[發(fā)明專利]一種用于檢測松材線蟲的等溫擴(kuò)增試劑盒及其檢測方法在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201810097932.0 | 申請日: | 2018-01-31 |
| 公開(公告)號: | CN108118087A | 公開(公告)日: | 2018-06-05 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 石超;王熊;李榮貴;耿以龍 | 申請(專利權(quán))人: | 青島大學(xué) |
| 主分類號: | C12Q1/6844 | 分類號: | C12Q1/6844 |
| 代理公司: | 青島清泰聯(lián)信知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 37256 | 代理人: | 高洋 |
| 地址: | 266071 山*** | 國省代碼: | 山東;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 松材線蟲 檢測 等溫擴(kuò)增 試劑盒 擴(kuò)增引物 單條松材線蟲 松材線蟲檢測 快速檢測 上游引物 下游引物 顯色檢測 核酸 染料 比色 擴(kuò)增 應(yīng)用 | ||
本發(fā)明提出一種用于檢測松材線蟲的等溫擴(kuò)增試劑盒及其檢測方法,屬于松材線蟲檢測領(lǐng)域,能在一個小時內(nèi)完成松材線蟲核酸的提取、擴(kuò)增、顯色檢測,在檢測到單條松材線蟲的同時有效區(qū)分松材線蟲和擬松材線蟲。該用于檢測松材線蟲的等溫擴(kuò)增試劑盒包括SEA擴(kuò)增引物、2×SEA reaction Mix和10×SEA比色染料,其中,所述SEA擴(kuò)增引物包括如SEQ ID No.1所示的上游引物和如SEQ ID No.2所示的下游引物。本發(fā)明能夠應(yīng)用于松材線蟲的快速檢測中。
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明屬于松材線蟲的檢測領(lǐng)域,尤其涉及一種用于檢測松材線蟲的等溫擴(kuò)增試劑盒及其檢測方法。
背景技術(shù)
松材線蟲(Bursaphe lenchus xylophilus)引起的松樹萎蔫病是松林主要的病害之一,1982年,松材線蟲病傳入我國,僅短短的30多年,疫區(qū)范圍擴(kuò)大到江蘇、浙江、安徽、福建、江西、山東、湖北、湖南、廣東、廣西、四川、重慶、貴州、云南等17個省區(qū)市,造成經(jīng)濟(jì)損失上千億元,嚴(yán)重威脅著我國松林生態(tài)系統(tǒng)和經(jīng)濟(jì)財產(chǎn)安全,因此,建立一種靈敏、快速、簡便的松材線蟲檢測方法對松材線蟲的防治極為重要。
因病原體松材線蟲與低致病性的擬松材線蟲及其近緣種之間在形態(tài)學(xué)上很難區(qū)分,用形態(tài)學(xué)方法上容易造成誤判、漏判,所以形態(tài)學(xué)鑒定的方法逐漸被淘汰。近年來,隨著分子生物學(xué)的發(fā)展,特異性引物PCR、實(shí)時熒光定量PCR等分子診斷方法被應(yīng)用到松材線蟲的檢測上,提高了松材線蟲檢測的準(zhǔn)確性。但依然存在很多缺點(diǎn),如耗時長、操作繁瑣、需要昂貴的熱循環(huán)儀器,而且很多需要開蓋檢測容易造成污染,需要在專門的實(shí)驗(yàn)室中操作。因此建立一種快速、簡單、無污染,可快速檢測線蟲的技術(shù)意義重大。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明提出一種用于檢測松材線蟲的等溫擴(kuò)增試劑盒及其檢測方法,該等溫擴(kuò)增試劑盒具有靈敏度高、特異性好、操作簡單、耗時短等特點(diǎn),能夠在一個小時內(nèi)完成松材線蟲核酸的提取、擴(kuò)增、顯色等檢測,為松材線蟲的快速檢測提供一種實(shí)際可行的方法。
為了解決上述技術(shù)問題,本發(fā)明的一方面提供了一種用于檢測松材線蟲的等溫擴(kuò)增試劑盒,包括SEA擴(kuò)增引物、2×SEA reaction Mix和10×SEA比色染料,其中,所述SEA擴(kuò)增引物包括如SEQ ID No.1所示的上游引物和如SEQ ID No.2所示的下游引物。
本發(fā)明的另一方面提供了一種檢測松材線蟲的方法,包括以下步驟:
1)采用熱裂解法從待檢測樣品中提取松材線蟲基因組DNA;
2)以提取的含有松材線蟲基因組DNA的裂解液作為擴(kuò)增模板,加入如權(quán)利要求1所述的等溫擴(kuò)增試劑盒中的組分建立SEA反應(yīng)體系并進(jìn)行等溫擴(kuò)增;
3)根據(jù)擴(kuò)增產(chǎn)物的顏色變化,判斷待檢測樣品中是否存在松材線蟲。
作為優(yōu)選,步驟1)具體為:
取松材線蟲懸浮液4.5μl加入到0.5ml的Eppendorf管中,然后加入5μl 2×-8×標(biāo)準(zhǔn)濃度WLB液,并向管中加入0.5μl的20×液相RNase去除劑,最后在80-99℃處理2-20min,得到松材線蟲的裂解液作為擴(kuò)增模板。
作為優(yōu)選,步驟1)具體為:
取松材線蟲懸浮液4.5μl加入到0.5ml的Eppendorf管中,然后加入5μl WLB液,并向管中加入0.5μl的20×液相RNase去除劑,最后在95℃處理5min,得到松材線蟲的裂解液作為擴(kuò)增模板。
作為優(yōu)選,所述SEA反應(yīng)體系以恒定62-66℃的溫度反應(yīng)40-60分鐘。
作為優(yōu)選,所述SEA反應(yīng)體系以恒定63℃的溫度反應(yīng)50分鐘。
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