[發明專利]用于動脈粥樣硬化性心血管疾病的生物標志物

在審

• 申請號: 201780094889.6
• 申請日: 2017-09-13
• 公開（公告）號: CN111108199A
• 公開（公告）日: 2020-05-05
• 發明（設計）人: 揭著業;梁穗莎;夏慧華;賈慧玨
• 申請（專利權）人: 深圳華大生命科學研究院
• 主分類號: C12N15/11
• 分類號: C12N15/11;C12Q1/6883
• 代理公司: 中國國際貿易促進委員會專利商標事務所 11038
• 代理人: 劉海羅

1.一種生物標記物，其包括以下生物標記物1至3中的至少一種：

生物標記物1，其包含SEQ ID NOs:1-146中的至少一種多核苷酸，或其一個或多個特異性片段；

生物標記物2，其包含SEQ ID NOs:147-594中的至少一種多核苷酸，或其一個或多個特異性片段；和

生物標記物3，其包含SEQ ID NOs:595-1411中的至少一種多核苷酸，或其一個或多個特異性片段。

2.根據權利要求1所述的生物標志物，其中所述特異性片段為至少30bp，或至少40bp，或至少50bp，或至少60bp，或至少70bp，或至少80bp，或至少90bp，或至少100bp，或至少150bp，或至少200bp，或至少250bp，或至少300bp，或至少350bp，或至少400bp，或至少450bp，或至少500bp，或至少600bp，或至少700bp，或至少800bp，或至少900bp，或至少1000bp，或至少1500bp，或至少2000bp。

3.根據權利要求1所述的生物標志物，其中：

生物標記物1由SEQ ID NOs:1-146的多核苷酸組成；

生物標記物2由SEQ ID NOs:147-594的多核苷酸組成；和/或

生物標記物3由SEQ ID NOs:595-1411的多核苷酸組成。

4.根據權利要求1-3中任一權利要求所述的生物標志物，其包括生物標志物1、生物標志物2和生物標志物3。

5.根據權利要求1-5中任一權利要求所述的生物標志物，其包含與生物標志物1、生物標志物2或/和生物標志物3的多核苷酸序列具有至少85％序列同一性的多核苷酸。

6.一種生物標志物組合物，其包含至少一種權利要求1-5中所述的生物標志物，任選地，還包含藥學上可接受的賦形劑，例如溶劑或緩沖劑。

7.根據權利要求1-5中任一權利要求所述的生物標志物或權利要求6所述的生物標志物組合物，其用于獲得所述受試者患有ACVD的概率，或用于診斷所述受試者是否患有與ACVD有關的異常狀況或處于發展與ACVD有關的異常狀況的風險中，或用于所述ACVD患者的預后評估，或用于所述ACVD患者的治療監測以檢測對治療的反應。

8.根據權利要求1-5中任一權利要求所述的生物標記物在制備藥物或試劑盒中的用途，所述藥物或試劑盒用于獲得所述受試者患有ACVD的概率，或用于診斷所述受試者是否患有與ACVD有關的異常狀況或處于發展與ACVD有關的異常狀況的風險中，或用于所述ACVD患者的預后評估，或用于所述ACVD患者的治療監測以檢測對治療的反應。

9.一種方法，其用于獲得受試者患有ACVD的概率，或用于診斷受試者是否患有與ACVD有關的異常狀況或處于發展與ACVD有關的異常狀況的風險中，或用于ACVD患者的預后評估，或用于ACVD患者的治療監測以檢測對治療的反應，包括以下步驟：

(1)確定受試者樣品中的唾液乳桿菌(Lactobacillus salivarius)如唾液乳桿菌ACS-116-V-Col5a的相對豐度；

優選地，進一步包括以下步驟：

(2)基于樣品中唾液乳桿菌(Lactobacillus salivarius)的相對豐度和訓練數據集獲得受試者患有ACVD的概率。

10.根據權利要求9所述的方法，其中所述ACVD為冠心病(CHD)、腦血管疾病、外周動脈疾病或主動脈粥樣硬化疾病。

11.根據權利要求9所述的方法，其中所述樣品是糞便樣品。

12.根據權利要求9所述的方法，其中在步驟(2)中，所述訓練數據集是根據多個患有ACVD的受試者和多個正常受試者的唾液乳桿菌的相對豐度構建的。