[發(fā)明專利]通過分割概覽圖像來檢查分布式對象的方法

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• 申請?zhí)枺?/td>: 201780030610.8
• 申請日: 2017-03-17
• 公開（公告）號: CN109478230A
• 公開（公告）日: 2019-03-15
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 伊萬·W·席;克里斯托夫·克拉夫特;于爾根·波普
• 申請（專利權(quán)）人: 光學(xué)技術(shù)注冊協(xié)會萊布尼茲研究所
• 主分類號: G06K9/00
• 分類號: G06K9/00;G06T7/155;G06T7/136
• 代理公司: 北京集佳知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11227
• 代理人: 陳煒;李德山

通過使用分布有多個分布式對象(1)的區(qū)域(2)的概覽圖像(200)來檢查多個分布式對象(1)的方法，其中，借助于關(guān)于概覽圖像(200)的像素(201)的強(qiáng)度值(202)在預(yù)定閾值(208)的近側(cè)或遠(yuǎn)側(cè)對強(qiáng)度值(202)進(jìn)行分類(202a，202b)，將概覽圖像(200)轉(zhuǎn)換(110)為二值圖像(210)；針對小于對象(1)的結(jié)構(gòu)(219)清理(120)二值圖像(210)，使得產(chǎn)生清理后的圖像(220)；并且使清理后的圖像(220)在形態(tài)上閉合(130)，使得產(chǎn)生二值對象掩模(230)，該二值對象掩模(230)指示區(qū)域(2)中的哪些位置屬于對象(1)以及區(qū)域(2)中的哪些位置屬于無對象。一種計(jì)算機(jī)程序產(chǎn)品，其包括具有指令的機(jī)器可讀程序，當(dāng)該程序在計(jì)算機(jī)上執(zhí)行時，所述指令使計(jì)算機(jī)和與該計(jì)算機(jī)連接的任何測量設(shè)備執(zhí)行根據(jù)本發(fā)明的方法。

本發(fā)明涉及用于檢查統(tǒng)計(jì)分布在區(qū)域中的對象的方法。

背景技術(shù)

在檢查生物樣品時，研究各個細(xì)胞的屬性是必要的。這些樣品通常包括基板上細(xì)胞的統(tǒng)計(jì)分布。在可以檢查細(xì)胞之前，必須首先將細(xì)胞定位在基板上。

到目前為止，細(xì)胞已經(jīng)在視覺上定位，并且已經(jīng)手動啟動了單個細(xì)胞的局部檢查，例如拉曼光譜(Raman spectroscopy)。這是非常耗時的并且導(dǎo)致下述事實(shí)：能夠檢查僅少量細(xì)胞。檢查的細(xì)胞越多，獲得的結(jié)果的統(tǒng)計(jì)容量越好。

根據(jù)(R.Ali,M.Gooding、T.Szilgyi、B.Vojnovic、M.Christlieb、M.Brady的“Automatic segmentation of adherent biological cell boundaries and nucleifrom brightfield microscopy images”,Machine Vision and Applications 23(4),607-621,doi:10.1007/s00138-011-0337-9(2011))，根據(jù)(F.Buggenthin、C.Marr、M.Schwarzfischer、P.S.Hoppe、O.Hilsenbeck、T.Schroeder、F.J.Theis的“An automaticmethod for robust and fast cell imaging in bright field images from high-throughput microscopy”,BMC Bioinformatics 14,297-308(2013))和(C.Zhang、J.Yarkony、FA Hamprecht的Cell Detection and Segmentation Using CorrelationClustering,Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention-MICCAI2014,Lecutre Notes in Computer Science 8673,9-16(2014))，已知用于在基板上定位細(xì)胞的各種方法。

問題和解決方案

本發(fā)明的目的是進(jìn)一步開發(fā)上述方法，并且從而改進(jìn)對多個分布式對象的檢查。

該目的通過根據(jù)主權(quán)利要求的根據(jù)本發(fā)明的方法和通過根據(jù)從屬權(quán)利要求的計(jì)算機(jī)程序產(chǎn)品來實(shí)現(xiàn)。根據(jù)從屬權(quán)利要求，其他有利的實(shí)施方式將是明顯的。

發(fā)明內(nèi)容

在本發(fā)明的范圍內(nèi)，已經(jīng)開發(fā)了一種使用分布有多個分布式對象的區(qū)域的概覽圖像來檢查多個分布式對象的方法。

例如，該區(qū)域可以位于對象被應(yīng)用于的基板上。例如，對象可以是例如溶液中或作為溶劑中的懸浮液的、應(yīng)用在基板上的生物細(xì)胞，特別是真核細(xì)胞。在這樣做時，細(xì)胞可以粘附到基板上，即與基板結(jié)合，或者將僅通過弱的物理力在基板上保持就位從而保持與基板分開的單元。可選地，還可以通過對基板施加涂層來調(diào)整如何將細(xì)胞粘合到基板上。例如，聚-L-賴氨酸或聚-D-賴氨酸涂層可以使細(xì)胞不粘附到基板上和/或使細(xì)胞保持在基板上的特定位置處，盡管細(xì)胞不會粘附到那里。