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[發(fā)明專利]一種耐藥性大腸桿菌整合酶活性測定方法有效

專利信息
申請?zhí)枺?/td> 201810073368.9 申請日: 2018-01-25
公開(公告)號: CN108018334B 公開(公告)日: 2021-07-16
發(fā)明(設(shè)計)人: 賈芳;楊江流 申請(專利權(quán))人: 河套學(xué)院
主分類號: C12Q1/6851 分類號: C12Q1/6851
代理公司: 西安銘澤知識產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 61223 代理人: 韓曉娟
地址: 015000 內(nèi)蒙*** 國省代碼: 內(nèi)蒙古;15
權(quán)利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關(guān)鍵詞: 一種 耐藥性 大腸桿菌 整合 活性 測定 方法
【權(quán)利要求書】:

1.一種耐藥性大腸桿菌整合酶活性測定方法,其特征在于,包括以下步驟:

S1,提取大腸桿菌質(zhì)粒DNA;

S2,以S1中的質(zhì)粒DNA為模板,設(shè)計特異性引物,PCR擴增出編碼整合酶的整合子基因intI,并連接到表達載體pEASY-E1上,得重組載體pEASY-intI,然后將pEASY-intI轉(zhuǎn)化到大腸桿菌BL21(DE3)中,得到轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21(DE3);所述特異性引物為:

上游引物Int-F:5’-ccggaattccggacgcgtctgacccccaa-3’,

下游引物Int-R:5’-cccaagcttgggcccgccgctgagatgc-3’;

S3,以S1中質(zhì)粒DNA為模板設(shè)計與載體質(zhì)粒PUC19具有相同酶切位點和保護性堿基的特異性引物,PCR擴增出含整合酶基因重組位點attI和基因盒基因重組位點attC的DNA片段,將PCR擴增所得DNA片段連接到載體質(zhì)粒PUC19上,得重組載體PUC19-attI-attC,并將載體PUC19-attI-attC轉(zhuǎn)化于大腸桿菌DH5α中,得到轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α;所述特異性引物為:

上游引物attIF:5’-tgatgttatggagcagcaacg-3’,

下游引物attCR:5’-acctaacgtttgacatgagggg-3’;

S4,將S2中的轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21(DE3)與S3中的轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α過夜共培養(yǎng),用實時熒光定量PCR測定發(fā)生整合作用的拷貝數(shù)A和未發(fā)生整合作用的拷貝數(shù)B,按公式C=A/(A+B)計算整合效率C;或者分別提取S2中的轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21(DE3)和S3中的轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α的質(zhì)粒,并在Tris-HCl、NaCl、EDTA、甘油混合反應(yīng)體系中加熱,用實時熒光定量PCR測定發(fā)生整合作用的拷貝數(shù)A1和未發(fā)生整合作用的拷貝數(shù)B1,按公式C1=A1/(A1+B1)計算整合效率C1;其中,實時熒光定量PCR測定時,attIattC位點之間間隔DNA序列非440bp,則為發(fā)生了整合作用,否則未發(fā)生整合作用;所述整合效率的數(shù)值大小表示整合酶活性大小。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的耐藥性大腸桿菌整合酶活性測定方法,其特征在于,S4中每升Tris-HCl、EDTA、甘油混合反應(yīng)體系的配方為:20mmol Tris-HCl 100mmol NaCl、0.1 mmolEDTA、20ml質(zhì)量濃度為1%的甘油,雙蒸水定容至1L,反應(yīng)體系的pH為7.5;反應(yīng)條件:37℃,1小時,然后80℃,20min。

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1、專利原文基于中國國家知識產(chǎn)權(quán)局專利說明書;

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