[發明專利]小麥黃條紋病毒及其NASH檢測方法、檢測試劑盒有效
| 申請號: | 201810135714.1 | 申請日: | 2018-02-09 |
| 公開(公告)號: | CN108315337B | 公開(公告)日: | 2021-06-25 |
| 發明(設計)人: | 劉艷;杜真真;王錫鋒 | 申請(專利權)人: | 中國農業科學院植物保護研究所 |
| 主分類號: | C12N15/40 | 分類號: | C12N15/40;C12Q1/70;C12Q1/6811;C12Q1/6834;C12Q1/6804;C12N15/11;C12R1/94 |
| 代理公司: | 北京兆君聯合知識產權代理事務所(普通合伙) 11333 | 代理人: | 胡敬紅 |
| 地址: | 100193 *** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 小麥 條紋 病毒 及其 nash 檢測 方法 試劑盒 | ||
1.小麥黃條紋病毒(Wheat yellow striate virus, WYSV)基因組序列,該序列如SEQID NO.3所示。
2.一種用于權利要求1所述小麥黃條紋病毒(Wheat yellow striate virus, WYSV)的核酸斑點雜交檢測方法,包括如下步驟:
(1)重組質粒的獲得:所述的重組質粒是含WYSV部分基因目的片段的pMD -18T重組載體;所述的重組載體是通過WYSV特異性引物對以反轉錄PCR擴增獲得的PCR產物,純化后連接至pMD -18T載體上,轉化至DH 5α大腸桿菌感受態中;所述WYSV特異性引物對為:
SEQ ID NO.1:5’ ggtgctcagtgtcgctttct -3’;
SEQ ID NO.2:5’ acctgctgttccattcttgtc -3;
(2)地高辛標記探針的制備:所述探針為以地高辛為標記物通過PCR法制得的DNA探針,所述制備探針的PCR體系中總體積25 μL,其中0.5 μL重組質粒、2 μL濃度為2.5 mM的DIG-dNTPs、0.2 μL rTaq以及濃度為10 μmol/L的WYSV特異性引物對各0.5μL,
在制備探針的PCR體系反應液中,包含有如下一對特異性引物對,其核苷酸序列為:
SEQ ID NO.1:5’ ggtgctcagtgtcgctttct -3’;
SEQ ID NO.2:5’ acctgctgttccattcttgtc -3’;
(3)通過點樣和雜交進行NASH檢測:
將待測總RNA樣品點于硝酸纖維素尼龍膜上,加入雜交緩沖液進行預雜交;將步驟(2)中制備的地高辛標記探針加入雜交緩沖液中雜交,再免疫顯色。
3.根據權利要求2所述的檢測方法,所述步驟(1)中PCR擴增反應條件為:94℃ 3 min,94℃ 30 s、56℃ 45 s 和72℃90 s共35 個循環,72℃ 10 min。
4.權利要求2-3任一所述的檢測方法在檢測感病農作物植株體內WYSV病毒中的應用。
5.根據權利要求4所述的應用,所述農作物為小麥,大麥或燕麥。
6.一種用于檢測 WYSV病毒的試劑盒,該試劑盒包括有: PCR體系反應液、NASH反應試劑、硝酸纖維素膜和雜交袋;所述的NASH反應試劑由以下組分組成:
SDS: 10%w/v
封閉液: 封閉劑用Buffer1稀釋到10%
洗滌液: Buffer1+0.3%w/v Tween-20
Buffer 1: 0.1M Maleic acid,0.15M NaCl,pH7.5
Buffer 2: 將封閉液用Buffer 1稀釋10倍
Buffer 3: 100mMTris-HCl,100mMNaCl,pH9.5
Buffer 4: 10mMTris-HCl,1mM EDTA,pH8.0
NBI/CBIP: 10mL
顯色底物溶液: 200μL NBT/BCIP加入10mL Buffer3中
雜交緩沖液: 5×SSC,2%w/v封閉液,0.02%w/v SDS, 0.1%w/v N-lauroylsarcosine, 50%甲酰胺
AP-DIG抗體: 50μL
20×SSC溶液: 3MNaCl,0.3M Na-citrate, pH7.0,實驗中所需的0.5×SSC、2×SSC、5×SSC溶液由20×SSC做相應稀釋;
所述PCR體系反應液中含WYSV特異性引物對,其序列如下:
SEQ ID NO.1:5’ ggtgctcagtgtcgctttct -3’;
SEQ ID NO.2:5’ acctgctgttccattcttgtc -3;
通過PCR體系反應得到地高辛標記探針。
7.根據權利要求6所述的試劑盒,所述試劑盒中還包括WYSV陽性對照樣品和陰性對照樣品。
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