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[發明專利]一種單細胞全基因組擴增試劑盒在審

專利信息
申請號: 201711405983.7 申請日: 2017-12-22
公開(公告)號: CN108165610A 公開(公告)日: 2018-06-15
發明(設計)人: 李靜;陳昌岳;李明明;趙慧茹;鄭冠濤;路遠;胡秋萍;張祥林 申請(專利權)人: 上海美吉生物醫藥科技有限公司
主分類號: C12Q1/6844 分類號: C12Q1/6844;C12Q1/6806;C12N15/10
代理公司: 暫無信息 代理人: 暫無信息
地址: 200120 上海市浦東新區中國(上海)*** 國省代碼: 上海;31
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摘要:
搜索關鍵詞: 擴增 全基因組 錯誤率 擴增試劑盒 試劑盒 樣本 尿嘧啶核苷酸 固定樣本 優化引物 酶處理 應用 切除 檢測 拓展
【權利要求書】:

1.一種單細胞全基因組擴增試劑盒,所述試劑盒包括:細胞裂解液、細胞裂解酶、磁珠、校正酶、反應終止液、預擴增緩沖液、終擴增緩沖液。

2.如權利要求1所述的一種單細胞全基因組擴增試劑盒,其特征在于,所述細胞裂解液包括但不限于以下任一種:50mM KAc、20mM Tris-Ac、10mM MgAc、0.2%Trition X-100;1xPBS、1xThermo polbuffer、30mM Tris-HCl;10mM Tris-HCl、25mM EDTA、100mM NaCl;0.5%SDS、10mM Tris-HCl、50mM KCl;10mM Tris-HCl、100mM EDTA、0.5%SDS;30mM Tris-HCl、10mM EDTA、1%SDS;30mM Tris-HCl、2mM KCl、0.2%Triton X-100。

3.如權利要求1所述的一種單細胞全基因組擴增試劑盒,其特征在于,所述校正酶為具有DNA糖基化酶活性的酶。

4.如權利要求1所述的一種單細胞全基因組擴增試劑盒,其特征在于,所述校正酶包括但不限于以下一種或幾種:UDG酶、核酸外切酶Ⅷ、單鏈選擇性尿嘧啶-DNA糖基化酶、TU錯配DNA糖基化酶、具有甲基結合域的尿嘧啶-DNA糖基化酶。

5.如權利要求1所述的一種單細胞全基因組擴增試劑盒,其特征在于,所述反應終止液包括:尿嘧啶-糖基化酶抑制劑。

6.如權利要求1所述的一種單細胞全基因組擴增試劑盒,其特征在于,所述預擴增緩沖液包括DNA聚合酶、BSA、dNTP、DNA聚合酶、無核酸水、第一隨機引物。

7.如權利要求6所述的一種單細胞全基因組擴增試劑盒,其特征在于,所述第一隨機引物結構為:第一引物固定序列-第一引物隨機序列-第一引物三聯重復序列,其中所述第一引物固定序列如SEQ ID NO:1所示,具體為ATGACTGATCCTTGTGCTAGAGTGTAC。

8.如權利要求7所述的一種單細胞全基因組擴增試劑盒,其特征在于,所述第一引物隨機序列長度為4~20nt,優選地為4~10nt,更優選地為6~8nt。

9.如權利要求1所述的一種單細胞全基因組擴增試劑盒,其特征在于,所述終擴增緩沖液包括DNA聚合酶、BSA、dNTP、DNA聚合酶、無核酸水、第二隨機引物。

10.如權利要求9所述的一種單細胞全基因組擴增試劑盒,其特征在于,所述第二隨機引物結構為:第二引物固定序列-第二引物隨機序列-第二引物三聯重復序列,其中所述第二引物固定序列如SEQ ID NO:2所示,具為:ATGACTGATCCTTGTGCTAGAGTGTAC。

11.如權利要求10所述的一種單細胞全基因組擴增試劑盒,其特征在于,所述第二引物隨機序列長度為4~20nt,優選地為4~10nt,更優選地為6~8nt。

12.如權利要求7或10所述的一種單細胞全基因組擴增試劑盒,其特征在于,所述第一引物中的三聯重復序列為TTT,則所述第二引物中的三聯重復序列GGG;所述第一引物中的三聯重復序列為AAA,則所述第二引物中的三聯重復序列

GGG;所述第一引物中的三聯重復序列為TTT,則所述第二引物中的三聯重復序列CCC;所述第一引物中的三聯重復序列為AAA,則所述第二引物中的三聯重復序列CCC。

13.如權利要求6或9所述的一種單細胞全基因組擴增試劑盒,其特征在于,所述DNA聚合酶包括但不限于以下一種或幾種:vent DNA聚合酶、T7 DNA聚合酶、Bsu DNA聚合酶,大片段、T4 DNA聚合酶、DNA聚合酶I、(Klenow)大片段、DNA聚合酶I(E.coli)、TherminatorTMDNA聚合酶、Sulfolobus DNA聚合酶IV、phi29 DNA聚合酶、Bst2.0DNA聚合酶、Bst2.0 DNA聚合酶、Bst DNA聚合酶,全長、Bst DNA聚合酶、Deep VentRTMDNA聚合酶、VentR(exo–)DNA聚合酶、DNA聚合酶、熱啟動Taq DNA聚合酶、熱啟動Taq DNA聚合酶、Taq DNA聚合酶、熱啟動Taq DNA聚合酶、Taq DNA聚合酶大片段、Taq DNA聚合酶(提供不含鎂離子的ThermoPol II緩沖液)、Taq DNA聚合酶(提供緩沖液)、熱啟動DNA聚合酶、DNA聚合酶、熱啟動Flex DNA聚合酶、超保真DNA聚合酶、熱啟動超保真DNA聚合酶、超保真DNA聚合酶、KAPA HiFi Uracil+ReadyMix(2x)、PfuTurbo Cx熱啟動DNA聚合酶。

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