[發明專利]一種可視化生物信息分析流程的調試方法及系統

在審

• 申請號: 201711376957.6
• 申請日: 2017-12-19
• 公開（公告）號: CN108171013A
• 公開（公告）日: 2018-06-15
• 發明（設計）人: 孫懷立;薛凱;吳延安
• 申請（專利權）人: 北京榮之聯科技股份有限公司
• 主分類號: G06F19/26
• 分類號: G06F19/26
• 代理公司: 北京風雅頌專利代理有限公司 11403
• 代理人: 朱親林

1.一種可視化生物信息分析流程的調試方法，其特征在于，包括：

獲取生物信息分析流程所需信息要素，并且基于獲取的信息要素構建一個可視化生物信息分析系統；其中，所述生物信息分析系統包含可視化調試界面、參數設置模塊以及調試模塊；

接收用戶的選取指令，在所述可視化調試界面中包含的生物信息分析流程的不同節點選取相應的代碼進行調試；

獲取流程調試的參數信息，并且接收用戶通過form表單在參數設置模塊輸入的相關參數信息；

基于可視化生物信息分析系統創建與用戶輸入的參數信息對應的流程；

接收用戶的調試指令，并且使得調試模塊根據調試指令的不同，相應的使得創建的流程執行開始調試、暫停、重試、取消一系列操作。

2.根據權利要求1所述的調試方法，其特征在于，所述接收用戶的調試指令，并且根據調試指令的不同，相應的使得創建的流程執行開始調試、暫停、重試、取消一系列操作包括：

接收用戶發出的開始調試指令使得生物信息分析流程啟動調試過程；

實時獲取當前可視化調試界面中顯示的信息以及相應的分析結果；并相應的判斷當前調試狀況是否需要暫停；

若需要暫停，則用戶發出暫停指令，相應的調節參數并且發出重試指令繼續進行調試過程；

若不需要暫停，則繼續運行直到運行結束。

3.根據權利要求1所述的調試方法，其特征在于，還包括：基于所述可視化調試界面以及生物信息分析流程的執行相應的記錄每個流程執行的節點以及用戶執行的操作信息；

當用戶執行重試或者暫停流程時，能夠基于記錄的節點信息使得用戶能夠基于該節點繼續調試或者基于用戶選取不同的節點進行重新開始調試過程。

4.根據權利要求1所述的調試方法，其特征在于，所述生物信息分析流程進行調試的過程還包括：

接收用戶的關聯指令，將采樣器工具關聯到相應的流程節點上；

采樣器工具自動與該節點建立關聯關系，并且與該節點形成預設的文件輸入輸出關系；

采樣器工具將該節點中的流程文件按照預設的規則進行截取，并且使得截取后的文件作為該節點的運行文件。

5.根據權利要求1所述的調試方法，其特征在于，所述生物信息分析流程進行調試的過程還包括：

接收用戶的關聯指令，將文件查看器工具關聯到相應的流程節點上；

文件查看器工具基于預設的關聯指令與當前節點建立文件條用查看關系；

接收用戶的點擊查看指令，文件查看器工具從當前節點中獲取該節點在流程運行過程中產生的文件并且展示給用戶。

6.根據權利要求1所述的調試方法，其特征在于，所述生物信息分析流程進行調試的過程還包括：

接收用戶的關聯指令，將通知工具關聯到相應的流程節點上；

通知工具基于預設的關聯指令與當前節點建立監聽關聯指令，對當前節點的運行狀態按照預設的指令進行實時監聽；

當當前節點出現運行結束或者預設的監聽狀態時，向指定的賬號發送相應的通知信息。