[發(fā)明專利]一種核酸測序文庫及其構建方法有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201810176919.4 | 申請日: | 2018-03-04 |
| 公開(公告)號: | CN110219054B | 公開(公告)日: | 2020-10-02 |
| 發(fā)明(設計)人: | 朱修銳;袁國紅;孟凡琳;郭永;王勇斗 | 申請(專利權)人: | 清華大學;北京羿賽生物科技有限公司 |
| 主分類號: | C40B40/06 | 分類號: | C40B40/06;C40B50/06;C12N15/10 |
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| 地址: | 10008*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 核酸 序文 及其 構建 方法 | ||
1.一種用于核酸測序的文庫,其特征在于,所述核酸文庫包括式1和式2兩種形式的序列,式1和式2中的正義鏈序列從左到右的方向是5’端到3’端:
;其中U和V分別為測序平臺能識別的一個已知序列,所述V的部分或全部序列為測序讀數(shù)的引物,U*和V*分別是所述U和所述V的互補序列;
F和H分別為測序平臺能識別的一個已知序列,所述F的部分或全部序列為測序讀數(shù)的引物,其5’端的部分或全部序列與所述V的3’端的部分或全部序列互補;F*和H*分別是所述F和所述H的互補序列,所述F*的部分或全部序列為測序讀數(shù)的引物;
Yc和Yd為序列長度確定的隨機序列文庫Y中的兩種不同序列,Yc*和Yd*分別是所述Yc和所述Yd的互補序列;
W、B和D分別為三種已知序列,W*、B*和D*分別是所述W、B和D的互補序列;
Tran為轉座酶能識別的一個已知序列,Tran*是所述Tran的互補序列;
Xm為長度確定的隨機序列文庫X中的一種序列,Xm*是所述Xm的互補序列;
Seq為待測序核酸一種片段化核酸序列的正義鏈,Seq*是所述Seq的互補序列;和
上述各序列之間可選地存在長度確定的隨機序列。
2.根據(jù)權利要求1所述的用于核酸測序的文庫,其特征在于,當所述U和所述V之間存在長度確定的隨機序列,該隨機序列的長度與所述隨機序列文庫Y中隨機序列的長度不同。
3.根據(jù)權利要求1所述的用于核酸測序的文庫,其特征在于,在所述序列W和所述序列B之間存在長度確定的隨機序列文庫Z中的一種序列Zk。
4.根據(jù)權利要求3所述的用于核酸測序的文庫,其特征在于,所述Zk為2-12個堿基長度的序列。
5.根據(jù)權利要求4所述的用于核酸測序的文庫,其特征在于,所述Zk 為6個或8個堿基長度的序列。
6.根據(jù)權利要求1所述的用于核酸測序的文庫,其特征在于,所述U和所述H分別為10-40個堿基長度的序列。
7.根據(jù)權利要求6述的用于核酸測序的文庫,其特征在于,所述U是5’-AAT GAT ACGGCG ACC ACC GAG ATC T-3’,和所述H是5’-ATC TCG TAT GCC GTC TTC TGC TTG-3’。
8.根據(jù)權利要求1所述的用于核酸測序的文庫,其特征在于,所述V和所述F分別為10-60個堿基長度的序列。
9.根據(jù)權利要求8所述的用于核酸測序的文庫,其特征在于,所述V為5’-ACA CTC TTTCCC TAC ACG ACG CTC TTC CGA TC-3’,和所述F為5’-GAT CGG AAG AGC ACA CGT CTG AACTCC AGT CAC-3’。
10.根據(jù)權利要求1所述的用于核酸測序的文庫,其特征在于,所述隨機序列文庫Y中隨機序列為2-12個堿基長度的序列。
11.根據(jù)權利要求10所述的用于核酸測序的文庫,其特征在于,所述隨機序列文庫Y中隨機序列為6個或8個堿基長度的序列。
12.根據(jù)權利要求1所述的用于核酸測序的文庫,其特征在于,所述W為1-15個堿基長度的序列。
13.根據(jù)權利要求12所述的用于核酸測序的文庫,其特征在于,所述W為1個或3個堿基長度的序列。
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