[發(fā)明專利]一種結(jié)直腸癌微生物標(biāo)志物及其應(yīng)用

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 201711450487.3
• 申請日: 2017-12-27
• 公開（公告）號: CN107904286A
• 公開（公告）日: 2018-04-13
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 穆延召;朱永亮
• 申請（專利權(quán)）人: 蘇州普瑞森基因科技有限公司
• 主分類號: C12Q1/6851
• 分類號: C12Q1/6851;C12Q1/6886;A61K45/00;A61P35/00
• 代理公司: 北京品源專利代理有限公司11332
• 代理人: 鞏克棟

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明屬于微生物領(lǐng)域，涉及一種結(jié)直腸癌微生物標(biāo)志物及其應(yīng)用。

背景技術(shù)

結(jié)直腸癌是消化道最常見的惡性腫瘤之一，全球范圍內(nèi)新增病例數(shù)約為100萬/年，死亡人數(shù)約為50萬。隨著人們生活水平的提高和飲食習(xí)慣的改變，結(jié)直腸癌已成為我國發(fā)病率增長最快的惡性腫瘤之一，每年約有14萬新患病例，占全部癌癥患者的6.8％，在惡性腫瘤中居第4位。據(jù)預(yù)測，結(jié)直腸癌將成為我國最常見的惡性腫瘤之一，其發(fā)病率與死亡率將在今后很長一段時期內(nèi)繼續(xù)上升。盡管手術(shù)、化療、放療等綜合治療手段已用于結(jié)直腸癌的治療，但是仍有25％左右的結(jié)直腸癌出現(xiàn)復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移現(xiàn)象。因此，結(jié)直腸癌的早期診斷是降低結(jié)直腸癌發(fā)病率和死亡率的有效手段。

結(jié)直腸癌的診斷方法主要包括X射線檢查、腸鏡檢查和癌胚抗原(cea)檢查。其中，癌胚抗原(cea)對早期病例的診斷價值不大，腸鏡檢查雖然準(zhǔn)確度高，但是創(chuàng)傷性較大，許多高危人群拒絕接收定期的腸鏡篩查。有研究表明，mir-92具有作為結(jié)直腸癌標(biāo)志物的潛能，但是根據(jù)血液中mir-92的含量進行結(jié)直腸癌的診斷，錯誤率高達30％。隨著人類基因組測序計劃的完成以及高通量測序技術(shù)的發(fā)展，基因篩查技術(shù)已成為一種新的結(jié)直腸癌的診斷方法，在結(jié)直腸癌的早期診斷中具有顯著的優(yōu)勢，但是由于結(jié)直腸癌在疾病早期沒有明顯癥狀，潛在患者仍然需要通過腸鏡檢查進一步確診。

因此，提供一種結(jié)直腸癌標(biāo)志物，輔助進行結(jié)直腸癌的早期診斷，具有重要意義。

發(fā)明內(nèi)容

為了解決現(xiàn)有技術(shù)的不足，本發(fā)明提供一種結(jié)直腸癌微生物標(biāo)志物及其應(yīng)用，所述結(jié)直腸癌微生物標(biāo)志物能夠較為準(zhǔn)確地確定個體是否患有結(jié)直腸癌，具有非侵入性輔助診斷結(jié)直腸癌的作用。

為達此目的，本發(fā)明采用以下技術(shù)方案：

第一方面，本發(fā)明提供了一種結(jié)直腸癌微生物標(biāo)志物，所述標(biāo)志物包括微生物，所述微生物包括牛鏈球菌(Treptococcus bovis)、腐敗梭菌(Clostridium septicum)、微單胞菌屬(Parvimonas micra)或幽門螺桿菌(Helicobacter pylori)中的任意一種或至少兩種的組合。

本發(fā)明中，通過對結(jié)直腸癌個體和健康個體的糞便樣本中微生物的豐度進行差異分析和比較，確定了牛鏈球菌(Treptococcus bovis)、腐敗梭菌(Clostridium septicum)、微單胞菌屬(Parvimonas micra)和幽門螺桿菌(Helicobacter pylori)具有作為結(jié)直腸癌標(biāo)志物的潛能，所述標(biāo)志物在結(jié)直腸癌患者的糞便樣本中的含量顯著高于在健康個體的糞便樣本中的含量，且具有統(tǒng)計學(xué)意義，能夠較為準(zhǔn)確地確定個體是否患有結(jié)直腸癌，具有非侵入性輔助診斷結(jié)直腸癌的作用。

優(yōu)選地，所述標(biāo)志物包括微生物，所述微生物包括牛鏈球菌(Treptococcus bovis)、腐敗梭菌(Clostridium septicum)、微單胞菌屬(Parvimonas micra)或幽門螺桿菌(Helicobacter pylori)中的任意一種或至少兩種的組合，例如可以是牛鏈球菌(Treptococcus bovis)、腐敗梭菌(Clostridium septicum)、微單胞菌屬(Parvimonas micra)和幽門螺桿菌(Helicobacter pylori)的組合、牛鏈球菌(Treptococcus bovis)、腐敗梭菌(Clostridium septicum)和微單胞菌屬(Parvimonas micra)的組合、牛鏈球菌(Treptococcus bovis)、腐敗梭菌(Clostridium septicum)和幽門螺桿菌(Helicobacter pylori)的組合、腐敗梭菌(Clostridium septicum)、微單胞菌屬(Parvimonas micra)和幽門螺桿菌(Helicobacter pylori)的組合、牛鏈球菌(Treptococcus bovis)和腐敗梭菌(Clostridium septicum)的組合或微單胞菌屬(Parvimonas micra)和幽門螺桿菌(Helicobacter pylori)的組合，優(yōu)選為牛鏈球菌(Treptococcus bovis)、腐敗梭菌(Clostridium septicum)、微單胞菌屬(Parvimonas micra)和幽門螺桿菌(Helicobacter pylori)的組合。

第二方面，本發(fā)明提供了一種檢測微生物豐度的方法，包括以下步驟：