[發明專利]一種檢測miRNA?122的熒光生物傳感器及其制備方法和應用在審
| 申請號: | 201711324321.7 | 申請日: | 2018-02-02 |
| 公開(公告)號: | CN107828859A | 公開(公告)日: | 2018-03-23 |
| 發明(設計)人: | 王玉;張雪;劉素;黃加棟 | 申請(專利權)人: | 濟南大學 |
| 主分類號: | C12Q1/6825 | 分類號: | C12Q1/6825;C12Q1/682;C12Q1/6883;C12Q1/6886 |
| 代理公司: | 濟南泉城專利商標事務所37218 | 代理人: | 李桂存 |
| 地址: | 250022 山東*** | 國省代碼: | 山東;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 檢測 mirna 122 熒光 生物 傳感器 及其 制備 方法 應用 | ||
1.一種檢測miRNA-122的熒光生物傳感器,其特征在于,包括以下成分:發夾探針,輔助探針,分子信標,環形模板,phi29聚合酶,Nt.BbvCI酶,dNTPs和緩沖液;
所述發夾探針的序列如SEQ No. 1所示;
輔助探針的序列如SEQ No. 2所示;
分子信標的序列如SEQ No. 3所示,其5’端和3’端分別修飾有熒光基團和相應熒光猝滅基團;所述熒光基團優選為6-羧基熒光素(FAM),所述相應熒光猝滅基團優選為4-(4’-二甲基氨基偶氮苯基)苯甲酸(Dabcyl);
所述環形模板為單鏈環形DNA,序列如SEQ No. 4所示,其5’端修飾有磷酸基團;
所述miRNA-122的序列如SEQ No.5所示。
2.根據權利要求1所述的熒光生物傳感器,其特征在于,所述環形模板采用以下方法制備:
(1)將掛鎖探針與連接探針在T4 DNA連接酶緩沖液中雜交,然后加入T4 DNA連接酶低溫下反應,然后滅活T4 DNA連接酶;
(2)上述體系中加入核酸外切酶Ⅰ和核酸外切酶Ⅲ反應,然后滅活核酸外切酶Ⅰ和核酸外切酶Ⅲ,純化后得環形模板;
所述掛鎖探針的序列如SEQ No. 4所示,其5’端修飾有磷酸基團;連接探針的序列如SEQ No. 6所示。
3.根據權利要求2所述熒光生物傳感器,其特征在于,T4 DNA連接酶的反應溫度為16-20℃,反應時間為12-20h。
4.根據權利要求2所述熒光生物傳感器,其特征在于,所述步驟(1)和(2)中滅活酶的步驟為高溫滅活。
5.根據權利要求2所述熒光生物傳感器,其特征在于,所述純化的步驟為以乙醇或異丙醇沉淀后離心,棄沉淀,上清即環形模板;加入量優選為步驟(2)液體體系的1體積倍;乙醇濃度優選為70-90%(v/v)。
6.一種利用如權利要求1-4任一所述的熒光生物傳感器檢測miRNA-122的方法,其特征在于,包括以下步驟:
(a)將發夾探針,輔助探針,10×NEBuffer 2,dNTPs,環形模板,分子信標,phi29 DNA聚合酶和Nb.BbvCI酶加入EP管中,再加入待測液或miRNA-122系列濃度標準溶液進行反應;
(b)高溫滅活酶;
(c)熒光檢測和計算:進行熒光檢測,根據miRNA-122系列濃度標準溶液的熒光強度計算溶液濃度常用對數-熒光強度回歸曲線和回歸方程,計算待測液中miRNA-122濃度。
7.根據權利要求6所述的方法,其特征在于,步驟(a)中反應條件為37℃下1-2h。
8.根據權利要求6所述的方法,其特征在于,發夾探針的終濃度為1nM-200nM,分子信標的終濃度為1μM -4μM,環形模板的終濃度為10 nM。
9.根據權利要求6所述的方法,其特征在于,步驟(c)中熒光檢測的條件為:激發波長486nm,發射波長518nm,檢測波長范圍496nm-600 nm。
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