[發明專利]供多重PCR的引物的設計方法

在審

• 申請號: 201780060312.3
• 申請日: 2017-09-07
• 公開（公告）號: CN109804079A
• 公開（公告）日: 2019-05-24
• 發明（設計）人: 辻本堯之
• 申請（專利權）人: 富士膠片株式會社
• 主分類號: C12Q1/6806
• 分類號: C12Q1/6806;G16B25/20
• 代理公司: 中科專利商標代理有限責任公司 11021
• 代理人: 張國梁

1.一種供多重PCR的引物的設計方法，所述引物用于對基因組上的n個擴增候選區域中t個以上的擴增候選區域進行擴增，所述方法包括以下工序：

第1優先序位設定工序，對于基因組DNA上的n個擴增候選區域，附加作為第1個至第n個的順序的第1優先序位；

第1引物設計工序，按照所述第1優先序位的順序，自所述第1優先序位為第1個的擴增候選區域起，依次設計用于對該擴增候選區域進行PCR擴增的引物；

第1成功與否判斷工序，將所述第1引物設計工序中能夠設計引物的擴增候選區域數設為m個，當m≥t時，確定結束引物的設計，當m＜t時，確定進入下一個工序；

第2優先序位設定工序，對于所述n個擴增候選區域，附加作為第1個至第n個的順序的與第1優先序位的順序不同的第2優先序位；以及

第2引物設計工序，按照所述第2優先序位的順序，自所述第2優先序位為第1個的擴增候選區域起，依次設計用于對該擴增候選區域進行PCR擴增的引物，其中，

所述第2優先序位設定工序是如下工序：

通過輸入裝置輸入所述n個擴增候選區域的識別信息及第1優先序位信息，并存儲于存儲裝置；

運算裝置制作按所述第1優先序位的順序排列、且以所述n個擴增候選區域為要素的第1序列，并存儲于存儲裝置；

運算裝置將按所述第1優先序位的順序排列的所述n個擴增候選區域分割為j個區段，以使第i個區段包括k_i個擴增候選區域，并存儲于存儲裝置；

運算裝置在所述j個區段中至少1個區段的內部重新排列該至少1個區段所含的擴增候選區域，并存儲于存儲裝置；以及

運算裝置將第1個至第j個的區段依次結合，解除區段分割，制作第2序列，將所述第2序列所含的所述n個擴增候選區域的順序設為所述n個擴增候選區域的第2優先序位，

其中，n為滿足n≥4的整數，t為滿足2≤t≤n的整數，m為滿足0≤m≤n的整數，i為滿足1≤i≤j的整數，j為滿足2≤j≤n/2的整數，k_i為滿足2≤k_i≤{n-2×(j-1)}的整數。

2.如權利要求1所述的供多重PCR的引物的設計方法，其中，

在所述第2引物設計工序之后，

進一步包括第2成功與否判斷工序，即，將在所述第2引物設計工序中能夠設計引物的擴增候選區域數設為m’個，當m’≥t時，確定結束引物的設計，當m’＜t時，確定返回所述第2優先序位設定工序；

其中，m’為滿足0≤m’≤n的整數。

3.如權利要求1或2所述的供多重PCR的引物的設計方法，其中，在所述第2優先序位設定工序中，在所述至少1個區段內隨機變更所述擴增候選區域的順序。