[發(fā)明專利]一種結(jié)直腸癌微生物標(biāo)志物及其應(yīng)用

在審

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201711450487.3
• 申請(qǐng)日: 2017-12-27
• 公開（公告）號(hào): CN107904286A
• 公開（公告）日: 2018-04-13
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 穆延召;朱永亮
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 蘇州普瑞森基因科技有限公司
• 主分類號(hào): C12Q1/6851
• 分類號(hào): C12Q1/6851;C12Q1/6886;A61K45/00;A61P35/00
• 代理公司: 北京品源專利代理有限公司11332
• 代理人: 鞏克棟

1.一種結(jié)直腸癌微生物標(biāo)志物，其特征在于，所述標(biāo)志物包括微生物，所述微生物包括牛鏈球菌(Treptococcus bovis)、腐敗梭菌(Clostridium septicum)、微單胞菌屬(Parvimonas micra)或幽門螺桿菌(Helicobacter pylori)中的任意一種或至少兩種的組合。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的微生物標(biāo)志物，其特征在于，所述標(biāo)志物包括微生物，所述微生物包括牛鏈球菌(Treptococcus bovis)、腐敗梭菌(Clostridium septicum)、微單胞菌屬(Parvimonas micra)和幽門螺桿菌(Helicobacter pylori)的組合。

3.一種檢測(cè)微生物豐度的方法，其特征在于，包括以下步驟：

(1)從所述個(gè)體糞便樣本中提取DNA進(jìn)行測(cè)序，得到測(cè)序數(shù)據(jù)；

(2)將步驟(1)所述測(cè)序數(shù)據(jù)中的讀段組裝為組裝片段；

(3)將步驟(2)所述的組裝片段與如權(quán)利要求1所述微生物的基因組進(jìn)行比對(duì)，得到所述組裝片段的豐度；

(4)根據(jù)步驟(3)所述組裝片段的豐度，得到所述個(gè)體糞便樣本的微生物標(biāo)志物的豐度。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的方法，其特征在于，步驟(2)所述的組裝片段為非冗余序列。

5.根據(jù)權(quán)利要求3或4所述的方法，其特征在于，包括以下步驟：

(1)從所述個(gè)體糞便樣本中提取DNA進(jìn)行測(cè)序，得到測(cè)序數(shù)據(jù)；

(2)將步驟(1)所述測(cè)序數(shù)據(jù)中的讀段組裝為非冗余組裝片段；

(3)將步驟(2)所述的組裝片段與如權(quán)利要求1所述微生物的基因組進(jìn)行比對(duì)，得到所述組裝片段的豐度；

(4)根據(jù)步驟(3)所述組裝片段的豐度，得到所述個(gè)體糞便樣本的微生物標(biāo)志物的豐度。

6.一種藥物組合物，其特征在于，所述藥物組合物包括降低如權(quán)利要求1或2所述標(biāo)志物的豐度的藥物。

7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的藥物組合物，其特征在于，所述藥物包括氨基糖苷類抗生素、萬古霉素或克拉霉素中的任意一種和至少兩種的組合。

8.根據(jù)權(quán)利要求6或7所述的藥物組合物，其特征在于，所述藥物組合物還包括藥學(xué)上可接受的載體、賦形劑或稀釋劑中的任意一種或至少兩種的組合。

9.一種如權(quán)利要求1或2所述的標(biāo)志物在制備結(jié)直腸癌診斷試劑和/或結(jié)直腸癌診斷藥物中的應(yīng)用。

10.一種如權(quán)利要求6-8任一項(xiàng)所述的藥物組合物在制備治療結(jié)直腸癌藥物和/或食品中的應(yīng)用。