[發(fā)明專利]一種采用軟件自動識別的細(xì)胞計數(shù)方法

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201711314308.3
• 申請日: 2017-12-12
• 公開（公告）號: CN108171683B
• 公開（公告）日: 2021-12-14
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 何加銘
• 申請（專利權(quán)）人: 杭州鍵一生物科技有限公司
• 主分類號: G06T7/00
• 分類號: G06T7/00;G06T7/11;G06T7/66;G06T5/00;G06T5/40
• 代理公司: 寧波甬致專利代理有限公司 33228
• 代理人: 潘李亮

本發(fā)明涉及細(xì)胞技術(shù)領(lǐng)域，尤其涉及一種采用軟件自動識別的細(xì)胞計數(shù)方法，它包括以下步驟：通過采集圖像；圖像增強(qiáng)；均值偏移分割，然后進(jìn)行漫水填充；進(jìn)行并查集算法進(jìn)行統(tǒng)計；進(jìn)行g(shù)raph?based算法進(jìn)行處理；進(jìn)行初步篩選；得到支持向量機(jī)模型；通過支持向量機(jī)模型進(jìn)行訓(xùn)練；進(jìn)行二次篩選；最后得到圖像中細(xì)胞的數(shù)量。這種計數(shù)方法計數(shù)準(zhǔn)確性較高且計數(shù)方便。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及細(xì)胞技術(shù)領(lǐng)域，尤其涉及一種采用軟件自動識別的細(xì)胞計數(shù)方法。

背景技術(shù)

顯微鏡拍攝出來的圖像中包括大量的細(xì)胞，現(xiàn)有技術(shù)對這種圖像中的細(xì)胞進(jìn)行計數(shù)有兩種形式，一種是通過人工計數(shù)的，但是因為細(xì)胞數(shù)量較多，而且分布不均勻，所以計數(shù)麻煩，比較耗費人力；還有一種是通過計算機(jī)進(jìn)行分析，但是因為圖像中細(xì)胞多而且復(fù)雜，所以計算準(zhǔn)確性較低。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明所要解決的技術(shù)問題是：提供一種計數(shù)準(zhǔn)確性較高且計數(shù)方便的采用軟件自動識別的細(xì)胞計數(shù)方法。

本發(fā)明所采用的技術(shù)方案是：一種采用軟件自動識別的細(xì)胞計數(shù)方法，它包括以下步驟：

S1、采集圖像；

S2、對采集到的圖像進(jìn)行圖像增強(qiáng)；

S3、將增強(qiáng)后的圖像進(jìn)行均值偏移分割，然后進(jìn)行漫水填充；

S4、將填充后的圖像使用并查集算法進(jìn)行統(tǒng)計，得到每個連通塊的坐標(biāo)，然后篩選出內(nèi)部像素點數(shù)量大于X的連通塊，將篩選出來的連通塊的坐標(biāo)映射到步驟S2中增強(qiáng)后的圖像上；

S5、將映射完后的圖像進(jìn)行g(shù)raph-based算法進(jìn)行處理，并再次用并查集算法進(jìn)行統(tǒng)計得到每個連通塊的坐標(biāo)；

S6、計算每個連通塊的自身尺寸，然后根據(jù)細(xì)胞的實際大小進(jìn)行初步篩選；

S7、對初步篩選完的圖像中每一個連通塊求Hu不變矩7個特征，然后組成n*7向量作為數(shù)據(jù),進(jìn)行k-means聚類，然后得到支持向量機(jī)模型；

S8、將步驟S6初步篩選完后得到的圖像通過步驟S7得到的支持向量機(jī)模型進(jìn)行訓(xùn)練；

S9、將步驟S8得到的圖像剔除干擾顏色區(qū)域，然后再進(jìn)行二次篩選；

S10、求出二次篩選后圖像中剩余的連通塊數(shù)量，然后即得到圖像中細(xì)胞的數(shù)量。

步驟S2圖像增強(qiáng)主要采用平滑加拉普拉斯算子方法與直方圖均衡化方法。

步驟S6主要包括以下步驟：

S61、去除連通塊中尺寸較大或者較小的連通塊；

S62、去除連通塊周長與尺寸比例不符合預(yù)設(shè)條件的連通塊。

步驟S6還包括以下步驟：

S63、去除連通塊尺寸與外接矩形框比例不符合預(yù)設(shè)條件的連通塊；

S64、去除連通塊外接矩形框長和寬比例不符合預(yù)設(shè)條件的連通塊。

步驟S9中的二次篩選是指去除連通塊周長與尺寸比例不符合預(yù)設(shè)條件的區(qū)域。

步驟S10具體包括以下步驟：

S101、求出二次篩選后圖像中剩余的連通塊的質(zhì)心；

S102、計算質(zhì)心之間的相互距離，然后去除質(zhì)心距離小于Y的兩個質(zhì)心的其中一個；

S103、計算剩余質(zhì)心的數(shù)量，即得到圖像中細(xì)胞的數(shù)量。

步驟S102具體包括以下步驟：