[發明專利]一種基于SNP位點鑒別金華豬、大白豬的方法

在審

• 申請號: 201711437581.5
• 申請日: 2017-12-26
• 公開（公告）號: CN108060236A
• 公開（公告）日: 2018-05-22
• 發明（設計）人: 龍毅;薛藝紅;萬文峰;郭永平;丁能水;吳有林
• 申請（專利權）人: 福建傲農生物科技集團股份有限公司;漳州傲農現代農業開發有限公司;泰和縣傲牧育種有限公司
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888
• 代理公司: 上海科盛知識產權代理有限公司 31225
• 代理人: 褚明偉

本發明涉及一種基于SNP位點鑒別金華豬、大白豬的方法，利用金華豬、大白豬SSC1上SNP位點的不同，對金華豬、大白豬進行鑒別，SNP名稱分別為：ASGA0001419、INRA0003914、INRA0004022、INRA0004079、CASI0011475、INRA0004304、INRA0004305、INRA0004312、H3GA0002811、ALGA0006239、H3GA0002923、INRA0004535、CASI0002714、ALGA0006955、DRGA0001617、DRGA0001667、DRGA0001709、INRA0005357、DRGA0001733、DRGA0001738，共計20個SNP位點。與現有技術相比，本發明通過選擇20個SNP位點，通過對SNP位點的測定可以便宜、快速、方便的鑒別金華豬、大白豬。

技術領域

本發明涉及動物分子生物技術及動物遺傳育種領域，尤其是涉及一種基于SNP位點鑒別金華豬、大白豬的方法。

背景技術

中國是世界上養豬最早的國家之一，歷史達幾千年之久，豬在中國被譽為六畜之首。由于自然環境、經濟條件和民俗文化的影響，中國的地方豬種資源豐富且各具特色，是世界豬種基因庫中的寶貴資源。但迄今為止，用于品種鑒定的SNP標記組合以及個體識別的SNP標記組合還很少。

隨著豬高密度SNP芯片的應用、全基因組測序技術的普及和發展，及基因分型、測序成本的不斷下降，建立基于DNA標記或全基因組序列的個體追蹤溯源技術和品種鑒定技術成為可能。

金華豬、大白豬是我國的養豬從業者對來自不同地區大白的稱呼。金華豬具有成熟早，肉質好，繁殖率高等優良性能。因其后腿皮薄骨細，肉質鮮美，肉間脂肪含量高，是腌制火腿的最佳原料。大白豬為瘦肉型豬種，其飼料轉化率和屠宰率高，適應性強。目前基于分子層面上以SNPs位點的方法來鑒別金華豬、大白豬的方法還不完善。

中國專利CN106520943A公開了一種與加系杜洛克背膘厚相關的SNP位點及其應用，是關于一個位于豬9號染色體上的CACNA1E基因內的SNP，所述CACNA1E基因的SNP位點為ALGA0055091(G/A)，該位點基因型為AA的個體比GG型的個體有更薄的背膘，在此基礎上，ALGA0055091可以作為一個SNP標記，通過對基因型的選擇，可以加快對加系杜洛克背膘厚的選擇，同時加快提高加系杜洛克的瘦肉率的遺傳進展。

中國專利CN105603089A公開了一組用于鑒別豬種的SNP標記，主要利用純種的大白、長白共200個個體作為研究對象，對上述2個品種的全部樣本進行全基因組SNP 60K芯片掃描判型；對所有數據按要求進行質控后，篩選出可以用于鑒別長白、大白的SNP標記位點，通過全基因組關聯分析篩選出16個SNP位點用于長白和大白豬的鑒別；另外通過主成分分析和聚類分析在另外500個個體中進行驗證，16個SNP位點的準確率達到了99％，表明發明的16個SNP位點可以用于大白和長白的鑒別。

中國專利CN106566887A公開了一組用于鑒別加系杜洛克、臺系杜洛克的SNP位點，這些SNP位點分別位于：SSC1、2、5、7、9、12、14、23上，SNP名稱分別為：H3GA0021245、ASGA0033017、ALGA0075620、ALGA0075780、INRA0025222、H3GA0006033、ASGA0024360、ASGA0011065、ASGA0042109、ASGA0090983、ALGA0016497、M1GA0016745、ASGA0089906、ALGA0040895、ALGA0075815、ALGA0099582、ALGA0066519、ALGA0075754、ALGA0075715、SIRI0001491共計20個SNP位點。發明的20個SNP位點能夠用于鑒別加系杜洛克、臺系杜洛克。

發明內容

本發明的目的就是為了克服上述現有技術存在的缺陷而提供一種基于SNP位點鑒別金華豬、大白豬的方法。