[發明專利]檢測志賀氏氏菌環介導恒溫擴增試驗引物組及其應用在審
| 申請號: | 201711377805.8 | 申請日: | 2017-12-19 |
| 公開(公告)號: | CN107904320A | 公開(公告)日: | 2018-04-13 |
| 發明(設計)人: | 溫和心;龍英全;蔣榮華 | 申請(專利權)人: | 溫和心 |
| 主分類號: | C12Q1/689 | 分類號: | C12Q1/689;C12Q1/6844;C12Q1/10;C12N15/11;C12R1/01 |
| 代理公司: | 廣州市深研專利事務所44229 | 代理人: | 陳雅平 |
| 地址: | 537100 廣西壯*** | 國省代碼: | 廣西;45 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 檢測 志賀氏氏菌環介導 恒溫 擴增 試驗 引物 及其 應用 | ||
1.檢測志賀氏菌環介導恒溫擴增試驗引物組,其特征在于,所述引物組的核苷酸序列分別如下所示:
引物組A:
上游外引物F3_A:5’- gaagagcatg ccaacacct-3’(SEQ ID NO:1);
下游外引物B3_A:5’- tcctcacagc tctcagtgg-3’(SEQ ID NO:2);
上游內引物FIP_A:5’- cggaatccgg aggtattgcg ttttccgcgt tccttgacc -3’(SEQ ID NO:3);
下游內引物BIP_A:5’- cgctgcatgg ctggaaaaac tcgcagcaac agcgaaagac t -3’(SEQ ID NO:4);
引物組B:
上游外引物F3_B:5’- ggtcatttgc tgtcactcc-3’(SEQ ID NO:5);
下游外引物B3_B:5’- ctgggcaggg aaatgttc-3’(SEQ ID NO:6);
上游內引物FIP_B:5’- gctcgcagag aaacttcagc tcgacacgcc atagaaacg-3’(SEQ ID NO:7);
下游內引物BIP_B:5’- tggtctggaa ggccaggtag cattgcccgg gataaagtc-3’(SEQ ID NO:8)。
2.一種檢測志賀氏菌的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包含如權利要求1所述的引物組。
3.根據權利要求2所述的試劑盒,其特征在于,還包括作為陽性對照的小志賀氏菌的基因組DNA,作為陰性對照的不含DNA的環介導恒溫擴增體系,如雙蒸水。
4.如權利要求2或3所述的試劑盒,其特征在于,包括BstDNA聚合酶緩沖液、Bst DNA聚合酶、dNTPs、MgSO4和Betaine。
5.一種檢測志賀氏菌的方法,其特征在于,包括以下步驟:
(1)提取待測菌的基因組DNA;
(2)以提取的基因組DNA為模板,使用如權利要求1所述引物組進行環介導恒溫擴增;
(3)通過判斷反應結果是否為陽性,確定待測樣品中是否存在志賀氏菌。
6.根據權利要求5所述的方法,其特征在于,所述步驟(2)中的環介導恒溫擴增的反應程序為:
(1)90~98℃熱水浴0.5~3min;
(2)50℃水浴反應0.5~3min;
(3)63℃水浴反應0.5~2h;
(4)80℃水浴終止反應1~8min。
7.根據權利要求5所述的方法,其特征在于,所述步驟(2)中L環介導恒溫擴增的反應體系中MgSO4的終濃度為 2.5~5 mM/L,dNTPs的終濃度為1mM~4mM/L,F3和B3引物的終濃度為0.05μM/L ~0.5μM/L,FIP和BIP引物的終濃度為0.5~1μM/L,Bst DNA聚合酶的終濃度為0.2~2 U/μL,Betaine的終濃度為0.5~3 M/L。
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