[發(fā)明專利]一種可視化生物信息分析流程的調(diào)試方法及系統(tǒng)

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• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201711376957.6
• 申請(qǐng)日: 2017-12-19
• 公開（公告）號(hào): CN108171013A
• 公開（公告）日: 2018-06-15
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 孫懷立;薛凱;吳延安
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 北京榮之聯(lián)科技股份有限公司
• 主分類號(hào): G06F19/26
• 分類號(hào): G06F19/26
• 代理公司: 北京風(fēng)雅頌專利代理有限公司 11403
• 代理人: 朱親林

1.一種可視化生物信息分析流程的調(diào)試方法，其特征在于，包括：

獲取生物信息分析流程所需信息要素，并且基于獲取的信息要素構(gòu)建一個(gè)可視化生物信息分析系統(tǒng)；其中，所述生物信息分析系統(tǒng)包含可視化調(diào)試界面、參數(shù)設(shè)置模塊以及調(diào)試模塊；

接收用戶的選取指令，在所述可視化調(diào)試界面中包含的生物信息分析流程的不同節(jié)點(diǎn)選取相應(yīng)的代碼進(jìn)行調(diào)試；

獲取流程調(diào)試的參數(shù)信息，并且接收用戶通過form表單在參數(shù)設(shè)置模塊輸入的相關(guān)參數(shù)信息；

基于可視化生物信息分析系統(tǒng)創(chuàng)建與用戶輸入的參數(shù)信息對(duì)應(yīng)的流程；

接收用戶的調(diào)試指令，并且使得調(diào)試模塊根據(jù)調(diào)試指令的不同，相應(yīng)的使得創(chuàng)建的流程執(zhí)行開始調(diào)試、暫停、重試、取消一系列操作。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的調(diào)試方法，其特征在于，所述接收用戶的調(diào)試指令，并且根據(jù)調(diào)試指令的不同，相應(yīng)的使得創(chuàng)建的流程執(zhí)行開始調(diào)試、暫停、重試、取消一系列操作包括：

接收用戶發(fā)出的開始調(diào)試指令使得生物信息分析流程啟動(dòng)調(diào)試過程；

實(shí)時(shí)獲取當(dāng)前可視化調(diào)試界面中顯示的信息以及相應(yīng)的分析結(jié)果；并相應(yīng)的判斷當(dāng)前調(diào)試狀況是否需要暫停；

若需要暫停，則用戶發(fā)出暫停指令，相應(yīng)的調(diào)節(jié)參數(shù)并且發(fā)出重試指令繼續(xù)進(jìn)行調(diào)試過程；

若不需要暫停，則繼續(xù)運(yùn)行直到運(yùn)行結(jié)束。

3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的調(diào)試方法，其特征在于，還包括：基于所述可視化調(diào)試界面以及生物信息分析流程的執(zhí)行相應(yīng)的記錄每個(gè)流程執(zhí)行的節(jié)點(diǎn)以及用戶執(zhí)行的操作信息；

當(dāng)用戶執(zhí)行重試或者暫停流程時(shí)，能夠基于記錄的節(jié)點(diǎn)信息使得用戶能夠基于該節(jié)點(diǎn)繼續(xù)調(diào)試或者基于用戶選取不同的節(jié)點(diǎn)進(jìn)行重新開始調(diào)試過程。

4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的調(diào)試方法，其特征在于，所述生物信息分析流程進(jìn)行調(diào)試的過程還包括：

接收用戶的關(guān)聯(lián)指令，將采樣器工具關(guān)聯(lián)到相應(yīng)的流程節(jié)點(diǎn)上；

采樣器工具自動(dòng)與該節(jié)點(diǎn)建立關(guān)聯(lián)關(guān)系，并且與該節(jié)點(diǎn)形成預(yù)設(shè)的文件輸入輸出關(guān)系；

采樣器工具將該節(jié)點(diǎn)中的流程文件按照預(yù)設(shè)的規(guī)則進(jìn)行截取，并且使得截取后的文件作為該節(jié)點(diǎn)的運(yùn)行文件。

5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的調(diào)試方法，其特征在于，所述生物信息分析流程進(jìn)行調(diào)試的過程還包括：

接收用戶的關(guān)聯(lián)指令，將文件查看器工具關(guān)聯(lián)到相應(yīng)的流程節(jié)點(diǎn)上；

文件查看器工具基于預(yù)設(shè)的關(guān)聯(lián)指令與當(dāng)前節(jié)點(diǎn)建立文件條用查看關(guān)系；

接收用戶的點(diǎn)擊查看指令，文件查看器工具從當(dāng)前節(jié)點(diǎn)中獲取該節(jié)點(diǎn)在流程運(yùn)行過程中產(chǎn)生的文件并且展示給用戶。

6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的調(diào)試方法，其特征在于，所述生物信息分析流程進(jìn)行調(diào)試的過程還包括：

接收用戶的關(guān)聯(lián)指令，將通知工具關(guān)聯(lián)到相應(yīng)的流程節(jié)點(diǎn)上；

通知工具基于預(yù)設(shè)的關(guān)聯(lián)指令與當(dāng)前節(jié)點(diǎn)建立監(jiān)聽關(guān)聯(lián)指令，對(duì)當(dāng)前節(jié)點(diǎn)的運(yùn)行狀態(tài)按照預(yù)設(shè)的指令進(jìn)行實(shí)時(shí)監(jiān)聽；

當(dāng)當(dāng)前節(jié)點(diǎn)出現(xiàn)運(yùn)行結(jié)束或者預(yù)設(shè)的監(jiān)聽狀態(tài)時(shí)，向指定的賬號(hào)發(fā)送相應(yīng)的通知信息。