[發明專利]一種可視化生物信息分析流程的調試方法及系統

在審

• 申請號: 201711376957.6
• 申請日: 2017-12-19
• 公開（公告）號: CN108171013A
• 公開（公告）日: 2018-06-15
• 發明（設計）人: 孫懷立;薛凱;吳延安
• 申請（專利權）人: 北京榮之聯科技股份有限公司
• 主分類號: G06F19/26
• 分類號: G06F19/26
• 代理公司: 北京風雅頌專利代理有限公司 11403
• 代理人: 朱親林

本發明公開了一種可視化生物信息分析流程的調試方法及系統，方法包括：獲取生物信息分析流程所需信息要素，并且構建一個可視化生物信息分析系統；接收用戶的選取指令，在生物信息分析流程的不同節點選取相應的代碼進行調試；獲取流程調試的參數信息，并且接收用戶通過form表單在參數設置模塊輸入的相關參數信息；基于分析系統的創建與參數信息對應的流程；接收用戶的調試指令，并且使得調試模塊根據調試指令的不同，相應的使得創建的流程執行開始調試、暫停、重試、取消一系列操作。所述可視化生物信息分析流程的調試方法及系統將調試過程通過可視化方式展示出來并且提高整個調試過程的準確性和效率。

技術領域

本發明涉及計算機程序開發管理相關領域，特別是指一種可視化生物信息分析流程的調試方法及系統。

背景技術

隨著基因檢測的技術日漸成熟，相應的生物信息分析技術正漸漸從實驗室走向商業化、工程化。在現有的技術中，多采用工作人員寫腳本的方式去進行相關分析流程的調試，這樣不僅會對生物信息分析人員要求比較高，必須要了解編程方面的技術，而且在具體操作時也很不方便，效率較低，具體體現如下：

首先，生物信息分析人員在進行流程的調試過程中，針對調試進度不能一目了然的查看，如果調試流程與設計流程的設計員不是同一個人的話，流程稍微復雜點，調試人員就不可能了解流程的相關進度，不僅無法快速有效實現調試，而且容易出現錯誤。其次，生信人員在采用寫流程腳本的方式進行調試過程中，有可能因為參數設置的不合理等因素，需要暫停流程，調整完參數之后需要從中間某一個環節繼續開始調試，面對這種情況，生信人員需要不斷的調整程序腳本；而這種方式，流程并沒有記錄執行過哪些節點，生信人員要很清楚的了解這個流程以及目前流程運行情況，這樣會很消耗生信人員的心智，而且很容易犯錯。

因此，在實現本申請發熱過程中，發明人發現現有技術至少存在以下缺陷：當前對于生物信息分析流程的調試難以做到高效、準確以及可視化，同時對于調試人員具有很高的業務要求，調試過程效率低下。

發明內容

有鑒于此，本發明的目的在于提出一種可視化生物信息分析流程的調試方法及系統，將調試過程通過可視化方式展示出來并且提高整個調試過程的準確性和效率。

基于上述目的本發明提供的可視化生物信息分析流程的調試方法，包括：

獲取生物信息分析流程所需信息要素，并且基于獲取的信息要素構建一個可視化生物信息分析系統；其中，所述生物信息分析系統包含可視化調試界面、參數設置模塊以及調試模塊；

接收用戶的選取指令，在所述可視化調試界面中包含的生物信息分析流程的不同節點選取相應的代碼進行調試；

獲取流程調試的參數信息，并且接收用戶通過form表單在參數設置模塊輸入的相關參數信息；

基于可視化生物信息分析系統創建與用戶輸入的參數信息對應的流程；

接收用戶的調試指令，并且使得調試模塊根據調試指令的不同，相應的使得創建的流程執行開始調試、暫停、重試、取消一系列操作。

可選的，所述接收用戶的調試指令，并且根據調試指令的不同，相應的使得創建的流程執行開始調試、暫停、重試、取消一系列操作包括：

接收用戶發出的開始調試指令使得生物信息分析流程啟動調試過程；

實時獲取當前可視化調試界面中顯示的信息以及相應的分析結果；并相應的判斷當前調試狀況是否需要暫停；

若需要暫停，則用戶發出暫停指令，相應的調節參數并且發出重試指令繼續進行調試過程；

若不需要暫停，則繼續運行直到運行結束。

可選的，還包括：基于所述可視化調試界面以及生物信息分析流程的執行相應的記錄每個流程執行的節點以及用戶執行的操作信息；