[發明專利]一種分析體系內相似序列相對數量的方法

在審

• 申請號: 201711477562.5
• 申請日: 2017-12-29
• 公開（公告）號: CN108251517A
• 公開（公告）日: 2018-07-06
• 發明（設計）人: 李陽;謝先榮;王世陽
• 申請（專利權）人: 武漢艾德士生物科技有限公司
• 主分類號: C12Q1/6869
• 分類號: C12Q1/6869
• 代理公司: 南京縱橫知識產權代理有限公司 32224
• 代理人: 董建林;徐瑛

1.一種分析體系內相似序列相對數量的方法，其特征在于，包括如下步驟：將待檢測的至少兩種同源序列用一引物對進行擴增，擴增結果進行一代測序，將測序得到的峰值數據以及作為參比差異序列的所述同源序列一起提交給計算機程序進行比對，統計每個序列所有差異位點的平均強度，各序列平均信號強度的比值即代表了所述同源序列的數量比值。

2.根據權利要求1所述的一種分析體系內相似序列相對數量的方法，其特征在于，所述擴增過程對所有所述同源序列具有同樣的擴增效率。

3.根據權利要求2所述的一種分析體系內相似序列相對數量的方法，其特征在于，所述引物對與所述同源序列均為100％匹配，擴增過程選定的擴增靶標DNA中差異位點范圍為4～30個。

4.根據權利要求3所述的一種分析體系內相似序列相對數量的方法，其特征在于，所述參比差異序列為所述擴增靶標DNA中的所有同源序列。

5.根據權利要求1所述的一種分析體系內相似序列相對數量的方法，其特征在于，每次比對的所述同源序列為兩種。

6.根據權利要求1～5任一項所述的一種分析體系內相似序列相對數量的方法，其特征在于，所述計算機程序進行比對的方法包括：先根據提交的參比差異序列算出所有差異位點，記錄這些差異位點的具體堿基和在序列中的位置；然后根據這些位置信息在測序結果文件數據中找出這些位置上4種堿基的信號強度，并記錄；統計所有差異位點上不同堿基的信號強度；對每個位點的信號強度進行均一化；統計每個序列所有差異位點的平均強度，各序列平均信號強度的比值代表了起始體系中各同源序列的數量比值。