[發明專利]一種基于SNP位點鑒別金華豬、大白豬的方法

在審

• 申請號: 201711437581.5
• 申請日: 2017-12-26
• 公開（公告）號: CN108060236A
• 公開（公告）日: 2018-05-22
• 發明（設計）人: 龍毅;薛藝紅;萬文峰;郭永平;丁能水;吳有林
• 申請（專利權）人: 福建傲農生物科技集團股份有限公司;漳州傲農現代農業開發有限公司;泰和縣傲牧育種有限公司
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888
• 代理公司: 上海科盛知識產權代理有限公司 31225
• 代理人: 褚明偉

1.一種基于SNP位點鑒別金華豬、大白豬的方法，其特征在于，利用金華豬、大白豬SSC1上SNP位點的不同，對金華豬、大白豬進行鑒別，SNP名稱分別為：ASGA0001419、INRA0003914、INRA0004022、INRA0004079、CASI0011475、INRA0004304、INRA0004305、INRA0004312、H3GA0002811、ALGA0006239、H3GA0002923、INRA0004535、CASI0002714、ALGA0006955、DRGA0001617、DRGA0001667、DRGA0001709、INRA0005357、DRGA0001733、DRGA0001738，共計20個SNP位點。

2.根據權利要求1所述的一種基于SNP位點鑒別金華豬、大白豬的方法，其特征在于，金華豬、大白豬SSC1上SNP位點的不同，具體為：

ASGA0001419位置的C或T、INRA0003914位置的T或C、INRA0004022位置的A或G、INRA0004079位置的T或C、CASI0011475位置的C或A、INRA0004304位置的C或T、INRA0004305位置的T或C、INRA0004312位置的G或A、H3GA0002811位置的T或C、ALGA0006239位置的G或T、H3GA0002923位置的T或C、INRA0004535位置的C或T、CASI0002714位置的A或G、ALGA0006955位置的G或A、DRGA0001617位置的G或T、DRGA0001667位置的A或G、DRGA0001709位置的T或C、INRA0005357位置的C或T、DRGA0001733位置的C或A、DRGA0001738位置的G或A，共計20個SNP位點。

3.根據權利要求1所述的一種基于SNP位點鑒別金華豬、大白豬的方法，其特征在于，20個SNP位點中10個以上存在不同，則可鑒別出金華豬、大白豬。

4.根據權利要求1所述的一種基于SNP位點鑒別金華豬、大白豬的方法，其特征在于，鑒別已知的SNP位點方法為：針對該位點所在的一段基因序列設計相應的引物，再通過熒光定量PCR的方法，擴增該片段，再通過擴增結果確定該SNP位點。

5.根據權利要求4所述的一種基于SNP位點鑒別金華豬、大白豬的方法，其特征在于，SNP名稱分別為ASGA0001419、INRA0003914、INRA0004022、INRA0004079、CASI0011475、INRA0004304、INRA0004305、INRA0004312、H3GA0002811、ALGA0006239、H3GA0002923、INRA0004535、CASI0002714、ALGA0006955、DRGA0001617、DRGA0001667、DRGA0001709、INRA0005357、DRGA0001733、DRGA0001738的SNP位點，對應設計的引物序列如下：

6.根據權利要求1所述的一種基于SNP位點鑒別金華豬、大白豬的方法，其特征在于，使用The R Project for Statistical Computing對金華豬和大白豬豬進行主成分分析，其中橫坐標代表主成分1，縱坐標代表主成分2，主成分1與主成分2分別代表了同一SNP位點的不同基因型，其中橫坐標大于0的點為大白群體，橫坐標小于0的點為金華群體。