[發明專利]大口黑鱸生長相關的SNP位點及其應用

有效

• 申請號: 201810037972.6
• 申請日: 2018-01-16
• 公開（公告）號: CN110041422B
• 公開（公告）日: 2022-07-19
• 發明（設計）人: 李勝杰;樊佳佳;姜鵬;白俊杰;孫建國;吳建開
• 申請（專利權）人: 中國水產科學研究院珠江水產研究所
• 主分類號: C07K14/46
• 分類號: C07K14/46
• 代理公司: 廣州嘉權專利商標事務所有限公司 44205
• 代理人: 胡輝;舒勝英

本發明公開了大口黑鱸生長相關的SNP位點及其應用，所述生長相關的SNP位點位于HSC70?1基因序列第821、2804位堿基。本發明發現在HSC70?1的C+821G位置存在等位基因C和等位基因G，組成三種基因型CC、GC和GG，在A+2804T位置存在等位基因A和等位基因T，組成三種基因型AA、AT和TT。當第821和2804堿基位置基因型為CC和TT的個體的生長性狀明顯優于其他基因型的個體。利用該現象將生產中保留CC和TT基因型的大口黑鱸親本，去除其他基因型的個體，便可快速獲得生長速度快且遺傳穩定的大口黑鱸品種，即本發明SNP位點可應用于快速生長大口黑鱸親本的篩選。

技術領域

本發明屬于分子生物技術領域，具體涉及大口黑鱸生長性狀關聯的SNP位點及其應用。

背景技術

大口黑鱸(Micropterus salmoides L.)，又稱加州鱸，原產于北美洲，具有適應性強、生長快、病害少、耐低溫、生長周期短以及味道鮮美等優點，是重要的淡水養殖魚類之一。1983年從中國臺灣引種到廣東省，現在全國大部分地區均有養殖。但是，引種30多年來，由于生產單位不注重親本留種須遵守的操作規程，也沒能定期從原產地補充和引進親本，導致養殖大口黑鱸的遺傳多樣性降低，從而使生產性能也降低，主要表現在生長速度下降、餌料轉化效率低、抗病力也大幅下降。其中，生長速度關系到大口黑鱸產量的高低，養殖效益的大小。大口黑鱸生長退化的趨勢直接制約著大口黑鱸養殖業的發展。因此，改良大口黑鱸生長速度的工作非常重要。

挑選優質親魚是提高養殖魚類生長速度的主要方法之一，其目的是為了改變養殖群體的遺傳結構，使后代獲得更快的生長速度、更好的抗病能力的遺傳特點。在生產中，其傳統方法是挑選個體較大、身體健壯的魚作為留種親本，即根據表型來決定親魚是否留種。這種方法方便、快捷、簡單，但受人為因素影響很大，加上大口黑鱸屬于肉食性為主的魚類，掠食性強，餌料不足是會互相殘食，致使其生長懸殊較大。如此可見，僅從表型判斷大口黑鱸親本質量往往達不到理想的效果。隨著分子生物學和遺傳學的發展，已涌現出很多種遺傳標記，如AFLP、RAPD、SSR、SNP等標記，其中，SNP標記因分布廣泛，適宜高通量自動化分析，遺傳穩定，日益成為遺傳育種研究中首選的遺傳標記。若這些遺傳標記能與生產性狀相關聯在一起，即可實現從DNA水平上進行選擇育種，克服了傳統方法受人為因素影響大的不利因素，提高了選擇的準確性，并且可實現在早期鑒定出具有優良性狀的個體，篩選出優良的后備親本，從而縮短育種周期，加快育種進程。通過發現與大口黑鱸快速生長相關的分子標記，提高快長親本的篩選效率。

發明內容

本發明的目的之一在于提供一種與大口黑鱸生長性狀相關的SNP位點。

本發明的另一個目的在于提供一種篩選快速生長大口黑鱸親本的方法。

本發明所采取的技術方案是：

大口黑鱸HSC70-1的氨基酸序列如SEQ ID NO：1所示。

上述所述大口黑鱸HSC70-1的基因序列為SEQ ID NO：2所示的核苷酸序列，其第821位S為堿基C或G，第2804位W為堿基A或T。

上述所述大口黑鱸HSC70-1基因序列在判斷大口黑鱸生長快慢中的應用。

大口黑鱸生長速度相關的SNP位點，其位于HSC70-1基因序列SEQ ID NO：2所示的第821位堿基、第2804位堿基。

上述所述SNP位點在判斷大口黑鱸生長快慢中的應用。

上述所述SNP位點在篩選快速生長大口黑鱸中的應用。

一種篩選快速生長大口黑鱸的方法，檢測大口黑鱸HSC70-1基因序列第821位堿基處的SNP位點是否為CC純合體，若是，則為快速生長的大口黑鱸；或者檢測HSC70-1基因序列第2804位堿基處的SNP位點是否為TT純合體，若是，則為快速生長的大口黑鱸。