[發明專利]新疆多浪羊不同生理時期繁殖相關蛋白的篩選與鑒定方法有效
| 申請號: | 201810106686.0 | 申請日: | 2018-02-02 |
| 公開(公告)號: | CN108398494B | 公開(公告)日: | 2019-11-15 |
| 發明(設計)人: | 常衛華;徐輝;王娟紅;錢偉;崔子龍 | 申請(專利權)人: | 塔里木大學 |
| 主分類號: | G01N30/02 | 分類號: | G01N30/02;G01N27/62;G01N33/68 |
| 代理公司: | 11385 北京方圓嘉禾知識產權代理有限公司 | 代理人: | 董芙蓉<國際申請>=<國際公布>=<進入 |
| 地址: | 843300新疆維吾爾自*** | 國省代碼: | 新疆;65 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 生理時期 蛋白 高效液相色譜HPLC 繁殖 卵巢 篩選 生物技術領域 標準曲線 蛋白定量 蛋白提取 等量混合 試劑標記 顯著差異 樣品標記 質譜分析 質譜檢測 數據處理 分級 高PH 肽段 繪制 | ||
1.一種新疆多浪羊不同生理時期繁殖相關蛋白的篩選與鑒定方法,其特征在于,包括以下步驟:
步驟1、新疆多浪羊不同生理時期卵巢的獲得:
通過同期發情、發情鑒定和妊娠鑒定技術,將發情間期、發情期和妊娠期多浪羊屠宰后立即取出卵巢,并用PBS緩沖液沖洗PH7.4組織表面,之后迅速投入液氮進行快速冷凍,并帶回實驗室-80℃保存備用;
步驟2、蛋白提取:
分別取發情間期、發情期和妊娠期多浪羊卵巢0.1g,加入0.4mL的蛋白裂解液,所述蛋白裂解液的成分為:8.0M脲、50mM NH4HCO3、1×蛋白酶抑制劑,進行超聲破碎,其設置為每次2s,間隔10s,共5min,整個操作在冰上進行;超聲破碎物在冰上放置20min后,4℃,10,000×g,離心30min,取上清轉入新管,然后將蛋白提取液分裝并在-80℃冰箱保存備用;
步驟3、Bradford蛋白定量和標準曲線的繪制
采用Bradford法對蛋白進行定量,先將已知含量的牛血清白蛋白BSA配成不同濃度的蛋白溶液,分別測定其顯色后的光吸收值OD值,根據OD值與蛋白濃度之間的線性關系,繪制出蛋白濃度的標準曲線,然后測定待測蛋白溶液顯色后的OD值,參照BSA標準曲線計算待測蛋白的濃度;所有操作步驟均在室溫狀態完成;
分別取BSA 8μg、10μg、12μg、14μg、16μg、18μg配成不同濃度的蛋白溶液,并測定吸光值,如果相關性R2<0.95,標準曲線不能用于計算,重新進行實驗;
根據計算配置蛋白溶液,總體積為20μL;同時準備被檢樣本1.0μL,與19μL水混合,加入檢測酶標板,每個樣本檢測2個復孔;每個復孔加入200μL Bradford工作液,輕微吸打混勻;避光,室溫靜止放置15min;用酶標儀檢測,檢測波長設定在595nm;根據標準曲線推導出檢測蛋白的總量,并計算相應濃度;步驟4、樣品標記和等量混合
各組樣品肽段分別取100μg,按照AB公司試劑盒:iTRAQ Reagent-8plex MuLtiplexKit說明書進行標記,標記之后取少量樣本混合,進行LC-MS/MS質譜檢測,查看iTRAQ標記效率;
步驟5、高PH條件下C18色譜柱的HPLC分級
步驟6、質譜分析
毛細管高效液相色譜
每份樣品采用納升流速HPLC液相系統Easy nLC 1000進行分離;緩沖液:A液為0.1%甲酸水溶液,B液為0.1%甲酸乙腈溶液;色譜柱以95%的A液平衡;樣品由自動進樣器上樣到色譜柱C18 trap column,C18 3μm 100μm×2cm,再經分析柱C18 column,C18 3μm75μm×15cm分離,流速為300nl/min;
質譜鑒定
每份樣品經毛細管高效液相色譜分離后用Orbitrap Fusion lumos質譜儀進行質譜分析;
步驟7、數據處理
原始質譜數據
質譜分析原始數據為RAW文件,用軟件用軟件Sequest和Proteome Discoverer進行搜庫定性及定量分析;
數據庫
本次使用數據庫:protein.selected.fasta
搜庫
搜庫時將RAW文件通過Proteome Discoverer提交至Sequest服務器,選擇已經建立好的數據庫,然后進行數據庫搜索。
2.根據權利要求1所述的新疆多浪羊不同生理時期繁殖相關蛋白的篩選與鑒定方法,其特征在于,步驟5具體為:
1)將標記抽干后的樣品用100μl流動相A復溶,渦旋振蕩,14,000g離心20min,吸取上清上樣;
2)準備60個空白1.5ml離心管,依次標記為1-60,用于收集分離得到的組份1-60;
3)流速0.7ml/min;
4)從第五分鐘開始,依次收集每1.5分鐘洗脫物到1-60號離心管中;
5)真空冷凍離心干燥;
6)將干燥后的樣品用5μL 0.5%的FA重溶,并將收集到的60個組分合并成6個組分;
7)將合并后的組分14,000g,離心10min,吸取上清上樣10μL。
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