[發明專利]RT-PCR檢測獼猴桃潰瘍病原菌的引物及檢測方法有效
| 申請號: | 201810138696.2 | 申請日: | 2018-02-10 |
| 公開(公告)號: | CN108179206B | 公開(公告)日: | 2020-12-18 |
| 發明(設計)人: | 胡容平;石軍;陳松;葉慧麗;陳慶東;林立金 | 申請(專利權)人: | 四川省農業科學院植物保護研究所;綿陽市農業科學研究院 |
| 主分類號: | C12Q1/689 | 分類號: | C12Q1/689;C12Q1/686;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/38 |
| 代理公司: | 成都帝鵬知識產權代理事務所(普通合伙) 51265 | 代理人: | 黎照西 |
| 地址: | 610000 *** | 國省代碼: | 四川;51 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | rt pcr 檢測 獼猴桃 潰瘍 病原菌 引物 方法 | ||
本發明提供了一種實時熒光RT?PCR檢測獼猴桃潰瘍病原菌Pseudomonas syringaepv.actinidae的特異性引物,其由正向引物和反向引物組成,所述正向引物為:5'?CCGCTGTGATACAATTCGGC?3',如SEQ ID NO.1所示,所述反向引物為:5'?CGCACATAAGACAACAGGCG?3',如SEQ ID NO.2所示;利用所述特異性引物進行實時熒光RT?PCR檢測比進行普通PCR檢測的靈敏度至少提高100倍。本發明還提供基于該特異性引物的試劑盒、檢測方法和應用。
技術領域
本發明屬于農業及植物檢疫技術領域,具體涉及一種實時熒光RT-PCR檢測獼猴桃潰瘍病原菌Pseudomonas syringaepv.actinidae的引物及其檢測方法和應用。
背景技術
獼猴桃被稱為水果之王和維生素C之冠,具有較高的經濟效益,國內的主要種植區有四川、陜西和貴州等地。對于獼猴桃病害的檢測、防控,是提高其經濟價值,促進地區獼猴桃行業經濟發展的必要手段。
潰瘍病是一種嚴重威脅獼猴桃生產的致命性細菌性病害,被列為全國森林植物檢疫對象。美國、新西蘭、日本、中國的專家學者先后開展了獼猴桃潰瘍病菌鑒定,但對于該致病變種的歸屬尚無定論,目前對于該病害的病原菌認定主要有獼猴桃致病變種(Pseudomonas syringaepv.Actinidiae,Psa)、丁香致病變種(Pseudomonas syringaepv.Syringae)和死李致病變種(Pseudomonas syringae pv.Morsprunorum)。獼猴桃潰瘍病原菌在6月中旬至9月底有很高的產孢能力,當獼猴桃幼果感染病原菌時,會嚴重影響果實的生長,在6月感染時,容易發生采前落果,該病原菌對于果底部和果中部均有較強的侵染能力。
實時熒光RT-PCR檢測法具有獨特的優勢,可以精確的檢測不同組織、不同材料中病原菌的相對含量,得到了廣泛的應用,如中國專利ZL 201610858546.X公布了一種實時熒光定量PCR檢測土壤西瓜枯萎病菌的方法及引物,中國專利ZL 201410089841.4公布了一種檢測大白菜黃萎病病原菌的實時熒光定量PCR方法。
不過,在對獼猴桃潰瘍病原菌Pseudomonas syringaepv.actinidae的檢測方面,尚未發現效果較好的實時熒光RT-PCR檢測的特異性引物。
因此,研究開發適于檢測獼猴桃潰瘍病原菌Pseudomonas syringaepv.actinidae的實時熒光RT-PCR檢測的特異性引物及其檢測方法,對于獼猴桃潰瘍病的檢測、預防和控制具有良好的學術價值和經濟意義。
發明內容
針對現有技術的缺點,本發明的目的之一在于提供一種實時熒光RT-PCR檢測獼猴桃潰瘍病原菌Pseudomonas syringaepv.actinidae的特異性引物,其中,所述特異性引物由正向引物和反向引物組成,所述正向引物為:5'-CCGCTGTGATACAATTCGGC-3',如SEQ IDNO.1所示,所述反向引物為:5'-CGCACATAAGACAACAGGCG-3',如SEQ ID NO.2所示;利用所述特異性引物對獼猴桃潰瘍病原菌Pseudomonas syringaepv.actinidae進行實時熒光RT-PCR檢測比進行普通PCR檢測的靈敏度至少提高100倍。
本發明的目的之二在于提供包含上述特異性引物的實時熒光RT-PCR檢測獼猴桃潰瘍病原菌Pseudomonas syringaepv.actinidae的試劑盒。
本發明的目的之三在于提供一種實時熒光RT-PCR檢測獼猴桃潰瘍病原菌Pseudomonas syringaepv.actinidae的方法,所述方法包括如下步驟:
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