[發(fā)明專利]多重優(yōu)化錯(cuò)配擴(kuò)增(MOMA)靶標(biāo)數(shù)目

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 201780040673.1
• 申請日: 2017-04-29
• 公開（公告）號: CN109661475A
• 公開（公告）日: 2019-04-19
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 青·富田·米切爾;卡爾·施塔姆
• 申請（專利權(quán)）人: 威斯康星州立大學(xué)醫(yī)學(xué)院
• 主分類號: C12Q1/6844
• 分類號: C12Q1/6844
• 代理公司: 北京集佳知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11227
• 代理人: 鄭斌;彭鯤鵬

1.評估來自對象的樣品中非天然核酸的量的方法，所述樣品包含非天然和天然核酸，所述方法包括：

針對至少6種單核苷酸變體(SNV)信息性靶標(biāo)中的每一種，用至少兩種引物對對樣品或其部分進(jìn)行基于擴(kuò)增的定量測定，其中每種引物對包含正向引物和反向引物，其中所述至少兩種引物對中的一種在引物中包含相對于所述SNV靶標(biāo)之一種等位基因的3’倒數(shù)第二位錯(cuò)配，然而包含相對于所述SNV靶標(biāo)之另一種等位基因的3’雙錯(cuò)配，并且特異性地?cái)U(kuò)增所述SNV靶標(biāo)之所述一種等位基因，并且所述至少兩種引物對中的另一種特異性地?cái)U(kuò)增所述SNV靶標(biāo)之所述另一種等位基因，

以及獲得或提供來自所述基于擴(kuò)增的定量測定的結(jié)果以確定所述樣品中非天然核酸的量。

2.權(quán)利要求1所述的方法，其中所述結(jié)果在報(bào)告中提供。

3.權(quán)利要求1或2所述的方法，其中所述方法還包括基于所述結(jié)果確定所述樣品中非天然核酸的量。

4.權(quán)利要求1或2所述的方法，其中所述結(jié)果包含所述樣品中非天然核酸的量。

5.評估來自對象的樣品中非天然核酸的量的方法，所述樣品包含非天然和天然核酸，所述方法包括：

獲得來自對所述樣品或其部分進(jìn)行的基于擴(kuò)增的定量測定的結(jié)果，其中所述測定包括針對至少6種單核苷酸變體(SNV)信息性靶標(biāo)中的每一種用至少兩種引物對擴(kuò)增所述信息性靶標(biāo)，其中每種引物對包含正向引物和反向引物，其中所述至少兩種引物對中的一種在引物中包含相對于所述SNV靶標(biāo)之一種等位基因的3’倒數(shù)第二位錯(cuò)配，然而包含相對于所述SNV靶標(biāo)之另一種等位基因的3’雙錯(cuò)配，并且特異性地?cái)U(kuò)增所述SNV靶標(biāo)的所述一種等位基因，并且所述至少兩種引物對中的另一種特異性地?cái)U(kuò)增所述SNV靶標(biāo)之所述另一種等位基因，以及

根據(jù)所述結(jié)果評估所述非天然核酸的量。

6.權(quán)利要求5所述的方法，其中所述樣品中所述非天然核酸的量基于所述基于擴(kuò)增的定量測定的結(jié)果。

7.權(quán)利要求5或6所述的方法，其中所述結(jié)果是從報(bào)告獲得。

8.前述權(quán)利要求中任一項(xiàng)所述的方法，其中所述至少兩種引物對中的所述另一種引物對在引物中也包含相對于所述SNV靶之所述另一種等位基因的3’倒數(shù)第二位錯(cuò)配，然而包含相對于所述SNV靶標(biāo)之所述一種等位基因的3’雙錯(cuò)配，并且特異性地?cái)U(kuò)增所述SNV靶標(biāo)之所述另一種等位基因。

9.前述權(quán)利要求中任一項(xiàng)所述的方法，其中所述量是所述樣品中非天然核酸的絕對值。

10.權(quán)利要求1至8中任一項(xiàng)所述的方法，其中所述量是所述樣品中非天然核酸的相對值。

11.權(quán)利要求10所述的方法，其中所述量是非天然核酸相對于天然核酸或總核酸的比例或百分比。

12.前述權(quán)利要求中任一項(xiàng)所述的方法，其中所述方法還包括獲得所述非天然核酸和/或天然核酸的基因型。

13.前述權(quán)利要求中任一項(xiàng)所述的方法，其中所述方法還包括確定所述至少6種SNV信息性靶標(biāo)。

14.前述權(quán)利要求中任一項(xiàng)所述的方法，其中所述方法還包括獲得針對所述SNV信息性靶標(biāo)中每一種的所述至少兩種引物對。

15.前述權(quán)利要求中任一項(xiàng)所述的方法，其中所述至少6種SNV信息性靶標(biāo)是至少7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31或32種SNV信息性靶標(biāo)。