[發明專利]水稻低直鏈淀粉含量基因Wx-mq的分子標記特異性引物及其應用

在審

• 申請號: 201810042407.9
• 申請日: 2018-01-17
• 公開（公告）號: CN108103228A
• 公開（公告）日: 2018-06-01
• 發明（設計）人: 王曉靜;孫林靜;孫玥;張融雪;閆雙勇;李軍玲;崔中秋;蘇京平;王勝軍
• 申請（專利權）人: 天津市農作物研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11;C12Q1/686
• 代理公司: 天津市杰盈專利代理有限公司 12207
• 代理人: 朱紅星

本發明公開了水稻低直鏈淀粉含量基因Wx?mq的分子標記特異性引物及其應用，該分子標記的上游引物WxF如SEQ ID NO.1所示，下游引物WxR如SEQ ID NO.2所示；擴增產物大小為200 bp。通過本發明提供的水稻低直鏈淀粉含量基因Wx?mq的分子標記檢測方法可以鑒定水稻品種資源中是否含有隱形純合的Wx?mq基因，并能夠準確區別Wx?mq的純合和雜合基因型，大大提高含Wx?mq基因水稻品種的選擇效率，加快水稻食味品質育種進程。

技術領域

本發明屬于農作物分子遺傳育種學技術領域，涉及水稻低直鏈淀粉含量基因Wx-mq的分子標記特異性引物及其應用。

背景技術

水稻是我國第一大糧食作物，也是我國人民的主食。近幾年我國水稻產量逐年上升，隨著人民生活水平的提高，人們對大米的要求不僅體現在產量上面，對大米的品質，特別是食味品質提出了更高的要求。水稻的食味品質主要包括香味、適口性、米飯粘性、軟硬度等；蒸煮品質主要包括直鏈淀粉含量、膠稠度、糊化溫度（堿消值）等。研究表明，稻米中直鏈淀粉含量高，糊化溫度升高，膠稠度降低，使飯質變硬、口感差。因而水稻胚乳中直鏈淀粉的含量在決定稻米食用品質與蒸煮加工品質上起著重要作用。日本在1991年利用N-甲基-N-亞硝基脲（MNU）處理粳稻品種越光，獲得低直鏈淀粉含量突變體Milky Queen，該突變體的Wx-mq基因編碼區發生了兩個堿基（GA）的替換，導致其直鏈淀粉含量降低為9%-12%。中日科學家利用含該基因的水稻資源Milky Queen，培育了一批食味品質優良、直鏈淀粉偏低的水稻品種，有學者稱之為“軟米水稻”，例如關東194、南粳9108、南粳46、滬嘉香軟等。

分分子標記輔助選擇育種（MAS）已經成為水稻育種的一個重要手段，能準確、方便地跟蹤目標性狀，選擇過程不受環境和人為因素的影響。本發明根據低直鏈淀粉含量基因Wx-mq的突變位點，設計了用于特異檢測含Wx-mq基因水稻品種的dCAPS標記，該標記所使用的限制性內切酶Mlu I可以識別Wx-mq等位基因Wx-b擴增片段中的“ACGCGT”位點，將PCR擴增產物酶切為176 bp和24 bp兩條帶；由于含有純合隱性Wx-mq基因的“G”位點突變為“A”，因此Mlu I無法酶切此PCR片段。開發的dCAPS標記可以直接區分Wx-mq純合與雜合基因型，在Wx-mq育種和資源創新過程中，利用此標記選擇所需的基因型，減少育種盲目性和田間工作量，對提高我國水稻食味品質育種水平有重大意義。

發明內容

本發明的目的是：提供水稻品種低直鏈淀粉含量基因Wx-mq的分子檢測方法。通過檢測Wx-mq基因及其等位基因擴增片段的酶切片段數目及大小，確定Wx-mq基因的雜合與純合基因型，提高食味品質性狀選擇效率，加快育種進程。

本發明的目的可通過如下技術方案實現：