[發明專利]一種鑒定香港牡蠣、熊本牡蠣及其雜交子一代的EST-SSR引物和鑒定方法有效
| 申請號: | 201810098698.3 | 申請日: | 2018-01-31 |
| 公開(公告)號: | CN108220456B | 公開(公告)日: | 2020-06-05 |
| 發明(設計)人: | 馬海濤;喻子牛;張躍環;肖述 | 申請(專利權)人: | 中國科學院南海海洋研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/6888 | 分類號: | C12Q1/6888;C12Q1/686;C12N15/11 |
| 代理公司: | 廣州科粵專利商標代理有限公司 44001 | 代理人: | 劉明星 |
| 地址: | 510301 *** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 鑒定 香港 牡蠣 熊本 及其 雜交 一代 est ssr 引物 方法 | ||
1.鑒定香港牡蠣、熊本牡蠣及其雜交子一代的EST-SSR引物Ch513,其特征在于,所述的EST-SSR引物Ch513為:
F:5’-CTGGAATCGGTATGTCTT-3’;
R:5’-GTTACGTGCACCCTAAAT-3’。
2.一種鑒定香港牡蠣、熊本牡蠣及其雜交子一代的試劑盒,其特征在于,含有權利要求1所述的EST-SSR引物Ch513。
3.一種香港牡蠣、熊本牡蠣及其雜交子一代的鑒定方法,其特征在于,包括以下步驟:
提取待測牡蠣樣品的基因組DNA,然后用權利要求1所述的EST-SSR引物Ch513進行PCR擴增,將擴增產物進行電泳和染色,若在260bp~290bp區間內出現1~2條條帶,則待測牡蠣樣品為香港牡蠣,出現1條條帶說明該個體為純合子,出現2條條帶則說明該個體為雜合子;若在230bp~250bp區間內出現1~2條條帶,則待測牡蠣樣品為熊本牡蠣,出現1條條帶說明該個體為純合子,出現2條條帶則說明該個體為雜合子;當同時在260bp~290bp區間和230bp~250bp區間內各出現1條帶,則待測牡蠣樣品為香港牡蠣與熊本牡蠣雜交子一代。
4.根據權利要求3所述的鑒定方法,其特征在于,所述的用EST-SSR引物Ch513進行PCR擴增,其PCR擴增體系為:25μL,其中各種成分及終濃度分別為:DNA模板50ng,Buffer 10mM,引物各0.2mM,dNTP 0.2mM,Mg2+2.0mM,Taq DNA聚合酶1U,用滅菌水補足25μL。
5.根據權利要求3所述的鑒定方法,其特征在于,所述的用EST-SSR引物Ch513進行PCR擴增,其PCR反應程序為:94℃預變性5min;94℃變性30s,55℃退火30s,72℃延伸1min,重復30次;72℃延伸10min。
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