擴增引物序列是F6:ccccgactccctctgctaa和R6:cctctgcctcaatcctccc;
所述苯丙氨酸羥化酶基因C7位點,擴增區域64590-64874,擴增引物序列是F7:gtctcctagtgcctctgact和R7:gcaatgaacccaaacctc;
所述苯丙氨酸羥化酶基因C8位點,擴增區域65759-66029,擴增引物序列是F8:ctttctgcccattcctca和R8:tacctggtttccgctctt;
所述苯丙氨酸羥化酶基因C9位點,擴增區域70545-70748,擴增引物序列是F9:ctttctgcccattcctca和R9:tacctggtttccgctctt;
所述苯丙氨酸羥化酶基因C10位點,擴增區域73035-73438,擴增引物序列是F10:tccagaaacaccctcata和R10:cacagccatcatcaaatc;
所述苯丙氨酸羥化酶基因C11位點,擴增區域73972-73700,擴增引物序列是F11:ttgggctgtgatgtagaag和R11:tgtcaccacctcaccttact;
所述苯丙氨酸羥化酶基因C12位點,擴增區域77275-76978,擴增引物序列是F12:tagggaggtgtccgtgtt和R12:gcgatggtagggaaaga;
所述苯丙氨酸羥化酶基因C13位點,擴增區域78520-78309,擴增引物序列是F13:gctttgcactgaggacact和R13:aggtttgcttttcggacttt。
2.根據權利要求1所述的一種苯丙氨酸羥化酶基因突變譜檢測的特異性引物,其特征在于,所述苯丙氨酸羥化酶基因C1位點、C2位點、C3位點、C4位點、C5位點、C6位點、C7位點、C8位點、C9位點、C10位點、C11位點、C12位和C13位點的擴增引物序列,其退火溫度分別為64℃、60℃、60℃、58℃、59℃、64℃、59℃、50℃、57℃、55℃、60℃、61℃和62℃。
3.根據權利要求1所述的一種苯丙氨酸羥化酶基因突變譜檢測的特異性引物,其特征在于,所述苯丙氨酸羥化酶基因C1位點、C2位點、C3位點、C4位點、C5位點、C6位點、C7位點、C8位點、C9位點、C10位點、C11位點、C12位和C13位點的擴增引物序列,其分別依次位于Exon1、Exon2、Exon3、Exon4、Exon5、Exon6、Exon7、Exon8、Exon9、Exon10、Exon11、Exon12和Exon13及各外顯子側翼區。
4.一種權利要求1-3任一項所述檢測引物的應用,其特征在于,具體包括步驟:
1)利用PCR-SSCP確定PAH熱點突變區域;
2)利用PCR直接測序法,在步驟1)確定的熱點突變區域對全部樣本擴增,將PCR產物直接Sanger測序。
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