[發(fā)明專利]一種互動(dòng)式虛擬切片遠(yuǎn)程標(biāo)注方法及系統(tǒng)

在審

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201810211140.1
• 申請(qǐng)日: 2018-03-14
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN108470585A
• 公開(kāi)（公告）日: 2018-08-31
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 馬朔昕
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 南京泰立瑞信息科技有限公司
• 主分類號(hào): G16H50/20
• 分類號(hào): G16H50/20;G06T3/40;G06K9/46
• 代理公司: 北京科億知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 11350
• 代理人: 周倜

本發(fā)明涉及一種互動(dòng)式虛擬切片遠(yuǎn)程標(biāo)注方法及系統(tǒng)，方法包括：將由數(shù)字化拍攝裝置連續(xù)掃描采集到的多張切片局部的低倍放大的圖像拼接成一張關(guān)于該切片完整的全幅低倍放大圖像；將全幅低倍放大圖像通過(guò)網(wǎng)絡(luò)傳輸給上級(jí)端；由上級(jí)端向下級(jí)端發(fā)出需采集高倍放大圖像的目標(biāo)區(qū)域信息，并在下級(jí)端的全幅低倍放大圖像上著色標(biāo)注出所述目標(biāo)區(qū)域；將掃描采集到目標(biāo)區(qū)域的高倍放大圖像傳輸給上級(jí)端。通過(guò)應(yīng)用本發(fā)明中的互動(dòng)式虛擬切片遠(yuǎn)程標(biāo)注方法及系統(tǒng)，可以在網(wǎng)絡(luò)傳輸速度有限制的前提下，能夠保證病理切片遠(yuǎn)程會(huì)診中對(duì)關(guān)鍵區(qū)域的高倍放大圖像的遠(yuǎn)程傳輸。上級(jí)臨床專家在查看軟件中檢視低倍率掃描圖像后，指定對(duì)若干關(guān)鍵區(qū)域進(jìn)行高倍率拍照或掃描。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及數(shù)字化病理學(xué)和病理切片遠(yuǎn)程會(huì)診等領(lǐng)域，具體涉及一種互動(dòng)式虛擬切片遠(yuǎn)程標(biāo)注方法及系統(tǒng)。

背景技術(shù)

病理全切片掃描(whole slide imaging)技術(shù)經(jīng)過(guò)十?dāng)?shù)年發(fā)展，已基本成熟，但將其產(chǎn)生的虛擬切片數(shù)據(jù)應(yīng)用在遠(yuǎn)程會(huì)診中存在著三方面技術(shù)缺陷：

1、在高放大倍率下，進(jìn)行全切片掃描需要覆蓋數(shù)千視野，因而需要很長(zhǎng)的掃描時(shí)間。即使使用較先進(jìn)的全自動(dòng)掃描儀，其掃描耗時(shí)也難以滿足對(duì)實(shí)時(shí)性要求較高的應(yīng)用場(chǎng)景，例如對(duì)冰凍切片進(jìn)行遠(yuǎn)程會(huì)診。

2、由于基本光學(xué)特性，高放大倍率下顯微鏡的觀察景深極淺、容易失焦，因而在掃描過(guò)程中需要頻繁的自動(dòng)對(duì)焦。這一過(guò)程不僅耗時(shí)，而且遇到樣本較厚的情況難以保證自動(dòng)化運(yùn)行的穩(wěn)定性。

3、完全使用高倍率進(jìn)行掃描，會(huì)產(chǎn)生數(shù)GB至數(shù)十GB的數(shù)據(jù)量，即使在高速專用網(wǎng)絡(luò)中傳輸，其消耗時(shí)間依然無(wú)法滿足對(duì)實(shí)時(shí)性要求高的場(chǎng)景。這巨大的數(shù)據(jù)量中，絕大部分覆蓋了對(duì)診斷并無(wú)幫助的區(qū)域的細(xì)節(jié)，原本無(wú)需進(jìn)行高精度采集、存儲(chǔ)、傳輸。然而，對(duì)關(guān)鍵區(qū)域的劃分依賴于有豐富診斷經(jīng)驗(yàn)的臨床專家，一般操作員和機(jī)器尚無(wú)法分辨。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明要解決的技術(shù)問(wèn)題是：提出一種在較低網(wǎng)絡(luò)傳輸速度環(huán)境下，能夠滿足遠(yuǎn)程會(huì)診對(duì)病理切片圖像傳輸及查看需要的互動(dòng)式虛擬切片遠(yuǎn)程標(biāo)注方法及系統(tǒng)。

本發(fā)明為解決上述技術(shù)問(wèn)題提出的技術(shù)方案(一)是：一種互動(dòng)式虛擬切片遠(yuǎn)程標(biāo)注方法，包括以下步驟：

將由數(shù)字化拍攝裝置連續(xù)掃描采集到的多張切片局部的低倍放大的圖像拼接成一張關(guān)于該切片完整的全幅低倍放大圖像；

將所述全幅低倍放大圖像通過(guò)網(wǎng)絡(luò)傳輸給上級(jí)端；

由上級(jí)端向下級(jí)端發(fā)出需采集高倍放大圖像的目標(biāo)區(qū)域信息，并在下級(jí)端的所述全幅低倍放大圖像上著色標(biāo)注出所述目標(biāo)區(qū)域；

將掃描采集到目標(biāo)區(qū)域的高倍放大圖像通過(guò)網(wǎng)絡(luò)傳輸給上級(jí)端。

進(jìn)一步的，所述拼接是指相鄰兩幅圖像在基于多個(gè)特征點(diǎn)匹配的相對(duì)位置定位后，將兩幅圖像中的重疊部分移除再重新生成一幅包含有前述兩幅圖像中全部?jī)?nèi)容新圖像的過(guò)程；

所述相鄰兩幅圖像指兩幅圖像中有部分重合。

所述多個(gè)特征點(diǎn)的選取策略采用自適應(yīng)門限。

進(jìn)一步的，采用所述自適應(yīng)門限策略進(jìn)行特征點(diǎn)選取時(shí)，

在每幅圖像內(nèi)使用SURF或SIFT特征點(diǎn)處理算法，計(jì)算每個(gè)像素點(diǎn)的特征點(diǎn)顯著性，所述顯著性的數(shù)學(xué)含義是這個(gè)像素點(diǎn)的Hessian特征矩陣的行列式；

預(yù)設(shè)特征點(diǎn)數(shù)目上限值K_max以限制計(jì)算負(fù)荷上限，以及特征顯著性最低門限值T_min以判定是否存在任何可用特征最低門限值T_min；