[發明專利]無加帽步驟的硫醇化寡核苷酸的合成有效
| 申請號: | 201780051170.4 | 申請日: | 2017-06-22 |
| 公開(公告)號: | CN109689668B | 公開(公告)日: | 2023-02-17 |
| 發明(設計)人: | 石向林;楊紀民;W·F·吉斯曼;Y·費爾倫 | 申請(專利權)人: | 比奧根MA公司 |
| 主分類號: | C07H1/00 | 分類號: | C07H1/00;C07H21/00 |
| 代理公司: | 北京市金杜律師事務所 11256 | 代理人: | 陳文平;黃海波 |
| 地址: | 美國馬*** | 國省代碼: | 暫無信息 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 無加帽 步驟 硫醇 寡核苷酸 合成 | ||
1.一種用于制備寡核苷酸的方法,所述方法包括:
a)使式(I)化合物:
與式(II)化合物:反應,以形成式(III)化合物:以及
b)用硫化劑使所述式(III)化合物硫化以形成式(IV)化合物:
以及由未反應的式(I)化合物形成式(V)化合物:
其中
每個R1和R11獨立地是核堿基,其中所述核堿基的NH2如果存在的話,受胺保護基團保護;
每個R2和R12獨立地選自由以下組成的組:H、鹵代和任選地被C1-6烷氧基取代的C1-6烷氧基;
R3是任選地包含接頭的固體載體;
Y不存在、是核苷酸或是包含2個或更多個核苷酸的寡核苷酸;
每個R4獨立地是H或與R2的烷氧基形成環;
每個R14獨立地是H或與R12的烷氧基形成環;
R15是羥基保護基團;
R16是任選地被-CN取代的C1-6烷基;
R17a和R17b獨立地是C1-6烷基;
其中(i)所述硫化劑是3-氨基-1,2,4-二噻唑-5-硫酮且RS是–C(SH)(=N)-CN;(ii)所述硫化劑是苯乙酰二硫化物且RS是-C(=O)CH2C6H5;(iii)所述硫化劑是3-(二甲基氨基-亞甲基)氨基)-3H-1,2,4-二噻唑且RS是-C(=S)NHC(=S)N=CHN(CH3)2;(iv)所述硫化劑是3H-1,2-苯并二硫醇-3-酮1,1-二氧化物且RS是并且
其中所述式(I)化合物、所述式(II)化合物、所述式(III)化合物、所述式(IV)化合物和所述式(V)化合物任選地呈藥學上可接受的鹽的形式;
其限制條件是不需要加帽步驟。
2.如權利要求1所述的方法,其還包括以下步驟:c)使所述式(IV)化合物脫保護以形成式(VI)化合物:
或其藥學上可接受的鹽。
3.如權利要求2所述的化合物,其還包括以下步驟:d)使所述式(VI)化合物與式(II)化合物反應以形成式(VII)化合物:
或其藥學上可接受的鹽;以及
e)用氧化劑使所述式(VII)化合物氧化以形成式(VIII)化合物:
4.如權利要求3所述的方法,其還包括以下步驟:f)使所述式(VIII)化合物脫保護以形成式(IX)化合物:
或其藥學上可接受的鹽。
5.如權利要求4所述的方法,其中以所述式(VI)化合物或所述式(IX)化合物開始,重復步驟a)、b)和c)n次并且重復步驟d)、e)和f)m次,其中步驟a)、b)和c)以及步驟d)、e)和f)的重復可相對于彼此以任何順序發生,其中n是至少1并且m是0、1、2、3或4;以形成式(X)或(XI)的寡核苷酸:
或其藥學上可接受的鹽;或者形成寡核苷酸,其中步驟a、b和c或步驟d、e和f的每次重復產生一些未反應的式(VI)或(IX)化合物,所述未反應的式(VI)或(IX)化合物在所述硫化步驟后與過量的硫化劑或所述硫化劑的所述副產物反應以形成式(XII)或(XIII)化合物:
其中每個X獨立地選自S或O,其限制條件是在所述式(X)、(XI)、(XII)或(XIII)化合物中,X僅4、3、2、1或0次為O。
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