[發(fā)明專利]一種與大口黑鱸快速生長相關(guān)的單倍型標(biāo)記及其應(yīng)用

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201810069432.6
• 申請日: 2018-01-24
• 公開（公告）號: CN108250285B
• 公開（公告）日: 2021-08-10
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 李勝杰;白俊杰;趙犖;樊佳佳;姜鵬;孫建國;吳建開
• 申請（專利權(quán)）人: 中國水產(chǎn)科學(xué)研究院珠江水產(chǎn)研究所
• 主分類號: C07K14/46
• 分類號: C07K14/46;C12N15/12;C12N15/11;C12Q1/6888
• 代理公司: 廣州嘉權(quán)專利商標(biāo)事務(wù)所有限公司 44205
• 代理人: 胡輝;舒勝英

本發(fā)明公開了一種與大口黑鱸快速生長相關(guān)的單倍型標(biāo)記及其應(yīng)用，所述單倍型標(biāo)記由位于大口黑鱸熱激蛋白HSP70基因組序列SEQ ID NO：3的第1313位和2346位的SNP位點(diǎn)，以及第259位和2302堿基處的插入缺失突變位點(diǎn)組成，這4個位點(diǎn)完全連鎖。利用本發(fā)明單倍型標(biāo)記，在生產(chǎn)中保留第1313、259、2302、2346位的基因型分別為GA、T?、Y?、AT的大口黑鱸親本(Y表示堿基片段CTGTCTTCTGTTCATAAGTGTC)，去除其他基因型的個體，便可快速獲得生長速度快且遺傳穩(wěn)定的大口黑鱸品種。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明屬于分子生物技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及一種與大口黑鱸快速生長相關(guān)的單倍型標(biāo)記及其應(yīng)用。

背景技術(shù)

大口黑鱸(Micropterus salmoides L.)，又稱加州鱸，原產(chǎn)于北美洲，具有適應(yīng)性強(qiáng)、生長快、病害少、耐低溫、生長周期短以及味道鮮美等優(yōu)點(diǎn)，是重要的淡水養(yǎng)殖魚類之一。1983年從臺灣引種到廣東省，現(xiàn)在全國大部分地區(qū)均有養(yǎng)殖。但是，引種30多年來，由于生產(chǎn)單位不注重親本留種須遵守的操作規(guī)程，也沒能定期從原產(chǎn)地補(bǔ)充和引進(jìn)親本，導(dǎo)致養(yǎng)殖大口黑鱸遺傳多樣性降低，從而使生產(chǎn)性能降低，主要表現(xiàn)在生長速度下降、餌料轉(zhuǎn)化效率低、抗病力也大幅下降。其中，生長速度關(guān)系到大口黑鱸產(chǎn)量的高低，養(yǎng)殖效益的大小。大口黑鱸生長退化的趨勢直接制約著大口黑鱸養(yǎng)殖業(yè)的發(fā)展。因此，改良大口黑鱸生長速度的工作非常重要。

傳統(tǒng)提高養(yǎng)殖魚類生長速度的主要方法是挑選優(yōu)良性狀的親魚，挑選個體較大、身體健壯的魚作為留種親本，即根據(jù)表型來決定親魚是否留種。這種方法方便、快捷、簡單，但受人為因素影響很大，加上大口黑鱸屬于肉食性為主的魚類，掠食性強(qiáng)，餌料不足是會互相殘食，致使其生長懸殊較大。如此可見，僅從表型判斷大口黑鱸親本質(zhì)量往往達(dá)不到理想的效果。隨著分子生物學(xué)和遺傳學(xué)的發(fā)展，已涌現(xiàn)出很多種遺傳標(biāo)記，如AFLP、RAPD、SSR、SNP等標(biāo)記，其中，SNP標(biāo)記因分布廣泛，適宜高通量自動化分析，遺傳穩(wěn)定，日益成為遺傳育種研究中首選的遺傳標(biāo)記。若這些遺傳標(biāo)記能與生產(chǎn)性狀相關(guān)聯(lián)在一起，即可實(shí)現(xiàn)從DNA水平上進(jìn)行選擇育種，克服了傳統(tǒng)方法受人為因素影響大的不利因素，提高了選擇的準(zhǔn)確性，并且可實(shí)現(xiàn)在早期鑒定出具有優(yōu)良性狀的個體，篩選出優(yōu)良的后備親本，從而縮短育種周期，加快育種進(jìn)程。通過發(fā)現(xiàn)與大口黑鱸快速生長有關(guān)的基因，大大提高快長親本的篩選效果。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的一個目的在于提供一種與大口黑鱸快速生長相關(guān)的單倍型標(biāo)記及其應(yīng)用，該分子標(biāo)記可作為大口黑鱸生長性狀的可靠標(biāo)記，便于進(jìn)行早期選擇，從而縮短世代間隔，提高選擇強(qiáng)度，提高選育效率和準(zhǔn)確性。

本發(fā)明的另一個目的在于提供一種快速生長大口黑鱸親本的篩選方法。

本發(fā)明所采取的技術(shù)方案是：

大口黑鱸HSP70的氨基酸序列如SEQ ID NO：1所示。

大口黑鱸HSP70的cDNA序列如SEQ ID NO：2所示，其中第993位R為堿基G或A。

大口黑鱸HSP70的基因序列如SEQ ID NO：3所示，其中第1313位R為堿基G或A，第259位K為堿基T或者為堿基缺失，第2302位S為堿基片段CTGTCTTCTGTTCATAAGTGTC或者為堿基片段缺失，第2346位W為堿基A或T。

大口黑鱸生長速度相關(guān)的SNP位點(diǎn)或插入缺失突變位點(diǎn)，所述SNP位點(diǎn)位于HSP70基因組序列SEQ ID NO：3所示的第1313位和第2346位，所述插入缺失突變位點(diǎn)位于HSP70基因組序列SEQ ID NO：3所示的第259位和第2302位。

上述所述SNP位點(diǎn)或插入缺失突變位點(diǎn)在判斷大口黑鱸生長快慢中的應(yīng)用。

上述所述SNP位點(diǎn)或插入缺失突變位點(diǎn)在篩選快速生長大口黑鱸中的應(yīng)用。

一種篩選快速生長大口黑鱸的方法，