[發明專利]基于FraC actinoporin的用于生物聚合物傳感和測序的生物納米孔在審
| 申請號: | 201780052410.2 | 申請日: | 2017-05-24 |
| 公開(公告)號: | CN109890980A | 公開(公告)日: | 2019-06-14 |
| 發明(設計)人: | 喬瓦尼·馬格里亞;卡斯滕·沃洛卡;納塔利·莉薩·瑪特爾;米莎·索斯金;黃剛 | 申請(專利權)人: | 格羅寧根大學 |
| 主分類號: | C12Q1/6869 | 分類號: | C12Q1/6869;B81B1/00;G01N33/487 |
| 代理公司: | 北京英賽嘉華知識產權代理有限責任公司 11204 | 代理人: | 王達佐;洪欣 |
| 地址: | 荷蘭格*** | 國省代碼: | 荷蘭;NL |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 納米孔 生物聚合物 螺旋成孔 毒素 蛋白質納米 旁系同源物 蛋白家族 生物納米 用途領域 電測量 漏斗形 突變型 測序 傳感 遷移 應用 分析 | ||
1.包含漏斗形蛋白質納米孔的系統,所述納米孔包含α-螺旋成孔毒素,所述α-螺旋成孔毒素是來自actinoporin蛋白家族的成員,其中所述α-螺旋成孔毒素是Fragaceatoxin C(FraC)、突變型FraC、FraC旁系同源物或FraC同系物。
2.如權利要求1所述的系統,其中所述納米孔位于第一液體介質和第二液體介質之間,其中至少一種液體介質包含分析物,并且其中所述系統可操作以檢測所述分析物的性質。
3.如前述權利要求中任一項所述的系統,其中所述系統可操作以使所述分析物遷移通過所述孔和/或在所述孔中捕獲所述分析物。
4.如前述權利要求中任一項所述的系統,其中所述系統可操作以檢測所述分析物的性質,其包括使所述納米孔經受電場,使得所述分析物與所述納米孔相互作用。
6.如權利要求4或5中任一項所述的系統,其中所述性質是分析物的電學,化學或物理性質。
7.如前述權利要求中任一項所述的系統,其中所述納米孔包含在(平面)脂質雙層中。
8.如權利要求7所述的系統,其中所述脂質雙層包含磷脂酰膽堿(PC),優選1,2-二植烷酰-sn-甘油-3-磷脂酰膽堿,或者所述脂質雙層由磷脂酰膽堿(PC),優選1,2-二植烷酰-sn-甘油-3-磷脂酰膽堿組成。
9.如前述權利要求中任一項所述的系統,其中FraC是突變型FraC。
10.如權利要求9所述的系統,其中所述突變型FraC包括所述孔的狹窄部分的帶負電荷的氨基酸殘基中的至少一個取代為中性或帶正電荷的氨基酸殘基,和/或所述孔的狹窄部分的中性氨基酸殘基中的至少一個取代為帶正電荷的氨基酸殘基。
11.如權利要求10所述的系統,其中所述突變型FraC包含第10位的突變,優選突變Asp10Arg或Asp10Lys。
12.如權利要求10-11中任一項所述的系統,其中所述突變型FraC還包含一個或多個補償性突變以恢復FraC的溶血活性,優選地,其中所述補償性突變存在于第2、9、34、52、112、150、153和/或159位,優選第159位。
13.如前述權利要求中任一項所述的系統,其包含與蛋白質親和標簽如His-標簽或Strep-標簽融合的FraC,優選在其C-末端融合。
14.用于提供權利要求1至13中任一項所述系統的方法,其包括以下步驟:
-提供來自actinoporin蛋白家族的所述α-螺旋成孔毒素的重組單體;
-使所述單體與脂質體接觸以將它們組裝成寡聚物;
-從所述脂質體中回收所述寡聚物;以及
-使所述寡聚物與可能含有鞘磷脂的脂質雙層接觸,以允許形成納米孔。
15.包括向權利要求1-13中任一項所述的系統施加電場的方法,其中包含α-螺旋成孔毒素的漏斗形納米孔位于第一導電液體介質和第二導電液體介質之間。
16.如權利要求15所述的方法,其中所述導電液體介質中的至少一種包含分析物。
17.如權利要求15或16所述的方法,其還包括在包括以下的方法中檢測所述分析物:在所述分析物與所述納米孔相互作用時測量離子電流以提供電流模式,其中所述電流模式中出現阻塞指示所述分析物的存在。
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